棉花偏分离染色体的遗传机理和效应剖析
批准号:
31171593
项目类别:
面上项目
资助金额:
63.0 万元
负责人:
林忠旭
依托单位:
学科分类:
作物基因组及遗传学
结题年份:
2015
批准年份:
2011
项目状态:
已结题
项目参与者:
陈学梅、李夕梅、王寒涛、王夏青、聂以春
中文摘要
偏分离不仅是普遍的遗传现象,在育种中也有重要的应用价值。在构建棉花高密度种间图谱的同时,我们发现第2、16、18染色体严重偏分离。为了研究棉花种间群体偏分离的机制及其对性状传递的影响,我们以这3条染色体为研究对象,利用正反交F2群体和互交BC1群体研究雌、雄配子和合子在不同胞质背景的传递能力;同时,通过比较棉花种间遗传图谱、陆地棉种内遗传图谱和海岛棉种内遗传图谱研究易位、倒位等染色体结构的变异与偏分离的关系,从而较全面的解析棉花种间群体偏分离的机制。利用海岛棉改良陆地棉一直是育种家努力的方向,为了有助于海岛棉性状向陆地棉的有效转移,我们利用这些分离群体进行这3条染色体的产量和纤维品质性状的QTL定位,探讨偏分离标记与性状的关系,并通过世代的跟踪明确偏分离标记与棉花种间性状传递的关系,为海岛棉优良性状向陆地棉转移提供相应的理论基础。
英文摘要
为了研究海岛棉和陆地棉种间杂交偏分离的机理,为海岛棉优异基因向陆地棉转移提供思路,我们构建了海陆种间2个正反交F2群体和8个正反交回交群体,从全基因组的角度解析了杂交方式对重组率的影响;解析了第2,16,18号三个偏分离染色体偏分离的遗传机理。通过(EP)E和E (EP)两个回交群体,以覆盖全基因组的SSR标记对两群体进行分析。结果表明,两个群体的遗传图谱在图谱总长和标记平均间距不存在显著差异;雌、雄配子重组率对A、D亚基因组的影响不具有特异性,雌、雄配子重组率只在部分染色体区段影响重组。. 在第2号、16、18染色体上分别检测到21、50、23个偏分离标记。在10个群体中检测到46个SDLs。通过群体间比较分析,初步确定了SDL2.1在雄性分离群体(PE)E、(PE)P和雌性分离群体E(EP),以及(EP)F2群体中被检测到,并且均表现为杂合基因型具有选择优势,暗示该位点存在合子选择,杂合子具有选择优势。SDL2.6在两个雄性分离群体(EP)P和(PE)P中被检测到,而在相应的雌性配子分离群体中没有被检测到,说明SDL2.6可能是雄配子选择位点,同时这个位点在正反交F2群体中也被检测。SDL16.14在雌性分离群体 (EP)E、(EP)P、(PE)E和雄性分离群体E(EP)、P(EP)、P(PE)中被检测到,但在正反交群体中没有检测到,说明此位点可能不受合子选择影响,而是配子选择主导的偏分离。SDL16.1在雄性分离群体E(PE)、P(EP)中被检测到,说明此位点可能是雄配子选择位点,由于此位点没有在相应的群体P(PE)、E(EP)中被检测到,暗示此位点的选择效应可能同时受胚囊环境影响。SDL18.8在8个群体均被检测到,在全部群体中均表现为偏向杂合基因型,这暗示着该位点的具有杂合基因型选择优势。SDL18.1在E(EP)和E(PE)群体中均表现为偏向纯合基因型,这暗示着该位点E22等位位点具有选择优势,并且在(PE)F2群体中也偏向E22纯合基因型。.. 对4个BC1S1群体及亲本的产量和早熟性状进行了考查,利用复合区间作图方法对4个BC1S1分离群体的产量及早熟相关性状进行QTL定位分析,在3个偏分离染色体上检测到14个QTL,分别是E(EP)中4个,E(PE)中1个,(EP)E中6个,(PE)E中3个,QTL解释表型变异9.00%~19。
期刊论文列表
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专利列表
Development of EST-based SNP and InDel markers and their utilization in tetraploid cotton genetic mapping.
基于EST的SNP和InDel标记的开发及其在四倍体棉花遗传图谱中的应用
DOI:
10.1186/1471-2164-15-1046
发表时间:
2014-12-01
期刊:
BMC genomics
影响因子:
4.4
作者:
[Li X, Gao W, Guo H, Zhang X, Fang DD, Lin Z]
通讯作者:
Lin Z
GENOME-WIDE IDENTIFICATION OF RECOMBINATION RATES OF MALE VERSUS FEMALE GAMETES IN INTERSPECIFIC POPULATION OF COTTON
棉花种间群体中雄性配子与雌性配子重组率的全基因组鉴定
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
Pakistan Journal of Botany
影响因子:
1.2
作者:
[Yu, Yu, Lin, Zhongxu, Zhang, Xianlong]
通讯作者:
Zhang, Xianlong
Comparison and development of EST–SSRs from two 454 sequencing libraries of Gossypium barbadense
海岛棉两个 454 测序文库 EST‐SSR 的比较和开发
DOI:
10.1007/s10681-014-1104-6
发表时间:
2014-03
期刊:
Euphytica
影响因子:
1.9
作者:
[Wenhui Gao, Xin Jin, Xianlong Zhang, Zhongxu Lin]
通讯作者:
Zhongxu Lin
qFL-c10-2调控棉花纤维长度的分子机制及其与qFL-c10-1的聚合
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批准号:32372071
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项目类别:面上项目
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资助金额:50万元
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批准年份:2023
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负责人:林忠旭
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依托单位:
棉籽油份合成关键基因的功能解析
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批准号:--
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项目类别:面上项目
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资助金额:58万元
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批准年份:2021
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负责人:林忠旭
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依托单位:
qFL-c10-1增加棉花纤维长度的机理研究
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批准号:31871669
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项目类别:面上项目
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资助金额:60.0万元
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批准年份:2018
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负责人:林忠旭
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依托单位:
qBW12,一个影响棉花海陆种间杂交单铃重QTL的克隆与功能验证
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批准号:31571714
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项目类别:面上项目
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资助金额:66.0万元
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批准年份:2015
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负责人:林忠旭
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依托单位:
利用MAGIC群体解析陆地棉重要经济性状的遗传基础
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批准号:31371674
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项目类别:面上项目
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资助金额:72.0万元
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批准年份:2013
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负责人:林忠旭
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依托单位:
海岛棉重要经济性状遗传基础的分子解析及其应用
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批准号:30871559
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项目类别:面上项目
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资助金额:32.0万元
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批准年份:2008
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负责人:林忠旭
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依托单位:
分子标记辅助选择构建棉花种间单片段代换系及其遗传评价
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批准号:30600396
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:22.0万元
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批准年份:2006
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负责人:林忠旭
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依托单位:
国内基金
海外基金