基因工程化CRISPR/Csy4-新型抗HIV-1分子靶向药物的研发及机理研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81601449
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    17.5万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1112.免疫治疗及其机制
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2019-12-31

项目摘要

Highly active anti-retroviral therapy(HAART) function by inhibiting, rather than eliminating HIV-1 virus. As a result, they cannot completely cure the disease. The recent success in engineering CRISPR/Cas9 in gene targeting and employing substrate-linked protein evolution approach to redirect Cre DNA recombinase to recognize the HIV-1 DNA has highlighted the promise to cure AIDS. Our previous study has demonstrated that the CRISPR/Csy4 specifically recognizes a hairpin RNA that is highly homologous to the HIV-1 LTR-RNA. When incorporated the hairpin into the HIV-1 LTR, Csy4 destroys the virus at different steps of the infection, including post-transcription, viral packaging, and pro-virus DNA integration. In this study, we propose to employ a bacteria-based evolution approach to engineer the Csy4 protein, so that it can specifically recognize and cut the HIV-1 LTR RNA sequence. By examining the function of the engineered Csy4 and its underlying molecular mechanisms in HIV-1 cell models, we hope to develop a new generation of anti-HIV-1 drug, aiming to completely cure AIDS in near future.
高效抗反转录病毒治疗(highly active anti-retroviral therapy, HAART)能显著抑制HIV病毒,然而因其不能杀灭病毒而最终导致病毒耐药及疾病复发。高特异性CRISPR/Cas9基因编辑技术及识别HIV-LTR的Cre酶的基因工程改造成功,为根治HIV带来了希望。课题申请人前期研究发现:CRISPR/Csy4特异性识别的RNA发夹结构同HIV-1-LTR序列高度同源,基因工程改造的Csy4能从病毒转录、病毒包装及前病毒DNA整合等多个环节起抗HIV-1病毒作用。本课题拟在前期工作的基础上,结合基因工程技术对野生型Csy4进行优化改造,以筛选出能特异识别并酶切HIV-LTR的Csy4,并深入探讨其抗HIV-1作用的分子机理,研发出具有我国自主产权的新型抗HIV-1药物。

结项摘要

现有的抗HIV-1病毒药物因不能彻底清除病毒而需要终身服药。高特异性CRISPR/Cas9及识别HIV-LTR的Cre酶的基因工程改造成功为根治HIV带来了希望。课题申请人前期研究发现:CRISPR/ Csy4特异性识别的RNA发夹结构同HIV-1-LTR序列高度同源,并且计算机折叠模型显示,两者具有异常相似的二维结构。我们已经发表的结果证实:eCsy4能从HIV-1转录后、病毒包装及前病毒DNA整合等多个环节起抗HIV-1病毒作用。本课题拟在前期工作的基础上,结合基因工程技术对野生型Csy4进行优化改造,以筛选出能特异识别并酶切HIV-LTR的eCsy4,并深入探讨其抗HIV-1作用的分子机理,研发出具有我国自主产权的新型抗HIV-1药物?

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
Profiling the epigenetic interplay of lncRNA RUNXOR and oncogenic RUNX1 in breast cancer cells by gene in situ cis-activation
通过基因原位顺式激活分析乳腺癌细胞中 lncRNA RUNXOR 和致癌 RUNX1 的表观遗传相互作用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    American Journal of Cancer Research
  • 影响因子:
    5.3
  • 作者:
    Nie Yuanyuan;Zhou Lei;Wang Hong;Chen Naifei;Jia Lin;Wang Cong;Wang Yichen;Chen Jingcheng;Wen Xue;Niu Chao;Li Hui;Guo Rui;Zhang Songling;Cui Jiuwei;Hoffman Andrew R;Hu Ji Fan;Li Wei
  • 通讯作者:
    Li Wei
Epigenetic Targeting of Granulin in Hepatoma Cells by Synthetic CRISPR dCas9 Epi-suppressors.
通过合成 CRISPR dCas9 表观抑制剂对肝癌细胞中颗粒蛋白进行表观遗传靶向
  • DOI:
    10.1016/j.omtn.2018.01.002
  • 发表时间:
    2018-06-01
  • 期刊:
    Molecular therapy. Nucleic acids
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Wang H;Guo R;Du Z;Bai L;Li L;Cui J;Li W;Hoffman AR;Hu JF
  • 通讯作者:
    Hu JF

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其他文献

中医七情学说及其临床应用概述 The Seven Emotions Theory of Traditional Chinese Medicine and Its Clinical Application
中医七情理论及其临床应用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    郭平;郝一鸣;许朝霞;郭睿
  • 通讯作者:
    郭睿
An Effective Clutter Suppression Approach Based on Null-Space Technique for the Space-Borne Multichannel in Azimuth High-Resolution and Wide-Swath SAR System
基于零空间技术的方位向高分辨率宽测绘带SAR系统天载多通道杂波有效抑制方法
  • DOI:
    10.1109/tgrs.2021.3084696
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    IEEE TRANSACTIONS ON GEOSCIENCE AND REMOTE SENSING
  • 影响因子:
    8.2
  • 作者:
    张双喜;蒋哲艺;Junli Chen;李少杰;刘艳阳;郭睿;邢孟道
  • 通讯作者:
    邢孟道
中医诊断工程技术研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    生物医学工程学进展
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王忆勤;郭睿
  • 通讯作者:
    郭睿
528例冠心病患者中医脉象非线性动力学特征在证候诊断模型中的应用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    中华中医药杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    郭睿;徐琎;夏春明;王忆勤
  • 通讯作者:
    王忆勤
铜冷却壁氢脆破坏现象的试验
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    钢铁
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李峰光;祁成林;叶四友;史秋月;郭睿;刘建永
  • 通讯作者:
    刘建永

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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