转录因子QM的磷酸化过程与炎癌转化关系的研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    91229116
  • 项目类别:
    重大研究计划
  • 资助金额:
    90.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H3504.抗炎与免疫药物药理
  • 结题年份:
    2015
  • 批准年份:
    2012
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2013-01-01 至2015-12-31

项目摘要

The malignant transformation of unresolved inflammation is closely related to the expression and regulation of transcription factors, and transcription factors are usually involved in multiple steps of the malignant transformation. Parthenolide is a sesquiterpene lactone extracted from medical plants, which exhibits both anti-inflammatory and antitumor activities, depending on a wide range of intracellular signaling networks. Previous finding in our laboratory indicated that the phosphorylated QM is a target of parthenolide in tumor cells by proteomics analysis. Given that parthenolide can effectively inhibit NF-κ B in tumor cells, NF-κ B can promote the activity of JNK, and JNK is able to phosphorylate QM, we hypothesize that the pathway of NF-κ B -JNK-QM phosphorylation -inflammatory cytokine release-tumorigenesis may represent a new avenue in the malignant transformation from unresolved inflammation. Taken the phosphorylation of QM as a major step, the present project will conduct following studies to investigate the above hypothesis: a) NF-κ B activates JNK to phosphorylate QM; b) phosphorylated QM regulates the expression of cytokines, such as IL-1, IL-6, COX2, VEGF; and c) QM mediated cytokine releases result in the malignant transformation of unresolved inflammation in mice. This project will provide a key factor in the malignant transformation process from unresolved inflammation, which could be shared by multiple regulatory networks. Meanwhile, this project will also lead to better understanding of complex networking and regulation in the process of malignant transformation from unresolved inflammation.
非可控性炎症的恶性转化过程与转录因子的调控密切相关,现有证据表明转录因子参与了这一转化过程中的多个环节。本课题组通过蛋白组垂钓技术在肿瘤细胞中发现具有显著抗炎和抗肿瘤活性的小白菊内酯与转录因子QM的磷酸化形式具有高度亲和力。基于NF-κB是小白菊内酯发挥抗炎作用的直接靶标,NF-κB可提高蛋白激酶JNK活性,并且QM可被JNK磷酸化,我们推测在非可控性炎症恶性转化过程中存在NF-κB—JNK—QM磷酸化—炎症因子—肿瘤细胞发生间的新途径,从而导致癌症。本课题将以QM的磷酸化过程为切入点,阐述NF-κB激活JNK磷酸化QM,磷酸化后的QM介导IL-1、IL-6、COX2、VEGF等相关基因和炎症细胞因子异常表达调控的分子机制。本课题研究有望确定非可控性炎症恶性转化过程中多条网络调控通路共享的新型关键分子,增加对复杂网络调控系统的认知,为最终揭示非可控性炎症恶性转化的分子机制作出贡献。

结项摘要

非可控性炎症的恶性转化过程与转录因子的调控密切相关,现有证据表明转录因子参与了这一转化过程中的多个环节。本课题组前期通过蛋白组垂钓技术在肿瘤细胞中发现具有显著抗炎和抗肿瘤活性的小白菊内酯与转录因子QM 的磷酸化形式具有高度亲和力。为了验证磷酸化QM是非可控性炎症的恶性转化过程中的重要节点,本课题组从QM磷酸化过程的发现、磷酸化QM抗体制备、基于CRISPR-Cas9系统的人肝癌细胞QM基因定向编辑、细胞表型测定、ChIP-Seq和转录组分析以及信号通路研究等方面开展了工作,发现仅HepG-2中获得的QM在104位丝氨酸上发生磷酸化,QM磷酸化过程是肿瘤细胞中独有的现象。同时,制备了磷酸化QM抗体,抗体效价超过 1:80000,磷酸化多肽与非磷酸化多肽效价区分大于16,成为开展研究的有效工具。另一方面,通过CRISPR-Cas9系统基因编辑,获得了一株 QM敲除的HepG-2细胞株,经细胞增殖、侵袭、凋亡和克隆形成等实验发现QM仅抑制肿瘤细胞克隆的形成。ChIP-Seq数据显示QM作为转录因子主要作用于基因间区,处于内含子和基因上游20k之内的区域。qm在染色体上一共能识别六种motif。通过GO功能分析,peak相关基因与细胞增殖、生长、发育和信号转导等功能相关。结合motif结构和功能预测,获得了7种肿瘤相关基因,分别为TTC34、GUSBP1、NBPF10、STIM1、CDH12、PTPRN2和CTNND2。它们可能与QM相互结合,对下游基因进行转录调控。结合转录组分析数据,初步确认QM调控的基因是PTPRN2、STIM1和CTNND2。采用荧光素酶报告系统发现,QM对PTPRN2和STIM1启动子区域为抑制作用,对CTNND2是上调。随后,进一步发现磷酸化QM在NF-kB通路中与p50、p65、IKBα不存在相互作用,但与STAT3发生相互作用。因此,初步确定在HepG-2细胞质中STAT3调控了QM磷酸化,进入细胞核后QM作为转录因子,调控TTC34、STIM1和CTNND2等基因的表达,从而发挥抑制肿瘤细胞克隆形成的作用。本课题已公开中国专利二项,投稿SCI论文两篇。本研究初步阐明了QM 的磷酸化如何介导相关基因和炎症细胞因子的异常表达以及导致非可控性炎症的恶性转化,为进一步绘制以QM 为关键节点的非可控性炎症恶性转化过程的信号网络系统提供依据并奠定基础。

项目成果

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
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