季风环流影响下的南海海洋细菌多样性特征及其生物海洋学意义

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基本信息

  • 批准号:
    41230962
  • 项目类别:
    重点项目
  • 资助金额:
    300.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    D0604.生物海洋学与海洋生物资源
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2012
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2013-01-01 至2017-12-31

项目摘要

Bacteria, is of central importance in the ocean, mediate the fluxes of matter and energy, and responds to marine physical processes. Basinwide scale ocean general circulation driven by the monsoon in the South China Sea plays an important role in the fluctuation of the marine ecosystems. The distribution of bacteria associated with the monsoon circulation is yet poorly understood. In this study, samples will be collected annually in different seasons from set stations in the South China Sea. Parameters of oceanic physical processes, nutrient concentration and total biomass will be enumerated and analyzed. We will combine high-throughput pyrosequencing based culture-indepent and selectively isolation based culture-dependent methods to describe in detail bacterial diversity from these stations. Moreover, the dynamic of bacterial communities associated with oceanic physical process will be investigated, and the mechanism of response of bacterial community to the monsoon circulation will be further explained. This study will highlight that it is essential to consider the coupling between microbial and physical oceanography to fully understand the diversity and function of marine microbes. This work is also significant for more accurately incorporating the details of microbial diversity and physiology in to oceanographic models, and will contribute to the development of microbial oceanography.
季风驱动下的南海海盆尺度环流呈现显著的季节性变动过程,直接影响甚至控制着南海海洋生态系统的演化进程。海洋细菌作为海洋生态系统中物质能量流动的重要驱动力,积极响应着海洋动力过程。本项目拟在南海通过定点站位分季节多年度的重复采样,跟踪观测海洋动力要素,测定样品的化学及生物参数;应用高通量焦磷酸测序手段和纯培养选择性分离培养技术相结合的方法,系统研究南海海洋细菌多样性特征,探讨海洋细菌群落动态变化与海洋动力过程的关联,从而了解海洋细菌对季风环流过程的响应,揭示海洋细菌与海洋环境动力过程的耦合机制,进而阐述海洋细菌的生物海洋学意义。

结项摘要

季风驱动下的南海海洋动力过程有着季节性的多尺度变化特征,显著影响南海海洋生态系统的演化进程。海洋细菌作为海洋生态系统中物质循环和能量流动的重要组成部分,对环境变化和海洋多尺度动力过程有着积极的响应。本项目通过物理海洋学、生物海洋学、微生物学、生态学、遗传学等多个学科的交叉研究,进一步加深了对季风影响下南海中尺度与次中尺度动力过程的理解,揭示了南海上层水体中细菌群落的垂直层化特征和海盆尺度的经度分布格局,并从动力学角度解释了南海北部细菌群落结构对局地上升流和锋面过程的响应机制;分离、保藏海洋细菌4200余株,有效描述新科2个,新属8个,新物种15个;从遗传学及群体生物学层面解析了海洋细菌的生态适应机制,深化了南海细菌多样性对季风环流响应机制的理解。研究成果有望进一步推动南海海洋动力学及其生态环境效应的多学科交叉研究,有助于深入系统地认识海洋细菌的生物海洋学意义,明晰海洋动力过程在全球海洋生态系统中的重要调节作用,更好地服务于南海生态建设和海洋资源开发。. 已发表研究论文35篇,其中SCI论文27篇,编著专著1部;获授权发明专利1件;获2014年国家技术发明奖二等奖1项,2013年中国专利优秀奖1项,项目负责人获首届(2017)全国创新争先奖。培养博士研究生3人,硕士研究生7人。培养了一批青年科技人才,其中项目骨干1人获“国家自然科学基金杰出青年科学基金”,2人获“广东省杰出青年科学基金”。

项目成果

期刊论文数量(35)
专著数量(1)
科研奖励数量(3)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
Georgenia sediminis sp nov., a moderately thermophilic actinobacterium isolated from sediment
乔治亚·塞迪米尼斯 sp.
  • DOI:
    10.1099/ijs.0.051714-0
  • 发表时间:
    2013-11-01
  • 期刊:
    INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    You, Zhi-Qing;Li, Jie;Zhang, Si
  • 通讯作者:
    Zhang, Si
南海北部次中尺度过程数值研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    热带海洋学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    罗士浩;经志友;齐义泉;谢强
  • 通讯作者:
    谢强
Fabivirga thermotolerans gen. nov., sp nov., a novel marine bacterium isolated from culture broth of a marine cyanobacterium
Fabivirga 耐热菌 gen.
  • DOI:
    10.1099/ijsem.0.000839
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    M. Tang;C. Chen;J. Li;W. Xiang;H. Wu;J. Wu;S. Dai;H. Wu;T. Li;G. Wang
  • 通讯作者:
    G. Wang
Marinithermofilum abyssi gen. nov., sp. nov. and Desmospora profundinema sp. nov., isolated from a deep-sea sediment, and emended description of the genus Desmospora Yassin et al. 2009
深海海洋热丝菌 (Marinithermofilum abyssi gen.)
  • DOI:
    10.1099/ijs.0.000314
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    Yi Zhang;Jie Li;Xinpeng Tian;Si Zhang
  • 通讯作者:
    Si Zhang
Marine Cyanophages Demonstrate Biogeographic Patterns throughout the Global Ocean
海洋噬藻体展示了整个全球海洋的生物地理模式
  • DOI:
    10.1128/aem.02483-14
  • 发表时间:
    2015-01-01
  • 期刊:
    APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Huang, Sijun;Zhang, Si;Chen, Feng
  • 通讯作者:
    Chen, Feng

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其他文献

海洋放线菌研究进展
  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
    微生物学报
  • 影响因子:
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  • 作者:
    田新朋;张偲;李文均
  • 通讯作者:
    李文均
海洋沉积环境来源真菌次生代谢产物的研究
  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
    天然产物研究与开发
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  • 作者:
    黄智;王发左;张偲
  • 通讯作者:
    张偲
海洋放线菌Streptomyces sp.SCSIO 1934中次生代谢产物的分离和鉴定
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    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    中国中药杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    2.CAS Key Laboratory of Marine Bio-resources Susta;李苏梅;田新朋;胡涛;鞠建华;杨晓红;张偲;张长生;NIU Siwen1,2,LI Sumei2,TIAN Xinpeng2,HU Tao1,2,JU
  • 通讯作者:
    NIU Siwen1,2,LI Sumei2,TIAN Xinpeng2,HU Tao1,2,JU
基于RFLP技术的鹿角杯形珊瑚共附生固氮菌多样性分析
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    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    生态学报
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  • 作者:
    凌娟;龙丽娟;张偲;董俊德
  • 通讯作者:
    董俊德
南海深海沉积环境来源真菌Aspergillus sp. SCSIO F063的次生代谢产物研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    中国海洋药物
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    仲伟茂;曾奇;向瑶;田新朋;王发左;张偲
  • 通讯作者:
    张偲

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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