基于TGF-β信号转导网络的结直肠癌易感基因筛选与功能研究

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基本信息

  • 批准号：
    81171878
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    60.0万
  • 负责人：
    缪小平
  • 依托单位：
    华中科技大学
  • 学科分类：
    H1801.肿瘤病因
  • 结题年份：
    2015
  • 批准年份：
    2011
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2012-01-01 至2015-12-31

项目摘要

TGF-β信号转导网络广泛参与细胞的生长、分化和凋亡等多个生物学过程，在结直肠癌的发生发展过程中起重要作用。我们首先采用多中心两阶段大规模的关联研究策略，对TGF-β信号转导网络关键基因的遗传变异与结直肠癌发生发展的关系进行全面分析，重点探讨基因-基因、基因-环境相互作用对疾病易感性的影响；同时对发现的与结直肠癌易感性相关的遗传变异进行生物学机制的深入探讨，尤其是位于非编码区域，具有潜在调控功能的和具有基因-基因交互作用的遗传变异的分子机制。本研究将进一步加深对TGF-β信号转导网络与结直肠癌病因之间关系的认识，具有一定的理论意义。所识别的与结直肠癌发病相关的遗传变异可作为遗传标记物用于高风险个体的筛查和肿瘤的预后监测。

结项摘要

本研究生物信息学和分子流行病学技术和方法，系统阐述TGFβ信号网络基因遗传变异在中国人群结直肠癌发生发展中的作用，重点探讨基因-基因、基因-环境相互作用对结直肠癌易感性的影响。本研究发现SMAD7 rs11874392, TGFβR1 rs10988706和rs6478972等遗传变异显著增加了结直肠癌的发病风险。同时发现，SMAD7 rs11874392, TGFβR1 rs10988706和rs6478972遗传变异与吸烟交互作用显著增加结直肠癌发病风险，此外，在TGF-β信号通路基因中，miRNA靶结合位点上的遗传变异ACVR1 rs12997也可能与结直肠癌发病风险相关。最后我们还发现TGFβR2 rs77727333低频遗传变异显著降低结直肠癌发病风险。本研究阐明TGFβ信号网络基因常见和低频遗传变异与中国人群结直肠癌遗传易感性的相关性，也揭示了基因-基因、基因-环境相互作用在结直肠癌发生中的重要作用。所发掘的遗传变异有可能作为标志物，用于高风险个体的筛查和肿瘤的检测、预后判断及有目标的预防。

项目成果

期刊论文数量（8）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Genetic variations in the TGF beta signaling pathway, smoking and risk of colorectal cancer in a Chinese population
中国人群TGFβ信号通路的遗传变异、吸烟和结直肠癌风险
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    Carcinogenesis
  • 影响因子：
    4.7
  • 作者：
    Nie Shaofa;Nie Shaofa;Miao Xiaoping;Miao Xiaoping
  • 通讯作者：
    Miao Xiaoping
后全基因组关联研究时代的机遇与挑战
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2012
  • 期刊：
    中华预防医学杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    刘丽;缪小平;林东昕
  • 通讯作者：
    林东昕
A phosphorylation-related variant ADD1-rs4963 modifies the risk of colorectal cancer.
磷酸化相关变异 ADD1-rs4963 可降低结直肠癌的风险
  • DOI：
    10.1371/journal.pone.0121485
  • 发表时间：
    2015
  • 期刊：
    PloS one
  • 影响因子：
    3.7
  • 作者：
    Shen N;Liu C;Li J;Chen X;Yang Y;Zhu Y;Gong Y;Gong J;Zhong R;Cheng L;Miao X
  • 通讯作者：
    Miao X
A genetic variant in microRNA target site of TGF-beta signaling pathway increases the risk of colorectal cancer in a Chinese population
TGF-β信号通路的microRNA靶位点的遗传变异增加了中国人群患结直肠癌的风险
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2014
  • 期刊：
    Tumor Biology
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Zhong, Rong;Chen, Wei;Miao, Xiaoping;Guo, Anyuan
  • 通讯作者：
    Guo, Anyuan
Interactions between genetic variants in the adiponectin, adiponectin receptor 1 and environmental factors on the risk of colorectal cancer.
脂联素、脂联素受体 1 的遗传变异和环境因素之间的相互作用对结直肠癌风险的影响
  • DOI：
    10.1371/journal.pone.0027301
  • 发表时间：
    2011
  • 期刊：
    PloS one
  • 影响因子：
    3.7
  • 作者：
    Liu L;Zhong R;Wei S;Yin JY;Xiang H;Zou L;Chen W;Chen JG;Zheng XW;Huang LJ;Zhu BB;Chen Q;Duan SY;Rui R;Yang BF;Sun JW;Xie DS;Xu YH;Miao XP;Nie SF
  • 通讯作者：
    Nie SF

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  • 通讯作者：
    成晓龙
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    缪小平
  • 通讯作者：
    缪小平
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  • 通讯作者：
    林东昕
亚甲基四氢叶酸还原酶基因单核苷酸多态与大肠癌风险
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    --
  • 发表时间：
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  • 期刊：
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  • 作者：
    缪小平;杨燊;谭文;张雪梅;叶颖江;林东昕;王杉
  • 通讯作者：
    王杉

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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