古菌是与细菌及真核生物并列的生命的第三种形式，是极具特色和研究价值的微生物资源。本项目以极端嗜盐古菌在特定条件下高效合成重要生物可降解塑料-聚羟基脂肪酸酯（PHA）这一生理现象为核心，首次系统揭示了嗜盐古菌PHA合成途径及其关键酶系，并在基因组水平探讨了其与初级代谢的偶联机制。重要研究成果包括：1）完成了2株嗜盐古菌PHA生产菌的基因组测序与分析，建立了其基因组高效操作的基因敲除系统；2）发现并解析了嗜盐古菌PHA合成途径中的关键酶如PhaA, PhaB, PhaE，PhaC等，证明由PhaE和PhaC两个亚基组成的PHA合酶在嗜盐古菌中普遍存在，并在系统研究嗜盐菌PHA合酶的基础上提出了III型PHA合酶可分为古菌亚型（IIIA）和细菌亚型（IIIB）的新概念；3）通过蛋白组学技术鉴定了嗜盐古菌PHA颗粒结合蛋白，发现了其重要新型结构蛋白PhaP和重要调控蛋白PhaR，并对相关功能进行了解析；4）发现许多嗜盐古菌均可利用葡萄糖等非相关碳源合成材料性能优良的聚羟基丁酸戊酸共聚酯（PHBV），揭示了嗜盐古菌PHBV重要前体丙酰-CoA合成的4条途径，并首次报道嗜盐古菌可固定CO2进入PHBV；5）通过基因组、转录组及蛋白组分析，探讨了嗜盐古菌PHBV合成与中心代谢、糖代谢、氨基酸代谢及能量代谢的关系；6）建立了嗜盐古菌发酵生产PHA的发酵工艺，并通过敲除嗜盐古菌胞外多糖合成基因簇，成功构建了PHBV合成能力提高的工程菌。7）为未来在基因组水平开展PHA代谢工程研究，还对上述两株嗜盐古菌基因组复制及稳定性等相关问题进行了研究。本研究形成了对嗜盐古菌PHA合成代谢的系统认识，代表了古菌PHA研究领域的国际前沿水平。 . 本研究已发表相关论文15篇，其中SCI论文13篇，申请国家发明专利4项，获授权专利2项。超额完成了项目指标。.