“绿盘鲍”产量超亲杂种优势的生理学与遗传学解析

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31872564
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    61.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1902.水产生物遗传育种学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Hybridization is the most important and useful genetic improvement method for abalone and several hybrids have been commercially large-scale utilized all over the world. However, the mechanisms underlying heterosis have remained a mystery. Lvpan Abalone is the new hybrid between Haliotis discus hannai and H. fulgens, which showed high better parent heterosis for the yield increase. In this study, the phenotypic and physiological basis was analyzed using an integrative approach. The interaction between the heterosis and environment were also studied to uncover the environment impact on the phenotypic differences for abalone hybrids. The whole genome analyses were incorporated together with Allele-Specific Expression method to find and verify genes related with feed efficiency traits. Our research highlights the importance of integrative methods to uncover the mechanism of heterosis and pave a way toward revealing the molecular mechanisms in abalone heterosis. It would provide the references and lessons for heterosis research on other aquatic organisms and genetic improvement for feed efficiency related traits.
杂种优势利用是鲍性状遗传改良的重要途径,国内外已相继培育出多个新品种并得到广泛应用,然而鲍杂种优势产生的机理至今仍悬而未决。本项目拟以课题组最新培育出的具有显著产量超亲杂种优势的“绿盘鲍”杂交种为研究对象,围绕饵料利用率这一重要经济性状,对杂交种产量杂种优势产生的表型与生理学机制进行全面剖析,同时探讨杂种优势与环境的互作效应,开展杂种稳定性优势的生物学研究,并在全基因组水平揭示等位基因差异表达对鲍杂种优势的贡献,解析杂种优势形成的分子机制。研究结果可丰富鲍杂种优势形成以及利用的机理,同时也为开展鲍饵料利用效率的遗传改良研究提供借鉴。

结项摘要

绿盘鲍新品种系采用雌性皱纹盘鲍与雄性绿鲍进行种间杂交培育出的新品种,与现有养殖皱纹盘鲍相比,绿盘鲍的生长速度(体重)提高50%以上,耐高温性能提高2℃,增产效果显著,已进行了规模化推广应用并取得显著经济效益。杂种优势利用是鲍性状遗传改良的重要途径,国内外已相继培育出多个新品种并得到广泛应用,然而鲍杂种优势产生的机理至今仍悬而未决。本课题以项目组最新培育的国审新品种“绿盘鲍”为研究对象,1) 对其耐高温、耐低氧、抗病等性状进行了全面比较,创制了一套鲍食物转化率的精准测评设备,对绿盘鲍与皱纹盘鲍的食物转化率指标进行了详细评估,基于温度及饵料对鲍肠道微生物的影响研究,获得一批与食物转化率密切相关的差异细菌。2)课题组在福建东山、晋江以及山东荣成三个国内主要养殖区设置实验组开展为期一年的养殖试验,对主要经济性状进行评测,剖析不同环境下养殖性状的遗传效应,分析杂种优势在不同环境下的遗传差异。3)完成皱纹盘鲍、绿鲍和绿盘鲍三个种的精细基因组图谱组装工作,发现绿盘鲍相对于亲本群体发生了大量的结构变异,大部分同源基因有发生了结构变异,功能富集分析结果显示,这些基因主要与参与能量代谢相关通路有关。通过急性温度胁迫实验,结合转录组学展开研究,发现非加性表达基因广泛存在于绿盘鲍中,高温下非加性表达基因均表现为超显性表达,而且主要参与能量代谢与免疫相关通路,说明基因超显性表达在绿盘鲍对高温的响应过程中也发挥重要作用,同时也是其耐高温杂种优势形成的潜在因素。本课题综合采用多种技术方法探讨鲍杂种优势形成的生理及遗传机理,研究结果可为鲍的分子设计育种及强杂种优势组合的选配提供技术支撑,也为鲍新品种的持续开发奠定重要的理论基础。

