猪7号染色体上影响肢蹄结实度主效基因的分离和鉴别
结题报告
批准号:
31060153
项目类别:
地区科学基金项目
资助金额:
25.0 万元
负责人:
郭源梅
依托单位:
学科分类:
C0602.基因表达及非编码序列调控
结题年份:
2013
批准年份:
2010
项目状态:
已结题
项目参与者:
肖石军、杨斌、李骏、邱青松、陈浩
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中文摘要
肢蹄不结实不仅影响猪的正常生长和猪的福利,也影响种猪的使用寿命,因此给养猪业带来巨大的经济损失。虽然有很多学者对这一性状进行过深入的研究,但是对这个性状的遗传基础还是知之甚少。申报单位以自身构建的白色杜洛克×二花脸资源家系为研究材料,通过对1484个F2个体的全基因组扫描,已经把一个影响肢蹄结实度的主效基因定位在猪7号染色体SW1856和S0102之间(一个7cM的区间内)。本项目在这一基础上,拟通过增加这个区域内微卫星标记的密度,进行QTL精细定位,以缩小这个QTL的置信区间。然后判断F1代个体的QTL基因型和构建F1个体的单倍型,采用IBD分析和断点重组分析,进一步缩小这个QTL的置信区间。再采取位置候选基因的研究策略,寻找控制猪肢蹄结实度的候选基因及其因果突变位点。最后在远缘商业群体中进行初步验证,为猪肢蹄结实度的遗传改良奠定分子基础。
英文摘要
本研究在杜长大、苏太、莱芜猪和二花脸4个群体中对14个肢蹄结实度性状进行了测定,并分析了群体、性别和前后肢对肢蹄结实度的影响,以及这11个性状之间的相关系数。分析结果表明:不同的群体之间,肢蹄结实度存在显著差异;母猪的肢蹄比公猪要结实一些;前肢的肢蹄也显著的比后肢结实。关节评分与肢蹄评分、蹄趾评分和步态评分之间的无相关,因此,不能用外在的肢蹄评分、蹄趾评分和步态评分替代关节评分。接下来,利用猪60K SNP芯片,扫描苏太和F2个体,并进行了全基因组关联分析。分析结果验证了F2群体7号染色体上的QTL定位结果。通过连锁不平衡分析,把该QTL精细定位在一个2.15Mb的区域内。该区域内共有31个基因,根据这些基因的功能,选取了HMGA1、C6orf106和ENSSSCG00000023160基因作为位置功能候选基因,并在F2群体中对这3个基因进行全基因测序,分别搜索到10、174和5个多态位点。根据多态位点的保守性,分别选取了3个HMGA1和3个C6orf106多态位点,对F2个体进行基因型检测。C6orf106的3个位点还在苏太和杜长大群体中进行了检测。ENSSSCG00000023160基因的5个多态位点通过基因填补的方法获取F2个体的基因型。最后,对这11个多态位点进行关联分析。分析结果显示HMGA1基因的g.2029C>T和g.3155A>G在F2群体中与肱二头肌和步态评分成极显著关联,且与最强关联点之间的差异极小,因此HMGA1基因极有可能是影响肢蹄结实度的因果基因。C6orf106基因3个多态位点在F2群体中和肢蹄结实度相关联,但是关联程度不是很强;在苏太和杜长大群体中均无关联。考虑到该基因还有171个多态位点没有检测,因此暂时不能排除它是肢蹄结实度因果基因的可能性。ENSSSCG00000023160基因在F2群体中只和前肢的步态评分有关联,且关联程度不是很强,因此,可以排除它是肢蹄结实度因果基因的可能性。
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DOI:--
发表时间:2013
期刊:猪业科学
影响因子:--
作者:候利娟;张徐非;郭源梅;
通讯作者:
DOI:--
发表时间:2013
期刊:江西农业大学学报
影响因子:--
作者:杨怀谷;张徐非;候利娟;洪渊;任军;郭源梅
通讯作者:郭源梅
DOI:10.2527/jas.2012-6210
发表时间:2013-09-01
期刊:JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE
影响因子:3.3
作者:Guo, Y. M.;Zhang, X. F.;Huang, L. S.
通讯作者:Huang, L. S.
利用多个实验群体解析猪保幼带形成及其自然消褪的遗传机制
  • 批准号:
    31972542
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    57.0万元
  • 批准年份:
    2019
  • 负责人:
    郭源梅
  • 依托单位:
利用多个实验群体解析猪7号染色体上影响脂肪沉积的因果基因
  • 批准号:
    31660303
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    40.0万元
  • 批准年份:
    2016
  • 负责人:
    郭源梅
  • 依托单位:
猪7 号染色体上影响料肉比主效QTL 的分子遗传机理解析
  • 批准号:
    31460590
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    55.0万元
  • 批准年份:
    2014
  • 负责人:
    郭源梅
  • 依托单位:
国内基金
海外基金