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探索组合药物多靶标协同调控分子机制的规律
结题报告
批准号:
31071161
项目类别:
面上项目
资助金额:
30.0 万元
负责人:
陈新
依托单位:
学科分类:
C0608.生物数据资源与分析方法
结题年份:
2013
批准年份:
2010
项目状态:
已结题
项目参与者:
王玮、刘彦斌、林明志、周犀、何万林、魏强、陈丽娟
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中文摘要
当前,新药研发仍普遍遵循一药一靶的"锁钥模型"。然而,越来越多的证据显示,单一靶标的治疗策略存在很多缺陷。而同时利用多个药物分子,协同调控多个靶标的治疗方法,在很多情况下,尤其是在治疗一些复杂顽固疾病的过程中,表现出了明显的优势。同时,由于组合药物研发的投入和速度均较传统的新化合物药有优势,国外一些科研机构已经开始了大量的组合药物临床试验。虽然组合药物的疗效和分子机制数据日渐丰富,但其组合成功的经验和组合失败的教训仍然没有被很好地总结。组合药物的设计也停留在经验阶段,缺乏分子机制层面的理论指导。自2003年以来,项目申请人一直密切关注这一领域,并为系统分析多靶标协同治疗的分子机制进行了一系列的数据和方法准备。本项目拟从已有确切整体效用数据的组合药物例子入手,总结、对比分析成功和失败的药物组合在分子机制方面的规律,为最终实现合理设计组合药物的目标做一定的理论准备。
英文摘要
组合药物设计是治疗复杂顽固疾病的一个有效策略,是当前国际药理学研究的新思路和热点,也是项目完成人多年以来一直努力的方向。本项目按计划进一步完善了组合药物数据库,将数据量扩大了12倍并优化了数据结构;建立了较为完整的小分子到体内作用靶标的对应关系;建立了高精度的人类分子相互作用网络,覆盖22%的全部人类蛋白相互作用,可靠性达41%;在人类分子相互作用网络建立前,以拟南芥分子相互作用网络为模式,建立了分析多点调控产生的整体影响的方法,并在人类分子相互作用网络建立后确认有效;利用组合药物疗效的回顾性数据验证了多点调控分析方法的有效性,并将这一方法应用于实际的前瞻性研究。论文发表情况,从数量角度,计划发表SCI论文2-4篇,实际已发表SCI论文5篇,尚有2篇投稿中;从质量角度,发表论文的期刊包括植物学和生物信息学领域最高影响力的原创论文期刊。综上,本项目按计划高质量地完成了研究任务。本项目的完成标志着负责人在组合药物设计领域的方法和数据准备已经基本完成,当前的积累已经可以支持从具体的疾病入手,设计基于组合药物的创新治疗方案。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Optimization of molecular docking scores with support vector rank regression
使用支持向量秩回归优化分子对接分数
DOI:10.1002/prot.24282
发表时间:2013-08
期刊:Proteins: Structure, Function, and Genetics
影响因子:--
作者:陈新
通讯作者:陈新
Results of molecular docking as descriptors to predict human serum albumin binding affinity
分子对接结果作为描述符预测人血清白蛋白结合亲和力
DOI:10.1016/j.jmgm.2011.11.003
发表时间:2012-03-01
期刊:JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS & MODELLING
影响因子:2.9
作者:Chen, Lijuan;Chen, Xin
通讯作者:Chen, Xin
The Predicted Arabidopsis Interactome Resource and Network Topology-Based Systems Biology Analyses
预测的拟南芥互作组资源和基于网络拓扑的系统生物学分析
DOI:10.1105/tpc.110.082529
发表时间:2011-03-01
期刊:PLANT CELL
影响因子:11.6
作者:Lin, Mingzhi;Zhou, Xi;Chen, Xin
通讯作者:Chen, Xin
DOI:10.1002/prot.23173
发表时间:2012-01
期刊:Proteins: Structure
影响因子:--
作者:Wei Wang;Xiaoping Zhou;Wanlin He;Yi Fan;Yuzong Chen;Xin Chen
通讯作者:Wei Wang;Xiaoping Zhou;Wanlin He;Yi Fan;Yuzong Chen;Xin Chen
Human interactome resource and gene set linkage analysis for the functional interpretation of biologically meaningful gene sets
人类相互作用组资源和基因集连锁分析,用于对具有生物学意义的基因集进行功能解释
DOI:10.1093/bioinformatics/btt353
发表时间:2013-08-15
期刊:BIOINFORMATICS
影响因子:5.8
作者:Zhou, Xi;Chen, Pengcheng;Chen, Xin
通讯作者:Chen, Xin
lncRNA-FAM83A-AS1/STAT3/SOX5信号轴在调控肺腺癌转移及肿瘤干性维持的作用机制研究
  • 批准号:
    81802887
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    21.0万元
  • 批准年份:
    2018
  • 负责人:
    陈新
  • 依托单位:
基因集功能关联分析:依据功能关联网络解析组学变化的整体生物学意义
  • 批准号:
    31571356
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    58.0万元
  • 批准年份:
    2015
  • 负责人:
    陈新
  • 依托单位:
计算识别化合物体内作用靶标的方法及应用
  • 批准号:
    30970690
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    32.0万元
  • 批准年份:
    2009
  • 负责人:
    陈新
  • 依托单位:
植物磷养分利用相关分子相互作用网络的预测与整合
  • 批准号:
    30600039
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万元
  • 批准年份:
    2006
  • 负责人:
    陈新
  • 依托单位:
国内基金
海外基金