利用CRISPR基因敲除文库构建诱发AML的协同作用信号通路网络
结题报告
批准号:
31701280
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
26.0 万元
负责人:
张竞方
学科分类:
C1204.组织器官发育及体外构建
结题年份:
2020
批准年份:
2017
项目状态:
已结题
项目参与者:
张菊、吴付佳、陈丽
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中文摘要
急性髓系白血病(acute myeloid leukemia, AML)是成年人中最为常见的一种急性白血病。随着大批AML病人的全基因组序列被测通,AML的基因组蓝图已初具规模。多数病人都在过度激活的信号通路上携带基因突变,表明其在AML的发生中起着重要作用。其中,发生频率最高的两个突变分别位于FLT3和NRAS/KRAS。为了研究过度激活的Flt3和Ras信号通路如何与其它信号通路协同作用而诱发AML,我们拟建立一个基于CRISPR/Cas9体系的基因敲除文库,在表达过度激活的Flt3-ITD或NrasG12D的基因工程小鼠中进行大规模的基因功能缺失型筛选,以发现能与之协同作用诱导AML的基因突变。我们的研究将构建诱发AML的信号通路网络。这一研究将对揭示AML发生的内在分子机制以及对今后的基因诊断、预后和靶向治疗都有重要意义。
英文摘要
Acute myeloid leukemia (AML) is the most frequent acute leukemia in adults. With whole genome sequencing performed in a large cohort of AML patients, the genomic landscape of AML has been established. Among those patients, more than half have genetic alterations involved in activated signaling pathways, suggesting their important roles in disease development. The most frequent mutation sites locate in FLT3 and NRAS/KRAS. To identify the genetic alterations that synergize with activated Flt3 and Ras signaling pathways to form AML, we propose to conduct CRISPR/Cas9 based loss of function screens in a pooled format using Flt3-ITD and NrasG12D mouse models respectively. Our study will dissect the synergetic mechanisms among different signaling pathways in a systematic manner, which may potentially translate into better diagnosis, prognosis, and targeted therapy in AML.
急性髓系白血病(acute myeloid leukemia, AML)是成年人中最常见的一种急性白血病,主要是由于造血干/祖细胞中累积的基因突变造成细胞分化受阻并发生克隆性恶性增殖而引起的。目前治疗AML的主要手段仍然是高剂量化疗和异体造血干细胞移植。近年来,虽然越来越多的靶向药物进入临床,但是临床试验结果却并不乐观:一些靶向药物虽然初始反应率很高,但大多都会产生继发耐药性。因此,研究不同的基因突变如何协同作用诱发AML,对今后AML的基因诊断、预后和靶向治疗都有重要意义。在这项研究中,我们建立了一个基于CRISPR/Cas9体系的基因敲除文库,靶向200多个候选的AML驱动型突变拟,在表达过度激活的Flt3或Nras的基因工程小鼠中进行大规模的功能缺失型筛选, 以期发现能与之协同作用诱发AML的基因突变。为了后续的功能性验证实验,我们还开发了一个药物诱导的CRISPR/Cas9基因编辑体系,这一体系使得我们能以可控的方式对基因的表达进行干预,从而能够更加精确的研究该基因的生物学功能。
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DOI:--
发表时间:2019
期刊:Comput. Struct. Biotechnol. J.
影响因子:--
作者:Jingfang Zhang;Li Chen;Ju Zhang;Yu Wang
通讯作者:Yu Wang
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