Rab7酶和TBC1d5调节Retromer运输的机制研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31671477
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0701.细胞器及亚细胞结构、互作与功能
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2018-12-31

项目摘要

Retromer is a conserved coat protein complex (CPC) that controls the retrograde transport of a wide range of endosomal cargoes to TGN or plasma membrane. In contrast to the best-studied CPCs (Clathrin/Adaptor protein, COPI, and COPII) that form cage-like structures, retromer primarily associates with tubular structures. Retromer-dependent transport has been linked with multiple human diseases including neurological disorders, infection, and immunodeficiency; however, molecular mechanisms regulating the function of retromer are very poorly understood. Using integrated approaches including mammalian cell biology, biochemistry, and structural biology, we will characterize the role and functional mechanism of Rab7 and TBC1d5 in retromer-dependent transport. Our study will identify the similarity and difference between retromer and classical CPCs in controlling their assembly and turnover, and help the development of novel diagnosis and treatment of related diseases.
囊泡运输参与细胞多项重要的生命活动,对于生命体的活动必不可少。经典的运输小泡都是球状的,新型的衣被蛋白复合体retromer却形成管状的运输小泡。Retromer调节从内涵体到高尔基网或细胞膜的运输,和人类的许多重大疾病(如神经退行性疾病、感染与免疫缺陷等)的发生发展密切相关。鉴于GTP酶在囊泡运输的关键作用,我们将综合利用细胞生物学,生物化学,结构生物学等手段研究Rab7酶与TBC1d5在Retromer囊泡形成中的功能,结构及分子机制。我们的研究将揭示Retromer与经典囊泡复合物的相同点与不同点,对相关疾病的诊断和治疗作出贡献。

结项摘要

细胞内蛋白质及代谢物的稳态调控对于细胞各方面的功能都至关重要。细胞通过内吞作用将细胞外物质转运入细胞内,然后在内体上进一步分选。Retromer复合体在真核生物中高度保守,在调控内体分选中发挥着核心作用。我们发现了Rab7的激活蛋白TBC1d5和Retromer直接结合,对于retromer货物运输至关重要,并阐述了TBC1d5调节Retromer货物运输的机理 (Nature Communications, 2016). 在研究TBC1D5调节内体分选机制的同时,我们系统地研究了病原菌如何干扰内体分选,解析了嗜肺军团菌效应蛋白RidL和衣原体效应蛋白IncE干扰内体分选的分子机制(STTT, 2017; PNAS, 2018)。值得一提的是,RidL通过和TBC1d5竞争与Retromer的结合,进而抑制Retromer的运输(PNAS,2018)。我们还应邀在领域了知名期刊Traffic上发表了综述(Traffic,2018).这一系列成果,深化了我们对内体分选的功能和调节机制的认识,揭示了病原菌通过和宿主争夺细胞转运控制权的来帮助其生存与增殖的新机制。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Structural and functional insights into sorting nexin 5/6 interaction with bacterial effector IncE.
分类 nexin 5/6 与细菌效应器 IncE 相互作用的结构和功能见解
  • DOI:
    10.1038/sigtrans.2017.30
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Signal transduction and targeted therapy
  • 影响因子:
    39.3
  • 作者:
    Sun Q;Yong X;Sun X;Yang F;Dai Z;Gong Y;Zhou L;Zhang X;Niu D;Dai L;Liu JJ;Jia D
  • 通讯作者:
    Jia D
Mechanism of inhibition of retromer transport by the bacterial effector RidL
细菌效应子 RidL 抑制逆转录酶转运的机制
  • DOI:
    10.1073/pnas.1717383115
  • 发表时间:
    2018-01
  • 期刊:
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
  • 影响因子:
    11.1
  • 作者:
    Yao Jialin;Yang Fan;Liu Qi;Liu Dingdong;Zhang Xia;Niu Dawen;Jia Da;Yao Jialin;Yang Fan;Liu Qi;Liu Dingdong;Zhang Xia;Niu Dawen;Wei Yuquan;Jia Da;Sun Xiaodong;Wang Shen;Ma Cong;Wang Shen;Ma Cong;Gan Ninghai;Luo Zhao-Qing;Gan Ninghai;Luo Zhao-Qing;Sun Qingx
  • 通讯作者:
    Sun Qingx
Endosomal receptor trafficking: Retromer and beyond.
内体受体运输:Retromer 及其他
  • DOI:
    10.1111/tra.12574
  • 发表时间:
    2018-08
  • 期刊:
    Traffic (Copenhagen, Denmark)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Wang J;Fedoseienko A;Chen B;Burstein E;Jia D;Billadeau DD
  • 通讯作者:
    Billadeau DD
Reduced thiamine binding is a novel mechanism for TPK deficiency disorder
硫胺素结合减少是 TPK 缺乏症的一种新机制
  • DOI:
    10.1007/s00438-018-1517-3
  • 发表时间:
    2019-04-01
  • 期刊:
    MOLECULAR GENETICS AND GENOMICS
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Huang, Wenjie;Qin, Jiao;Jia, Da
  • 通讯作者:
    Jia, Da

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贾大的其他基金

TBC1d23调节细胞器互作及突变引起脑桥小脑发育不全的机制研究
  • 批准号:
    91854121
  • 批准年份:
    2018
  • 资助金额:
    89.0 万元
  • 项目类别:
    重大研究计划
细胞分泌的调控及相关肠炎的机理研究
  • 批准号:
    31871429
  • 批准年份:
    2018
  • 资助金额:
    59.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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