缺刻缘绿藻中ArA合成相关酶基因对氮饥饿响应的分子机理

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31172389
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    55.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1901.水产学基础
  • 结题年份:
    2015
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2015-12-31

项目摘要

缺刻缘绿藻(Myrmecia incisa)系单细胞绿藻,能够大量合成花生四烯酸(ArA),尤其在氮饥饿条件下,因脂肪酸去饱和酶及延长酶基因转录量的变化,使ArA的含量达到藻体干重的7%以上。那么该藻细胞是否存在类似PII这种信号转导非酶蛋白将氮饥饿信号与这些目标基因的转录联系起来,以合成ArA来度过氮饥饿等不良环境?为此,本申请项目计划在转录组高通量测序的基础上,重点捕获脂肪酸代谢有关的信号通路等信息;克隆PII蛋白、NtcA等基因,测定ATP、a-酮戊二酸、Gln等含量并分析它们与PII蛋白等基因转录量之间的关系;重点地利用基因组步移技术克隆D6和D5去饱和酶及延长酶等基因的启动子;尝试性地利用酵母双杂交或亲和层析等技术筛选与PII相互作用的蛋白或转录因子等。该研究有助于在ArA合成代谢途经基础上,通过信号通路及相关元件的分析更深入地探讨氮饥饿引起缺刻缘绿藻合成并积累ArA的分子机理。

结项摘要

缺刻缘绿藻(Myrmecia incisa)系单细胞绿藻,能够大量合成花生四烯酸(ArA),尤其在氮饥饿条件下,因脂肪酸去饱和酶及延长酶基因转录量的变化,使ArA的含量达到藻体干重的7%以上。那么该藻细胞是否存在类似PII这种信号转导非酶蛋白将氮饥饿信号与这些目标基因的转录联系起来,以合成ArA来度过氮饥饿等不良环境?为此,本申请项目通过转录组高通量测序、基因注释、脂类及类胡萝卜素代谢通路解析等,了解该藻具有C4样的光合固碳途径,预示这它可以生活在低碳环境下;在此基础上,捕获到与脂肪酸代谢有关的信号通路等信息;同时还克隆了编码该藻PII蛋白、N-乙酰-L-谷氨酸激酶(NAGK)、生物素羧基载体蛋白(BCCP)等基因,利用酵母双杂交技术证明PII与BCCP之间没有相互作用,而与NAGK之间存在相互作用,该作用被体外的免疫共沉淀实验证实,且它与PII蛋白基因的转录量之间也存在正相关,从而表明PII可能通过调控NAGK来合成精氨酸以达到重新分配细胞中氨基目的来适应氮饥饿环境;在D6去饱和酶基因的功能鉴定基础上,利用基因组步移技术克隆了它的启动子序列,发现存在感受氮信号等调控元件。同时,该研究还克隆了该藻的D9酰基-CoA去饱和酶、二酰甘油酰基转移酶、油体钙蛋白等基因并通过异源表达鉴定了它们的功能,探讨了它们在氮饥饿过程中对ArA及油脂合成的作用。该研究有助于在ArA合成代谢途经基础上,通过信号通路及相关元件的分析更深入地探讨氮饥饿引起缺刻缘绿藻合成并积累ArA的分子机理。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
缺刻缘绿藻二酰甘油酰基转移酶2(DGAT2)的基因特性与功能鉴定
  • DOI:
    10.3724/sp.j.1231.2013.38654
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    水产学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    房逢立;吴 洪;周志刚
  • 通讯作者:
    周志刚
Identification and characterization of three genes encoding acyl-CoA: diacylglycerol acyltransferase (DGAT) from the microalga Myrmecia incisa Reisigl
编码酰基辅酶 A 的三个基因的鉴定和表征:来自微藻 Myrmecia incisa Reisigl 的二酰基甘油酰基转移酶 (DGAT)
  • DOI:
    10.1016/j.algal.2015.09.007
  • 发表时间:
    2015-11-01
  • 期刊:
    ALGAL RESEARCH-BIOMASS BIOFUELS AND BIOPRODUCTS
  • 影响因子:
    5.1
  • 作者:
    Chen, Chun-Xiu;Sun, Zheng;Zhou, Zhi-Gang
  • 通讯作者:
    Zhou, Zhi-Gang
编码缺刻缘绿藻乙酰辅酶A羧化酶BCCP亚基的基因克隆与表达分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    水产学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李燕;周志刚
  • 通讯作者:
    周志刚
Transcriptome analysis reveals unique C4-like photosynthesis and oil body formation in an arachidonic acid-rich microalga Myrmecia incisa Reisigl H4301.
转录组分析揭示了富含花生四烯酸的微藻 Myrmecia incisa Reisigl H4301 独特的类 C4 光合作用和油体形成。
  • DOI:
    10.1186/1471-2164-14-396
  • 发表时间:
    2013-06-13
  • 期刊:
    BMC genomics
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Ouyang LL;Chen SH;Li Y;Zhou ZG
  • 通讯作者:
    Zhou ZG
缺刻缘绿藻转录组测序及脂质代谢相关基因注释
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    上海海洋大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陈思弘;周志刚
  • 通讯作者:
    周志刚

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  • 通讯作者:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    杨红娟

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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