基于磷酸化蛋白质组学方法研究蛋白激酶CIPK23信号通路及其与低钾胁迫的关系
批准号:
31470345
项目类别:
面上项目
资助金额:
95.0 万元
负责人:
陈艳梅
依托单位:
学科分类:
C0204.水分和营养物质的运输与代谢
结题年份:
2018
批准年份:
2014
项目状态:
已结题
项目参与者:
赵丽娜、彭磊、李希东、贾忞、蒋欣
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中文摘要
钾是植物生长发育所必须的矿质营养元素之一。植物中K+的吸收和转运过程主要是由钾通道蛋白和钾转运体蛋白调控完成。本实验室前期工作发现CBL1/9-CIPK23参与拟南芥低钾萌发生长过程中的钾营养调节, 但传统的生化技术只确证了个别下游底物蛋白及磷酸化位点。以质谱为主的磷酸化蛋白质组学研究和功能基因组学研究相结合将大大推动这一领域的研究进展。本研究拟以拟南芥作为实验系统,通过非标记定量磷酸化蛋白质组学技术与LC-MS相结合,对CIPK23和CBL1/9不同材料在钾营养吸收利用过程中的蛋白质磷酸化进行精确定量分析,筛选CIPK23调控的下游目的蛋白。通过生化技术和遗传学技术,对目的蛋白进行功能验证,为探讨钾营养吸收机理提供理论依据。
英文摘要
Potassium (K+) is one of the essential mineral elements for plant growth and development. The K+ uptake and translocation in plants are primarily mediated by K+ transporters or channels together with their upstream regulators. Our previous studies have been shown that CBL1/9-CIPK23 is involved in the signaling transduction of low-K+ stress in Arabidopsis. However, classical biochemical approaches have so far revealed only a few candidate proteins and even fewer phosphorylation sites. Mass spectrometry provides a powerful tool for the in-depth analysis of systems biology. In this study, we will perform a global quantitative phosphoproteomic analysis of the Arabidopsis mutants reveals low-K+ stress responsive proteins and identifies substrates of CIPK23. To demonstrate the molecular mechanisms, we will analysis the interaction of CIPK23 and its targets by biochemical and genetic approaches, which will be combined with the phosphoproteomic data to investigate the potassium uptake mechanisms.
定量磷酸化蛋白质组学方法和技术的快速发展为研究蛋白质磷酸化时空动态变化和更好地了解生物学功能调节网络奠定了坚实的基础。本项目在原有的工作基础上,用模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)CPK相关材料,使用基于质谱进行定量的磷酸化蛋白质组学技术(phosphoproteomics),精确筛选与CPK相互作用的下游蛋白质,探讨激酶在营养高效吸收利用过程中的调控机制;并通过遗传和分子生物学方法对其进行功能验证。此外,本项目在执行过程中还建立并优化了磷酸化蛋白质富集方法(Tandem MOAC)并且应用到硼营养缺失磷酸化蛋白质组学研究中,该技术在蛋白水平的富集效率提高到40%,多肽水平上的富集效率提高到60%,同时还鉴定到很多未报到过的磷酸化位点。此外,我们进一步分析了MAPK信号转导机制,结合生化实验最终验证了MAPK信号通路中MPK激酶通过磷酸化BOR2和BOR3从而调控细胞内boron的极性运输。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI:https://doi.org/10.1111/tpj.14215
发表时间:--
期刊:The Plant Journal
影响因子:--
作者:Yanmei Chen;Wolfgang Hoehenwarter
通讯作者:Wolfgang Hoehenwarter
Changes in the Phosphoproteome and Metabolome Link Early Signaling Events to Rearrangement of Photosynthesis and Central Metabolism in Salinity and Oxidative Stress Response in Arabidopsis
拟南芥磷酸化蛋白质组和代谢组的变化将早期信号事件与盐度和氧化应激反应中光合作用和中枢代谢的重排联系起来
DOI:10.1104/pp.15.01486
发表时间:2015-12-01
期刊:PLANT PHYSIOLOGY
影响因子:7.4
作者:Chen, Yanmei;Hoehenwarter, Wolfgang
通讯作者:Hoehenwarter, Wolfgang
Rapid and reproducible phosphopeptide enrichment by tandem metal oxide affinity chromatography: application to boron deficiency induced phosphoproteomics
通过串联 MOAC 快速、可重复地富集磷酸肽:在缺硼诱导的磷酸蛋白质组学中的应用
DOI:10.1111/tpj.14215
发表时间:2019-04-01
期刊:PLANT JOURNAL
影响因子:7.2
作者:Chen, Yanmei;Hoehenwarter, Wolfgang
通讯作者:Hoehenwarter, Wolfgang
蛋白磷酸酶NRPP1介导的去磷酸化途径调控低氮应答的分子机制
- 批准号:32370430
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:50万元
- 批准年份:2023
- 负责人:陈艳梅
- 依托单位:
NRT2.2,AHA7和RLK协同调控氮吸收和信号的分子机理与互作组学研究
- 批准号:32170409
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:58万元
- 批准年份:2021
- 负责人:陈艳梅
- 依托单位:
利用质谱技术研究拟南芥响应逆境胁迫过程中磷酸化信号转导机制
- 批准号:31270305
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:80.0万元
- 批准年份:2012
- 负责人:陈艳梅
- 依托单位:
国内基金
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