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RNA结构稳健性及其进化动力学研究

批准号:
30700139
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
17.0 万元
负责人:
舒文杰
学科分类:
物理生物学
结题年份:
2010
批准年份:
2007
项目状态:
已结题
项目参与者:
倪铭、李非、李鹏、吴一波、孙汉昌、段铭、丁晓然、余光创、张敏丽

项目摘要

结项摘要

项目成果

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中文摘要
随着RNA组学的兴起,RNA在生命活动中承载的重要功能不断被揭示出来,使得关于RNA进化与起源的问题重新成为生命科学的热点。生物稳健性是生物系统中一个最基本的性质。尽管近年来关于表型的遗传和环境稳健性的进化得到了普遍关注,但稳健性的起源及进化问题仍然没有得到根本的解决。造成这一现状的原因是因为在自然生物系统中,稳健性的评估是非常困难的。本项目拟将计算、理论模型与实验验证紧密融合,以RNA有害突变预测结果为基础,建立RNA结构稳健性的评估方法,并将其应用于RNA结构元件识别、RNA分子设计;运用反向推理,将研究对象由RNA结构稳健性的单点突变的近邻空间扩展到多点突变的整个序列空间,建立RNA进化动力学仿真平台及其动力学模型,研究RNA进化的规律。该项目的研究结果将为RNA结构稳健性的起源与机制、以及RNA进化研究奠定坚实的基础,同时将为稳健性的应用研究铺平道路。
英文摘要
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Correlation between sequence conservation and structural thermodynamics of microRNA precursors from human, mouse, and chicken genomes
人类、小鼠和鸡基因组中 microRNA 前体的序列保守性与结构热力学之间的相关性
DOI: 10.1186/1471-2148-10-329
发表时间: 2010-10-27
期刊: BMC EVOLUTIONARY BIOLOGY
影响因子: 3.4
作者: [Ni, Ming, Shu, Wenjie, Li, Songgang]
通讯作者: Li, Songgang
In silico genetic robustness analysis of miRNA secondary structures: potential evidence of congruent evolution in miRNA
miRNA 二级结构的计算机遗传鲁棒性分析:miRNA 一致性进化的潜在证据
DOI: --
发表时间: --
期刊: BMC Evolutionary Biology
影响因子: 3.4
作者: [Zhiqiang Zheng, Xiaochen Bo, Shengqi Wang, Ming Ni, Wenjie Shu]
通讯作者: Wenjie Shu
A novel representation of RNA secondary structure based on element-contact graphs.
基于元素接触图的 RNA 二级结构的新颖表示
DOI: 10.1186/1471-2105-9-188
发表时间: 2008-04-11
期刊: BMC bioinformatics
影响因子: 3
作者: [Shu W, Bo X, Zheng Z, Wang S]
通讯作者: Wang S
In silico genetic robustness analysis of secondary structural elements within miRNA gene
miRNA 基因内二级结构元件的计算机遗传鲁棒性分析
DOI: --
发表时间: --
期刊: Journal of Molecular Evolution
影响因子: 3.9
作者: [Ming Ni, Wenjie Shu, Shengqi Wang, Xiaochen Bo, Zhiqiang Zheng]
通讯作者: Zhiqiang Zheng
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    多稳态变构核酸分子的理论设计与实验验证研究
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    海外基金