基于转录组学和蛋白组学的木薯新种质创建的基础研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    30960203
  • 项目类别：
    地区科学基金项目
  • 资助金额：
    40.0万
  • 负责人：
    陈保善
  • 依托单位：
    广西大学
  • 学科分类：
    C1306.作物种质资源学
  • 结题年份：
    2012
  • 批准年份：
    2009
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

木薯已成为广西生物质能源开发中最重要的作物，但单产低和鲜薯淀粉含量低制约了广西木薯产业的发展。目前国内外对于控制木薯产量和淀粉含量性状的分子遗传学研究仍非常缺乏。本项目拟通过分析低产与高产及高粉与低粉两对重要生物学性状在生理学、基因转录组学和蛋白组学上的相关性，试图发现控制木薯高产及高粉形成的关键代谢途径和关键基因，为今后木薯高产优质分子育种提供理论依据和基因资源。

结项摘要

高淀粉含量木薯品系辐选01是低淀粉含量品种华南124的辐照突变体。以这对品种（品系）为研究材料，对正常栽培条件下木薯块根膨大期的叶、茎、块根的转录组和蛋白组以及生理学特性进行综合分析，获得以下结果：.1.转录组学：采用Solexa测序，获得块根膨大期的华南124块根组织2.73G，茎组织4.60G和叶组织 4.61G的转录组数据以及辐选01块根组织2.76G，茎组织3.58G和叶组织 3.83G的转录组数据。全部数据聚类后得到12995个UniGene簇。所注释的unigene参与2134个代谢通路，其中有31个代谢通路与淀粉合成代谢相关。通过代谢途径重构，鉴定出木薯中12个与淀粉和蔗糖代谢相关的酶。有903个基因在辐选01和华南124中呈差异表达，其中有42个与淀粉和糖类合成代谢相关。.2. 差异蛋白质组学：用二维电泳凝胶（2DE）对华南124和辐选01进行蛋白质平行分析。在块根形成期的块根组织中，辐选01和华南124二者有63个差异点；在叶片组织中，二者有6个差异点；在茎组织中，二者有32个差异点。用质谱法共鉴定出59种差异表达蛋白。在块根膨大期的块根组织中，辐选01和华南124二者有差异蛋白点86个；在叶片组织中，二者有差异蛋白点22个；在茎组织中，二者有差异点蛋白24个。用质谱法共鉴定出65种差异表达蛋白。.3. 生理学指标：在块根形成之后，辐选01根中的蔗糖含量比华南124的显著降低，而辐选01根中的蔗糖合成酶的活性则比华南124高。.4. 转录组-蛋白组-生理组关联分析：块根形成之后辐选01根中的蔗糖含量显著低于华南124，这与根中蔗糖合成酶较高的活性相吻合。同时，负责将蔗糖转化为呋喃果糖和alpha-6-磷酸葡萄糖的呋喃果糖苷酶在辐选01根中的表达量要明显低于华南124，暗示根中蔗糖合成酶的活性较高及蔗糖在根中的分解速度较慢可能是导致辐选01块根淀粉高积累的原因之一。块根形成之后，辐选01块根的淀粉分支酶活性显著高于华南124，表明辐选01在将蔗糖转化为淀粉上效率更高。由于从转录组和差异蛋白组数据中并没有看到辐选01块根淀粉分支酶过量表达的迹象，推测辐选01块根淀粉分支酶的单位酶活高于华南124。.

项目成果

期刊论文数量（1）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
高质量木薯根、茎、叶总RNA和总蛋白样品的制备方法
  • DOI：
    10.5376/mpb.cn.2011.09.0067
  • 发表时间：
    2011-05
  • 期刊：
    分子植物育种
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    施涯邻;王金子;王志强;蒙姣荣;罗兴录;陈保善
  • 通讯作者：
    陈保善

数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI：
    {{ item.doi || "--"}}
  • 发表时间：
    {{ item.publish_year || "--" }}
  • 期刊：
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子：
    {{ item.factor || "--"}}
  • 作者：
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者：
    {{ item.author }}

数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ patent.updateTime }}

其他文献

受低毒病毒调控的板栗疫病菌总蛋白质组学
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2014
  • 期刊：
    微生物学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    卢立丹;杨彦彦;陈琦;陈保善
  • 通讯作者：
    陈保善
大规模板栗疫病菌cDNA文库的特征和冗余序列的排除。
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    广西农业生物科学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    吴晓松;商巾杰;陈保善
  • 通讯作者：
    陈保善
板栗疫病菌RasGAP基因的功能研究
  • DOI：
    10.13417/j.gab.038.004504
  • 发表时间：
    2019
  • 期刊：
    基因组学与应用生物学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    李洋;林榆淞;李永兵;陈保善;李茹
  • 通讯作者：
    李茹
甘蔗机械收获后糖损失的影响因素分析
  • DOI：
    10.13570/j.cnki.scc.2020.01.004
  • 发表时间：
    2020
  • 期刊：
    中国糖料
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    彭娜;姚姿婷;黄江峰;陈保善;张木清
  • 通讯作者：
    张木清
桑脉带相关病毒RT-LAMP检测方法的建立
  • DOI：
    10.16688/j.zwbh.2018063
  • 发表时间：
    2019
  • 期刊：
    植物保护
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    吴凡;李杨秀;黄海娟;陈保善;蒙姣荣
  • 通讯作者：
    蒙姣荣

其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI：
    {{ item.doi || "--" }}
  • 发表时间：
    {{ item.publish_year || "--"}}
  • 期刊：
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子：
    {{ item.factor || "--" }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者：
    {{ item.author }}
empty
内容获取失败，请点击重试
重试联系客服
title开始分析
查看分析示例
此项目为已结题，我已根据课题信息分析并撰写以下内容，帮您拓宽课题思路：

AI项目思路

AI技术路线图

陈保善的其他基金

甘蔗抗黑穗病的分子基础及其调控机制
  • 批准号：
  • 批准年份：
    2020
  • 资助金额：
    58 万元
  • 项目类别：
    面上项目
bE2-bW1复合体调控甘蔗黑穗病菌丝状生长的机制
  • 批准号：
    31872635
  • 批准年份：
    2018
  • 资助金额：
    59.0 万元
  • 项目类别：
    面上项目
低毒病毒侵染对板栗疫病菌线粒体机能的影响
  • 批准号：
    31370173
  • 批准年份：
    2013
  • 资助金额：
    80.0 万元
  • 项目类别：
    面上项目
分泌蛋白与板栗疫病菌毒力的关系
  • 批准号：
    31170137
  • 批准年份：
    2011
  • 资助金额：
    65.0 万元
  • 项目类别：
    面上项目
低毒病毒的宿主因子基因和靶基因的克隆及其功能研究
  • 批准号：
    30130020
  • 批准年份：
    2001
  • 资助金额：
    150.0 万元
  • 项目类别：
    重点项目

相似国自然基金

{{ item.name }}
  • 批准号：
    {{ item.ratify_no }}
  • 批准年份：
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额：
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别：
    {{ item.project_type }}

相似海外基金

{{ item.name }}
{{ item.translate_name }}
  • 批准号：
    {{ item.ratify_no }}
  • 财政年份：
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额：
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别：
    {{ item.project_type }}
{{ showInfoDetail.title }}

作者：{{ showInfoDetail.author }}

知道了

AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
关闭
close
客服二维码