环二鸟苷酸(c-di-GMP)的手性催化功能研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21703132
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    24.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0202.催化化学
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2020-12-31

项目摘要

A small cyclic RNA termed cyclic diguanylate monophosphate (c-di-GMP) has been demonstrated as a second messenger for signal transduction and regulation in a wide variety of bacteria, yet its catalytic behaviors are still largely elusive. In this project, we are going to investigate the enantioselective catalytic function of c-di-GMP. On the basis of chemically synthesized c-di-GMP and its conformational investigation, c-di-GMP based enantioselective catalytic system will be constructed followed by expanding to various reaction types. In order to understand the mechanism, the kinetic process of c-di-GMP based enantioselective catalysis will be deeply studied by various spectroscopic techniques. Furthermore, c-di-GMP catalysis will be attempted to transfer into cells to explore its potential new role in cellular process. This project aims to develop a novel RNA based enantioselective catalytic model, reveal the catalytic properties of second messengers and pave the way to explore the enantioselective catalytic performance of RNA in nature.
环二鸟苷酸(c-di-GMP)是一种环状的RNA分子,它作为第二信使分子广泛分布在细菌中参与信号传导和调节生理过程,但是对于其催化功能研究还鲜有报道。本项目开展c-di-GMP的手性催化功能研究:采用化学法合成c-di-GMP,研究其空间构型,构筑c-di-GMP的手性催化体系,进一步拓展手性反应的类型,建立c-di-GMP的手性催化模型;结合光谱和波谱表征,深入研究c-di-GMP手性催化反应的动力学过程,认识c-di-GMP手性催化的微观机理;初步研究细胞中c-di-GMP的催化反应,发掘其潜在的生物新角色。该项目旨在开发一种新的RNA手性催化体系,揭示第二信使分子的催化功能,为探索自然界中RNA的手性催化功能提供研究基础。

结项摘要

人工DNA金属酶的构建可实现将核酸手性转移到产物,解决了一些水相中的重要不对称合成反应,但精准构建简单高效的人工金属核酸酶仍是本领域的发展瓶颈。本项目拟开展基于c-di-AMP和ATP人工金属核酸酶的组装及其催化性能研究。研究发现c-di-AMP和Cu2+可以组装形成人工c-di-AMP金属酶,对一系列水相中的不对称反应表现出优异的手性催化活性,ee值最高达到97%。c-di-AMP金属酶的手性催化活性取决于CDN的环状结构和嘌呤碱基。光谱表征和理论计算表明Cu2+和c-di-AMP的N7、磷酸基相互作用形成二聚体结构参与到手性反应中。研究发现ATP和Cu2+可以自组装形成Cu(II)-ATP表现出优异的手性催化活性,ee最高达到84%。控制实验、光谱表征和理论计算结果表明,Cu2+和ATP的β-位、γ-位的磷酸基和N7原子相互作用形成ATP杂化催化剂发挥手性催化功能。上述研究构筑了结构简单的人工核酸金属酶并实现其高效手性催化,为理性设计简单高效的核酸杂化催化剂提供研究基础。另外,c-di-AMP和ATP是天然的核酸分子,该研究为发掘它们在自然界的潜在催化功能提供理论依据。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
An Efficient Cyclic Di-AMP Based Artificial Metalloribozyme for Enantioselective Diels-Alder Reactions
用于对映选择性 Diels-Alder 反应的高效环状二腺苷基人工金属核酶
  • DOI:
    10.1002/ejoc.202000652
  • 发表时间:
    2020-06
  • 期刊:
    European Journal of Organic Chemistry
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    Qi Qianqian;Lv Shuting;Hao Min;Dong Xingchen;Gu Youkun;Wu Peizhe;Zhang Wenyue;Chen Yashao;Wang Changhao
  • 通讯作者:
    Wang Changhao
A Cu(II)-ATP complex efficiently catalyses enantioselective Diels-Alder reactions.
Cu(II)-ATP 复合物有效催化对映选择性 Diels-Alder 反应
  • DOI:
    10.1038/s41467-020-18554-x
  • 发表时间:
    2020-09-22
  • 期刊:
    Nature communications
  • 影响因子:
    16.6
  • 作者:
    Wang C;Qi Q;Li W;Dang J;Hao M;Lv S;Dong X;Gu Y;Wu P;Zhang W;Chen Y;Hartig JS
  • 通讯作者:
    Hartig JS
Solvent dispersion triggered the formation of NiFe-gel as an efficient electrocatalyst for enhancing the oxygen evolution reaction
溶剂分散引发 NiFe-凝胶的形成,作为增强析氧反应的有效电催化剂
  • DOI:
    10.1039/d0cc00814a
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Chemical Communications
  • 影响因子:
    4.9
  • 作者:
    Wang Hongkai;Zhu Weihuang;Xue Qi;Wang Changhao;Liu Kaiqiang
  • 通讯作者:
    Liu Kaiqiang
Highly Efficient Cyclic Dinucleotide Based Artificial Metalloribozymes for Enantioselective Friedel-Crafts Reactions in Water
用于水中对映选择性傅克反应的高效环状二核苷酸基人工金属核酶
  • DOI:
    10.1002/anie.201912962
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Angewandte Chemie International Edition
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Wang Changhao;Hao Min;Qi Qianqian;Dang Jingshuang;Dong Xingchen;Lv Shuting;Xiong Ling;Gao Huanhuan;Jia Guoqing;Chen Yashao;Hartig Joerg S.;Li Can
  • 通讯作者:
    Li Can
Chemical synthesis, purification, and characterization of 30-50-linked canonical cyclic dinucleotides (CDNs)
30-50 个连接的典型环状二核苷酸 (CDN) 的化学合成、纯化和表征
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Methods in Enzymology
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Changhao Wang;Min Hao;Qianqian Qi;Yashao Chen;Joerg S. Hartig
  • 通讯作者:
    Joerg S. Hartig

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其他文献

DNA催化水相体系中的二硫缩醛反应(英文)
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    Acta Chimica Sinica
  • 影响因子:
    2.5
  • 作者:
    王长号;李英豪;贾国卿;卢胜梅;刘;李灿
  • 通讯作者:
    李灿

其他文献

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王长号的其他基金

核算催化化学
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2022
  • 资助金额:
    200 万元
  • 项目类别:
    优秀青年科学基金项目
环状RNA人工金属酶主客体相互作用及手性催化构效关系
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  • 项目类别:
    面上项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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