白菜花粉发育相关MYB转录因子受miR319调控通路的研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31772311
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1506.蔬菜与瓜果生长发育
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

On the basis of discovering a MYB transcription factor BcMYB81/104, which is related to pollen development in Brassica campestris ssp. chinensis, and its potential upstream regulator bra-miR319, we plan to analyze the temporal and spatial expression patterns of BcMYB81/104, and then use the CRISPR-Cas9 and transgenic technology to analyze its biological functions during the processes of pollen development. Over-expression, GFP and GUS fusion expression systems will be used to unveil the regulation of BcMYB81/104 by bra-miR319. Combining with the research findings existed previously, the similarities and differences between the regulations of MYB by miR319 and/or miR159 will be analyzed. Meanwhile, ChIP and EMSA assays will be chosen to screen and verify the putative downstream target genes of BcMYB81/104, then more researches will be conducted to analyze the function of these genes. By building the regulatory network of “microRNA-MYB-MYB target genes”, we can gain further understanding of the complicated regulations of MYB in pollen development from the perspective of interactions between microRNA and MYB, MYB and its target genes. What’s more,these results will lay a considerable theoretical foundation for the effective fertility control in important crops especially in vegetable crops.
本项目在发现白菜花粉发育相关MYB转录因子编码基因BcMYB81/104及其上游调控因子bra-miR319的基础上,拟利用CRISPR-Cas9基因敲除和转基因等技术,结合亚细胞定位和时空表达模式分析,研究BcMYB81/104的功能;采用过表达、GFP瞬时表达及GUS融合表达体系,研究bra-miR319调控BcMYB81/104的机制,并结合已有研究,比较miR319与miR159对MYB调控的异同;通过染色质免疫共沉淀测序和凝胶电泳迁移实验筛选并验证BcMYB81/104下游靶基因,并对下游靶基因进行功能分析,从而构建“microRNA–MYB转录因子–下游靶基因”在花粉发育过程中的调控网络。这些研究将为有效控制蔬菜等农作物育性提供理论依据。

结项摘要

前期研究发现白菜miR319有可能参与调控BcMYB81/104(即BcMF28)而影响花粉发育,而miR159与miR319家族相似性较高,且有相同的预测靶基因,那么,miR319与miR159如何参与BcMYB81/104调控,以及它们之间有哪些异同,是白菜等十字花科作物等值得深入研究的问题。.本项目采用qRT-PCR、启动子融合表达等技术分析了BcMF28的时空表达模式,发现其在花序中特异表达;利用amiRNA技术和转基因等技术,研究了BcMF28的功能,发现其对于花粉外壁网纹结构的正常形成,外壁孔隙内含油层的分布发挥作用;采用qRT-PCR和启动子融合表达技术分析了bra-miR319和Bra-miR159的时空表达模式,发现bra-miR319和Bra-miR159的表达存在差异;利用5’ RACE技术、烟草瞬时表达体系,研究了Bra-miR319和Bra-miR159对BcMF28的调控,发现在白菜中只有Bra-miR319参与其调控,Bra-MIR319a和Bra-MIR319b能抑制BcMF28的表达,而Bra-MIR319c不能对BcMF28进行调控;构建并获得白菜bra-miR159和 bra-miR319过表达植株,发现bra-miR159和 bra-miR319都在花粉发育中起作用,但是他们导致花粉败育的时期存在差异,此外,白菜MIR319a、MIR319b、MIR319c异源表达拟南芥还能引起拟南芥叶片、花瓣褶皱;利用qRT-PCR方法,筛选得到BcMF28调控的下游靶基因,发现其可能涉及苯丙烷类代谢途径的调控;同时,利用qRT-PCR方法和启动子融合表达技术分析了与BcMF28一样,同属于MYB转录因子的DUO1的潜在靶基因BrDAZ3的时空表达情况,发现其在成熟花粉时期高表达,且在授粉受精过程中持续表达。本项目初步明确了“microRNA–MYB转录因子–下游靶基因”在花粉发育过程中的调控路径。这些研究将为有效控制蔬菜等农作物育性提供理论依据。

项目成果

期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Complex Molecular Evolution and Expression of Expansin Gene Families in Three Basic Diploid Species of Brassica
三种基本二倍体芸苔属植物扩展蛋白基因家族的复杂分子进化和表达
  • DOI:
    10.3390/ijms21103424
  • 发表时间:
    2020-05-01
  • 期刊:
    INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Liu, Weimiao;Lyu, Tianqi;Cao, Jiashu
  • 通讯作者:
    Cao, Jiashu
Polygalacturonase45 cleaves pectin and links cell proliferation and morphogenesis to leaf curvature in Arabidopsis thaliana
拟南芥中多聚半乳糖醛酸酶45裂解果胶并将细胞增殖和形态发生与叶曲度联系起来
  • DOI:
    10.1111/tpj.15308
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    The Plant Journal
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Yang Yang;Charles T. Anderson;Jiashu Cao
  • 通讯作者:
    Jiashu Cao
BcMF30a and BcMF30c, Two Novel Non-Tandem CCCH Zinc-Finger Proteins, Function in Pollen Development and Pollen Germination in Brassica campestris ssp. chinensis.
BcMF30a 和 BcMF30c,两种新型非串联 CCCH 锌指蛋白,在甘蓝花粉发育和花粉萌发中的功能。
  • DOI:
    10.3390/ijms21176428
  • 发表时间:
    2020-09-03
  • 期刊:
    International journal of molecular sciences
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Xu L;Xiong X;Liu W;Liu T;Yu Y;Cao J
  • 通讯作者:
    Cao J
Two Expansin Genes, AtEXPA4 and AtEXPB5, Are Redundantly Required for Pollen Tube Growth and AtEXPA4 Is Involved in Primary Root Elongation in Arabidopsis thaliana.
拟南芥花粉管生长冗余需要两个扩张蛋白基因 AtEXPA4 和 AtEXPB5,AtEXPA4 参与初生根伸长
  • DOI:
    10.3390/genes12020249
  • 发表时间:
    2021-02-10
  • 期刊:
    Genes
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Liu W;Xu L;Lin H;Cao J
  • 通讯作者:
    Cao J
Cys₂/His₂ Zinc-Finger Proteins in Transcriptional Regulation of Flower Development.
Cys2/His2 锌指蛋白在花发育转录调控中的作用
  • DOI:
    10.3390/ijms19092589
  • 发表时间:
    2018-08-31
  • 期刊:
    International journal of molecular sciences
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Lyu T;Cao J
  • 通讯作者:
    Cao J

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其他文献

植物长链非编码RNA的研究进展
  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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对核启动子具有增强功能的TinII内含子在茎瘤芥中影响胞质雄性不育基因T的功能
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
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植物SET蛋白
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    细胞生物学杂志
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    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    宋江华
Characterization and Expression Pattern of a Putative Pectin Methylesterase Gene, BcMF27, in Brassica campestris ssp. chinensis
甘蓝中假定的果胶甲酯酶基因 BcMF27 的特征和表达模式。
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2018-05
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    1.4
  • 作者:
    岳晓艳;曹家树
  • 通讯作者:
    曹家树
植物E3泛素连接酶的分类与功能
  • DOI:
    10.11844/cjcb.2020.05.0020
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    中国细胞生物学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    田爱梅;于晖;曹家树
  • 通讯作者:
    曹家树

其他文献

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曹家树的其他基金

白菜花粉发育相关PME及其互作PMEI基因的表达与功能研究
  • 批准号:
    31471877
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    31272176
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    85.0 万元
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    31071805
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    1994
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相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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