项目成果

期刊论文数量(14)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Transcriptome analysis reveals the molecular mechanisms of heterosis on thermal resistance in hybrid abalone.
转录组分析揭示杂交鲍耐热性杂种优势的分子机制
  • DOI:
    10.1186/s12864-021-07954-y
  • 发表时间:
    2021-09-08
  • 期刊:
    BMC genomics
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Xiao Q;Huang Z;Shen Y;Gan Y;Wang Y;Gong S;Lu Y;Luo X;You W;Ke C
  • 通讯作者:
    Ke C
The survival and respiration response of two abalones under short-term hypoxia challenges
两种鲍鱼在短期缺氧挑战下的生存和呼吸反应
  • DOI:
    10.1016/j.aquaculture.2020.735658
  • 发表时间:
    2020-12
  • 期刊:
    Aquaculture
  • 影响因子:
    4.5
  • 作者:
    Yawei Shen;Miaoqin Huang;Weiwei You;Xuan Luo;Caihuan Ke
  • 通讯作者:
    Caihuan Ke
Transcriptome analysis reveals fluid shear stress (FSS) and atherosclerosis pathway as a candidate molecular mechanism of short-term low salinity stress tolerance in abalone.
转录组分析揭示流体剪切应力(FSS)和动脉粥样硬化途径是鲍鱼短期低盐胁迫耐受性的候选分子机制
  • DOI:
    10.1186/s12864-022-08611-8
  • 发表时间:
    2022-05-23
  • 期刊:
    BMC genomics
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
  • 通讯作者:
Distinct metabolic shifts occur during the transition between normoxia and hypoxia in the hybrid and its maternal abalone
杂交鲍鱼及其母体鲍鱼在常氧和缺氧之间的过渡过程中会发生明显的代谢变化
  • DOI:
    10.1016/j.scitotenv.2021.148698
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Science of The Total Environment
  • 影响因子:
    9.8
  • 作者:
    Yawei Shen;Ying Zhang;Qizhen Xiao;Yang Gan;Yi Wang;Gewen Peng;Zekun Huang;Feng Yu;Xuan Luo;Caihuan Ke;Weiwei You
  • 通讯作者:
    Weiwei You
Genotype by environment interactions for productive traits of purebred and crossbred abalone strains under different rearing modes
不同饲养模式下纯种和杂交鲍鱼品系生产性状的环境相互作用基因型
  • DOI:
    10.1016/j.aquaculture.2022.738966
  • 发表时间:
    2022-10
  • 期刊:
    Aquaculture
  • 影响因子:
    4.5
  • 作者:
    Yang Gan;Yi Wang;Feng Yu;Qizhen Xiao;Xuan Luo;Zhaofang Han;JinWei Ke;Weiwei You;Caihuan Ke
  • 通讯作者:
    Caihuan Ke

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其他文献

Genetic changes in muscle protein following hybridization between Haliotis diversicolor diversicolor Japan and Taiwan populations, revealed using a proteomic approach
使用蛋白质组学方法揭示日本杂色鲍和台湾杂色鲍杂交后肌肉蛋白的遗传变化
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    Proteomics
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    游伟伟
  • 通讯作者:
    游伟伟
温度骤变对皱纹盘鲍与西氏鲍及其杂交群体的热休克蛋白表达影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    厦门大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    梁爽;骆轩;游伟伟;柯才焕
  • 通讯作者:
    柯才焕
杂色鲍群体间杂交的杂种优势分析
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    南方水产科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    林壮炳;游伟伟
  • 通讯作者:
    游伟伟
杂色鲍GABARAP基因的克隆与表达
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    Fish & Shellfish Immunology
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    游伟伟
  • 通讯作者:
    游伟伟

其他文献

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游伟伟的其他基金

70.8海洋媒体实验室科普实践
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2020
  • 资助金额:
    15 万元
  • 项目类别:
    专项基金项目
基于RNA-Seq与microRNA表达谱探讨杂色鲍杂种优势分子机理
  • 批准号:
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    2014
  • 资助金额:
    86.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
候选基因法筛选杂色鲍生长SNPs及其与性状的关联分析
  • 批准号:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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