酵母核糖体小亚基前体的结构

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    91540201
  • 项目类别:
    重大研究计划
  • 资助金额:
    290.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0502.分子生物物理
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2019-12-31

项目摘要

The ribosomal RNA (rRNA) is the most important non-coding RNA in organisms on earth. It associates with a large number of ribosomal proteins to form the ribosome and catalyzes protein synthesis. In eukaryotes, the assembly of small and large ribosome subunits is a conserved, highly complicated and dynamic process. Numerous assembly factors associate temporarily with the ribosome, forming a series of large pre-ribosomal particles. These pre-ribosomal particles mediate the modification, folding and processing of rRNA, assembly of ribosomal proteins and nuclear exportation. This project aims to determine the structure of several small subunit pre-ribosomes by using the advanced electron cryo-microscopy single-particle reconstruction technique and addtional structural information obtained by other methods. Our study is going to provide major insight into the molecular mechanism governing the small subunit assembly.
核糖体RNA是地球生物中最重要的非编码RNA,它和大量核糖体蛋白质组装形成核糖体,催化蛋白质的合成。在真核生物中,核糖体大小两个亚基的组装是个保守、高度复杂、动态的过程。在核糖体的体内组装过程中,有大量组装因子和核糖体亚基暂时结合,形成了一系列复杂的核糖体前体复合物。这些核糖体前体介导核糖体RNA修饰、折叠和加工、核糖体蛋白质的组装、以及核糖体的出核运输。本项目主要利用先进的冷冻电镜单颗粒重构技术,并综合其他手段获得的结构信息,解析在酵母核糖体小亚基组装过程中形成的多个核糖体前体结构,揭示小亚基组装的分子过程。

结项摘要

真核生物的核糖体在组装过程中形成一系列复杂的核糖体前体复合物。本项目主要利用整合型结构生物学技术解析酵母核糖体前体结构。我们解析了成熟态90S核糖体前体的4.5 Å冷冻电镜结构。结构显示新生核糖体小亚基折叠形成多个分离的亚结构域,并和大量组装因子结合。5' ETS、U3 snoRNA和大量组装因子形成巨大的基座,支撑着新生核糖体的结构。发现了U3 snoRNA和18S rRNA之间的新相互作用。我们还解析了一个核糖体大亚基核仁期前体的3.7 Å冷冻电镜结构。结构显示大亚基结构域 I, II 和 VI 已经形成类成熟结构,而结构域 III, IV 和 V 完全缺失,该结构代表大亚基的早期关键组装中间体。我们也分析了多个90S核糖体组装因子的结构和功能,这些结构有助于90S模型的搭建,并揭示那些在成熟90S中解离的组装因子的功能。我们的工作对于理解核糖体组装的结构和分子机制有重要意义。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Cryo-EM structure of an early precursor of large ribosomal subunit reveals a half-assembled intermediate.
大核糖体亚基早期前体的冷冻电镜结构揭示了半组装的中间体。
  • DOI:
    10.1007/s13238-018-0526-7
  • 发表时间:
    2019-03
  • 期刊:
    Protein & cell
  • 影响因子:
    21.1
  • 作者:
    Zhou D;Zhu X;Zheng S;Tan D;Dong MQ;Ye K
  • 通讯作者:
    Ye K
Integrative structural analysis of the UTPB complex, an early assembly factor for eukaryotic small ribosomal subunits.
UTPB复合物的整合结构分析,UTPB复合物是真核小核糖体亚基的早期组装因子
  • DOI:
    10.1093/nar/gkw562
  • 发表时间:
    2016-09-06
  • 期刊:
    Nucleic acids research
  • 影响因子:
    14.9
  • 作者:
    Zhang C;Sun Q;Chen R;Chen X;Lin J;Ye K
  • 通讯作者:
    Ye K
Molecular architecture of the 90S small subunit pre-ribosome
90S小亚基前核糖体的分子结构
  • DOI:
    10.7554/elife.22086
  • 发表时间:
    2017-02-28
  • 期刊:
    ELIFE
  • 影响因子:
    7.7
  • 作者:
    Sun, Qi;Zhu, Xing;Ye, Keqiong
  • 通讯作者:
    Ye, Keqiong
Structural and functional analysis of Utp24, an endonuclease for processing 18S ribosomal RNA.
Utp24(一种用于处理 18S 核糖体 RNA 的核酸内切酶)的结构和功能分析。
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0195723
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    PloS one
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    An W;Du Y;Ye K
  • 通讯作者:
    Ye K

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选择性自噬受体识别底物的结构机制
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2020
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  • 项目类别:
    面上项目
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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