基于宿主应答基因PTPN11多态性的剪接变异体与H.pylori-CagA的互作效应及其机制研究

批准号:
31800124
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
25.0 万元
负责人:
景晶晶
依托单位:
学科分类:
C0108.病原细菌学
结题年份:
2021
批准年份:
2018
项目状态:
已结题
项目参与者:
袁媛、陈莫耶、刘经纬、康丹、沈诗璇、陈晓慧、周荃
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中文摘要
宿主遗传背景对H.pylori感染者的临床转归具有重要影响。CagA+H.pylori菌株感染后与宿主细胞应答基因PTPN11直接结合形成复合体,引发细胞生物学效应。我们前期实验研究及生物信息学预测提示,PTPN11rs12229892G→A改变可能影响PTPN11基因选择性剪接,产生具有截短PTP结构域的变异剪接体,影响其与H.pyloriCagA相互作用的生物学效应。PTPN11变异剪接体是否降低原有的磷酸酶活性,失去ERK1/2激活及STAT3抑制作用,活化STAT3/BMP2/SMAD1通路诱导胃黏膜肠上皮化生,进而引起生物学效应表型的变化目前尚不清楚。本研究采用细胞培养、实验动物及人体组织标本,从体内外多角度研究PTPN11剪接变异体与H.pyloriCagA的互作效应及分子机制,旨在阐明H.pyloriCagA对靶向人群的致病作用及机制,为其精准治疗提供理论依据及研究基础。
英文摘要
The genetic background of the host has an important impact on the clinical outcome of H. pylori infection. After infection with CagA + H. pylori strain, the host cell response gene PTPN11 directly binds with CagA to form a complex, which leads to cell biological effects. Our previous experimental studies and bioinformatic predictions suggest that the G → A alteration of PTPN11 rs12229892 may affect the alternative splicing of PTPN11 gene and produce a mutant spliced variant with a truncated PTP domain that affects its interaction with H. pylori CagA and its biology effect. It is not clear whether the PTPN11 mutant spliceosome reduces the original activity of phosphatase, loses ERK1 / 2 activation and STAT3 inhibition, and activates the STAT3 / BMP2 / SMAD1 pathway to induce gastric mucosal intestinal metaplasia, leading to changes in the biological phenotype. In this study, cell culture, laboratory animals and human tissue samples were used to investigate the interaction and molecular mechanisms of PTPN11 splicing variants and H. pylori CagA, from multiple perspectives including in vitro and in vivo. We aimed at elucidating the pathogenesis and mechanism of H. pylori CagA for target population, to provide the theoretical basis and research foundation for its precise treatment.
宿主遗传背景对幽门螺杆菌(H.pylori)感染者的临床转归具有重要影响。CagA+H.pylori菌株感染后与宿主细胞应答基因PTPN11直接结合形成复合体,引发细胞生物学效应。本研究利用生物信息学、人体组织样本、体外细胞培养和实验动物等研究手段,全面地评价了PTPN11基因及其不同剪接变异体在胃癌发生发展中的作用及其与H.pylori(CagA)感染的相关性,研究了PTPN11rs12229892对PTPN11基因可变剪接的调控,及PTPN11剪接体与H.pylori(CagA)单独/相互作用对胃癌生物学效应的影响及机制。本研究发现,PTPN11基因在胃癌中高表达,PTPN11常态剪接体(PTPN11-1)在胃癌中高表达,PTPN11变异剪接体(PTPN11-2)在胃癌中低表达。H. pylori /CagA阳性组PTPN11的表达显著高于阴性组。PTPN11rs12229892G→A对PTPN11基因不同剪接变异体的表达未见显著影响。PTPN11-1可以促进胃癌细胞增殖、促进胃癌细胞迁移;PTPN11-2抑制胃癌细胞增殖,诱导胃癌细胞肠化表型。在CagA+ H. pylori的刺激下,PTPN11-1及PTPN11-2影响胃癌细胞增殖,但二者的磷酸酶活性未见显著差异。PTPN11-1可抑制STAT3通路,而PTPN11-2失去对STAT3通路的抑制作用。此外,利用转录组、蛋白组等多组学数据,生物信息学分析发现多个与PTPN11-1,PTPN11-2表达高度相关的基因及可变剪接,功能聚类发现,PTPN11-1相关基因细胞外基质相关通路正相关,PTPN11-2相关基因与细胞外基质相关通路负相关。在胃癌发病过程中,CagA+ H. pylori感染可与PTPN11共作用,影响代谢等相关通路。总之,本项目研究明确了PTPN11基因及其不同剪接变异体与CagA+ H. pylori的相互作用及其影响胃癌发生发展的重要作用,并揭示了其发挥作用的相关基因和潜在分子通路,为后续研究提供重要依据。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
The expression patterns and the diagnostic/prognostic roles of PTPN family members in digestive tract cancers
PTPN家族成员在消化道癌症中的表达模式及其诊断/预后作用
DOI:10.1186/s12935-020-01315-7
发表时间:2020-06-12
期刊:CANCER CELL INTERNATIONAL
影响因子:5.8
作者:Chen, Jing;Zhao, Xu;Jing, Jing-Jing
通讯作者:Jing, Jing-Jing
Comprehensive analysis of ceRNA network of ERCC4 in colorectal cancer.
结直肠癌ERCC4 ceRNA网络综合分析
DOI:10.7717/peerj.12647
发表时间:2021
期刊:PeerJ
影响因子:2.7
作者:Hu H;Liu S;Chu A;Chen J;Xing C;Jing J
通讯作者:Jing J
Expression profiles and prognostic roles of m6A writers, erasers and readers in gastric cancer
m6A 写入器、擦除器和读取器在胃癌中的表达谱和预后作用
DOI:10.2217/fon-2020-0630
发表时间:2021-04-21
期刊:FUTURE ONCOLOGY
影响因子:3.3
作者:Jing, Jing-Jing;Zhao, Xu;Yuan, Yuan
通讯作者:Yuan, Yuan
DOI:--
发表时间:2021
期刊:解剖科学进展
影响因子:--
作者:赵旭;景晶晶
通讯作者:景晶晶
Associations of individual and joint expressions of ERCC6 and ERCC8 with clinicopathological parameters and prognosis of gastric cancer
ERCC6和ERCC8个体和联合表达与胃癌临床病理参数和预后的关系
DOI:10.21203/rs.3.rs-117489/v1
发表时间:2020-12
期刊:PeerJ
影响因子:2.7
作者:Chen Jing;Li Liang;Sun Liping;Yuan Yuan;Jing Jingjing
通讯作者:Jing Jingjing
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