运动发酵单胞菌糖转运体基因ZMO0293的功能分析

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31901071
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    21.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C2106.应用生物技术
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Sugar transporters play an important role in the uptake of carbon source for various organisms. Zymomonas mobilis is considered as a model strain for ethanol fermentation with efficient glucose transportation system and higher ethanol productivity. However, the type and function of glucose transporters associated with glucose uptake are unclear. The previous microarray result illustrated that a sugar transport gene ZMO0293, was significantly up-regulated by 3.7-fold, and maintained high level of transcription for a long time under high glucose conditions. In contrast,the transcription level of the other gene glf encoding glucose-facilitated protein was almost unchanged. To investigate the function and regulation characteristics of the gene ZMO0293, firstly, the uptake pattern and substrate range of sugar transporter gene ZMO0293 will be analyzed using heterologous expression; secondly, knockouts and complementary mutants will be constructed through CRISPR/Cas9 genome editing method to distinguish functional differences of these two genes; at last, the promoter pattern of the gene ZMO0293 will be defined using the reporter gene eGFP. This study can help to elucidate the role of the gene ZMO0293 in glucose uptake process,and provide scientific basis for further modifications of metabolic engineering and sugar transporter engineering.
糖转运体在各种生物的碳源吸收中发挥着重要作用。运动发酵单胞菌是研究乙醇发酵的模式菌株,具有高效的葡萄糖转运系统和较高的乙醇产率,但是与葡萄糖吸收相关的糖转运体种类和功能并不清楚。前期基因芯片结果显示在高浓度葡萄糖条件下,一个糖转运体基因ZMO0293显著上调3.7倍,并且保持长时间、高水平的转录,然而另外一个葡萄糖易化蛋白基因glf的转录水平却几乎不变。为了研究ZMO0293的功能和调控特点,本项目将首先通过异源表达分析糖转运体ZMO0293的葡萄糖吸收方式和底物范围;然后通过CRISPR/Cas9基因编辑技术分别构建ZMO0293和glf的缺失突变体和回补突变体,分析它们的功能差异;最后通过报告基因eGFP确定ZMO0293基因的启动子类型。本项目将有助于理解ZMO0293在葡萄糖吸收过程中的作用,并且为进一步代谢工程或者糖转运体工程改造奠定基础。

结项摘要

运动发酵单胞菌是研究乙醇发酵的模式菌株,具有许多独特的特性,这使它成为理想的用于生物制品生产的微生物生物催化剂。糖转运体在吸收糖类和乙醇发酵的过程中发挥着重要的作用。Z. mobilis利用易化蛋白Glf介导的易化扩散吸收葡萄糖。然而,另一种糖转运蛋白编码基因ZMO0293的功能却不清楚。我们采用CRISPR/Cas方法介导的基因缺失和异源表达来研究ZMO0293的作用。结果表明,在高浓度葡萄糖存在的情况下,ZMO0293基因的缺失减缓生长和降低乙醇的产量,导致参与葡萄糖代谢的关键酶的活性降低。此外,ZMO0293缺失在ZM4-ΔZMO0293菌株中引起Entner-Doudoroff (ED)途径部分基因的不同转录变化,但在ZM4细胞中没有。ZMO0293的整合表达恢复了葡萄糖吸收缺陷菌株Escherichia coli BL21(DE3)-ΔptsG的生长。本研究揭示了Z. mobilis中ZMO0293基因对高浓度葡萄糖的响应功能,为其他微生物提供了一个新的合成生物学元件。

项目成果

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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