本项目完成对世界菝葜科38个国家的调查采集，开展了I. 科系统发育及生物地理研究，揭示1)菝葜科起源于白垩纪末期；2）菝葜科存在4大分支，旧大陆分支物种分化明显快于新大陆，与近20Ma来欧亚大陆地质、气候剧烈变化有关；3）菝葜科约35Ma由新大陆向欧亚迁移；4）东亚-东南亚曾经历物种快速辐射（20-5Ma），与喜马拉雅横断山隆起相吻合；5）菝葜科物种传播能力强，适应多种生境和气候，鸟类迁徙起到传播；确认南美—夏威夷、北美—Azores岛屿、东南亚—斐济、南亚---非洲的传播为长距离传播；6）菝葜科物种在不同时期发生八次多方向跨洲际传播现象在被子植物中不多见，尤其从北半球亚热带起源的圆锥菝葜种类再次迁移返回南半球热带澳洲和非洲是新的发现；7）运用分子系统学对世界性单子叶植物科的研究结果再一次证明形态形状的重要性和传统分类的局限性，本研究对世界菝葜科的分类修订具有重要意义和价值；肖菝葜地位的重新确定，属下各组的重新划分表明形态性状与分子性状的结合是今后系统学研究的重要手段。II.菝葜重要复合种群物种分化及亲缘地理学研究揭示 1）横跨欧亚非大陆的基部类群S.aspera起源于欧洲；遗传上已分为环地中海和东非-南亚喜马拉雅2个隐秘种；2）东亚北美间断的针刺菝葜类群起源南美，向北迁移至墨西哥和加州，再向东至东亚、向西至东北美；3）东亚北美草本菝葜复合群起源东亚19.47Ma，8-10Ma经白令海峡到北美；北美东部分支应为一复合种；4）东亚广布的china多倍体复合种的多倍体群体在空间上占据整个复合种的80%地区，2x种群退却林下、岛屿和分布区边缘，是多倍体进化优势和遗传漂变的典型例子；S.biflora奄美和屋久群体是有趣的近期平行进化现象；2x china群体是独立单元；南投菝葜是大陆小果菝葜的岛屿亚种。III. 基于菝葜和肖菝葜cpDNA全基因组比较研究支持Liliales (Smilax)和Dioscoreales (Dioscorea)的姐妹关系。IV.本项目提出世界菝葜科分类新系统，仅菝葜1属4亚属20组199种; 确立ITS+matK+rbcL为鉴别条码；构建了世界菝葜数据库。完成论文9 篇，其中在国际上本领域Top、主流刊物已发表4篇（含MPE邀请Review），已接受1篇，在审1篇；近期投稿2篇。计划2013年6月前再投稿2篇，再用4年完成世界菝葜科专著。