应用EWASs策略研究部分性癫痫的表观遗传学机制
批准号:
81371435
项目类别:
面上项目
资助金额:
70.0 万元
负责人:
肖波
依托单位:
学科分类:
H0913.神经电活动异常与发作性疾病
结题年份:
2017
批准年份:
2013
项目状态:
已结题
项目参与者:
刘鼎、李蜀渝、池连江、李艺、刘卫平、罗朝辉、胡凯、周瑾瑕、龙泓羽
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中文摘要
部分性癫痫是一类具有遗传倾向的多基因复杂性疾病,其临床表型多种多样,由遗传和环境因素共同影响着疾病的发生和发展,但其具体的发病机制尚未完全明确。研究表明,表观遗传学是重要的基因表达调控模式,其中DNA甲基化与部分性癫痫的发生发展密切相关。本项目拟应用表观基因组关联研究(EWASs)策略,采用Infinium@Human Methylation45芯片从全基因组范围内探讨部分性癫痫患者DNA甲基化模式,筛选癫痫相关的关键基因或位点。从系统生物学的角度出发,选用基于通路的甲基化数据分析,预测可能改变的蛋白结构和功能及影响的信号通路,从表观遗传学层面探讨关键基因甲基化对癫痫的影响,以揭示部分性癫痫发生的表观遗传学机制,并试图筛选到甲基化标志物,从而为进一步探讨癫痫发生的分子机制提供实验依据。
英文摘要
Partial epilepsy is a multi-gene complex disease with obvious genetic predisposition. Its clinical phenotype is extremely manifold affected by a variety of genetic and environmental factors and the specific pathogenesis is not clear. Studies have shown that epigenetics is a more important mechanism of regulation of gene expression, DNA methylation is closely related to the development of epilepsy. This study intends to adopt the strategy based on Epigenome Association Research (EWASs) to study the characteristics and differences of partial epilepsy patients' nuclear pedigrees DNA methylation mode within ultimately whole genomes using Infinium@Human Methylation45 chip, and to screen key genes or loci related to epilepsy. Pathway based methylation data analysis method would be used to predict the structure,function and signal pathway of protein that may be changed from the perspective of systems biology, and then to discuss the influence of the key gene methylation on epilepsy from the view of epigenetics to reveal the epigenetic mechanisms during epileptogenesis. We attempt to get filtered methylation markers to provide experimental evidence for revealing the molecular mechanism of epilepsy.
颞叶癫痫(temporal lobe epilepsy, TLE)是成人部分性癫痫最常见的形式,由遗传和环境因素共同影响疾病的发生和发展。DNA甲基化是目前研究得最好的表观遗传学机制之一。近年研究表明,TLE的发生和发展可能与DNA甲基化有关,但其具体的发病机制尚未完全明确。本研究利用甲基化芯片对TLE患者及健康对照者进行全基因组DNA甲基化检测,筛选差异甲基化编码基因、miRNA和lncRNA,运用生物信息学方法进行功能分析深入探究其与TLE发生发展的内在关联。结果发现,TLE患者外周血全基因组水平存在甲基化异常,编码基因、miRNA和lncRNA基因甲基化均存在变化,以甲基化程度升高为主。差异甲基化编码基因、miRNA和lncRNA基因参与多条生物学通路,甲基化改变可能在TLE发病及耐药机制中起到重要作用。焦磷酸测序验证了部分甲基化芯片结果的准确性。全基因组DNA甲基化研究不仅能够加深对TLE疾病机制的理解,而且有助于找到TLE或临床相关的生物标记物,进而对TLE的诊断和治疗提供新的靶点和导向。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Ultra-high-resolution 3D digitalized imaging of the cerebral angioarchitecture in rats using synchrotron radiation
使用同步辐射对大鼠脑血管结构进行超高分辨率 3D 数字化成像
DOI:10.1038/srep14982
发表时间:2015-10-07
期刊:SCIENTIFIC REPORTS
影响因子:4.6
作者:Zhang, Meng-Qi;Zhou, Luo;Xiao, Bo
通讯作者:Xiao, Bo
Lack of Association between SLC6A11 Genetic Polymorphisms and Drug Resistant Epilepsy in Chinese Han Population
SLC6A11基因多态性与中国汉族人群耐药性癫痫之间缺乏关联
DOI:10.7754/clin.lab.2017.161217
发表时间:2017
期刊:Clinical Laboratory
影响因子:0.7
作者:Xie Y. Y.;Qu J.;Zhou L.;Lv N.;Gong J. E.;Cao Y. Z.;Long L. L.;Long H. Y.;Xiao B.
通讯作者:Xiao B.
MicroRNA-139-5p negatively regulates NR2A-containing NMDA receptor in the rat pilocarpine model and patients with temporal lobe epilepsy
MicroRNA-139-5p在大鼠毛果芸香碱模型和颞叶癫痫患者中负向调节含NR2A的NMDA受体
DOI:10.1111/epi.13568
发表时间:2016-11-01
期刊:EPILEPSIA
影响因子:5.6
作者:Alsharafi, Walid A.;Xiao, Bo;Li, Jing
通讯作者:Li, Jing
DOI:--
发表时间:2015
期刊:中风与神经疾病杂志
影响因子:--
作者:颜艳;冯莉;肖波
通讯作者:肖波
Decrease of DISC1 Gene Expression is Associated With Increase of GSK3Beta Expression and Memory Loss of Mice Upon Aging
DISC1 基因表达的减少与 GSK3Beta 表达的增加和小鼠衰老时的记忆丧失有关
DOI:--
发表时间:2015
期刊:Journal of Neurological Sciences-Turkish
影响因子:--
作者:Feng Li;Wu Qian;Xiao Bo;Li Yi;Shu Yi;Yue Zongwei;Wang Yelan;Chen Si;Liu Weiping
通讯作者:Liu Weiping
新候选基因CDK19突变致早发性癫痫性脑病发病的机制研究
- 批准号:81974206
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:59.0万元
- 批准年份:2019
- 负责人:肖波
- 依托单位:
甲基化和非编码RNA调控Shanks表达在癫痫发生中的机制研究
- 批准号:81671299
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:57.0万元
- 批准年份:2016
- 负责人:肖波
- 依托单位:
探讨调控海马新生神经元DISC1的表达干预癫痫发生的机制
- 批准号:81071048
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:30.0万元
- 批准年份:2010
- 负责人:肖波
- 依托单位:
Tat-CdSe/ZnS量子点活体追踪阿尔茨海默病的Aβ42蛋白变化
- 批准号:30770736
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:29.0万元
- 批准年份:2007
- 负责人:肖波
- 依托单位:
利用纳米结构MNDCC的二元协同性治疗脑血栓的实验研究
- 批准号:30370514
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:18.0万元
- 批准年份:2003
- 负责人:肖波
- 依托单位:
从SMN相互作用蛋白深入探讨脊肌萎缩症的发病机制
- 批准号:30170330
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:16.0万元
- 批准年份:2001
- 负责人:肖波
- 依托单位:
从B7:CD28/CTLA-4探讨雷公藤多甙治疗PM的作用机制
- 批准号:39870909
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:12.0万元
- 批准年份:1998
- 负责人:肖波
- 依托单位:
国内基金
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