IgA肾病IgA1糖化缺陷及补体活化异常相关基因的精细定位及功能研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81370015
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    70.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H0503.原发性肾脏疾病
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2017-12-31

项目摘要

The pathogenesis of IgAN is incompletely understood yet. Recently it has been found that the disease is correlated with Galactose-Deficient IgA1 and aberrant activation of alternative pathway of complement system. A recent extended whole genome wide association study identified one susceptible locus at 1q31 region which cover the regulator complement activation region (RCA). We have successfully identified 5 independent susceptible loci of Gd-IgA1 and established the methods for testing copy number variation (CNV) of RCA by MLPA and Taqman methods. To carry out fine mapping, we plan to perform exome sequencing to identify candidate genes. Replication study will be conducted in new recruited families as well as sporadic IgAN patients with high Gd-IgA1 levels. We are further about to test the CNV of RCA region in both IgAN patients and healthy controls from an extended cohort, analyze the correlation between RCA CNV and IgAN via association analysis approach and study the biological function of CNV in RCA region through blood, urine and renal tissue complement component testing. The function of candidate variations will be further confirmed by cell model or knock-out mice model. Our study is very important to clarify genetic mechanism of IgAN.
IgA肾病(IgAN)机制不明。最近发现糖化缺陷IgA1(Gd-IgA1)和补体旁路途径异常活化与IgAN密切相关,同时一项全基因组关联分析将IgAN易感基因定位于1q31补体调节区域(RCA)。为探索这两项重要机制的遗传学基础,本课题组已应用QTL连锁分析成功将Gd-IgA1的易感基因定位在5个独立区段,并采用MLPA和Taqman探针方法建立RCA拷贝数变异(CNV)的检测方法。课题组拟采用外显子组测序,对上述易感区段进行精细定位,并在其他高Gd-IgA1家系及散发患者中验证候选基因。同时,拟对大组IgAN患者和正常人进行RCA区域CNV检测,通过关联分析明确候选基因CNV与IgAN之间的相关性,通过对患者血、尿、肾组织补体相关因子的检测阐明其生物学功能。识别出的致病基因通过基因敲除小鼠以及细胞模型验证其功能。本研究对揭示IgAN遗传机制有重要意义。

结项摘要

本课题以我国发病率最高、危害最大的肾小球肾炎,IgA肾病作为研究对象。聚焦IgA1分子糖化障碍和补体活化异常这两项IgAN重要病理生理机制,应用高通量测序、关联分析、拷贝数变异分析、和分子生物学等知识和技术,深入研究其遗传学背景和临床意义,取得系列的研究结果:1)通过拷贝数变异(CNV)研究对CFH因子所在补体调节区域进行精细定位,首次发现CFHR1和CFHR3拷贝数缺失为IgA肾病保护性遗传变异,携带该遗传变异患者间质病变较轻;2)发现补体凝集素途径的启动分子MBL和L-ficolin的遗传变异存在协同作用,加速IgAN患者的肾功能恶化;3)通过关联分析发现G1GALT1和C1GALT1C1的2个遗传位点与糖基化异常IgA1 (Gd-IgA1)相关,可分别解释7%欧洲人和2%亚洲人的血清Gd-IgA1水平变化;4)通过候选位点关联分析,发现HLA-DQ/DR与ST6GAL1常见遗传变异与IgAN预后相关,rs2856717 (HLA-DQ/DR,HR=1.92, 95%CI 1.07-3.43)和rs7634389 (ST6GAL1 c.-182-18109T>C, HR=2.05, 95%CI 1.34-3.12)存在协同效应,同时携带危险等位基因的患者(rs2856717/CT or TT, rs7634389/TT or TC)进展至终点事件的风险增加4倍(HR=4.24, 95%CI 1.81-9.92);5)Gd-IgA1与基线MAP、UA、血清白蛋白、IgA、IgG水平等具有显著正相关,而与基线eGFR存在显著负相关。采用Cox风险比例模型对Gd-IgA1水平与ESRD的发生进行回归分析,经基线临床参数校正后,与疾病进展风险独立相关(HR=2.45, 95%CI 1.12-5.37)。本课题共发表课题标注论文14篇,其中SCI收录10篇,包括JASN、Kidney International,JMCB等国际高水平杂志,累计影响因子54.2分,中文核心期刊4篇。本研究紧扣临床,所取得一系列原创性成果对推动我国IgAN基础和临床研究具有重要意义,获得2017年教育部科学技术进步奖一等奖(第二完成人)。

项目成果

期刊论文数量(14)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Underweight Is an Independent Risk Factor for Renal Function Deterioration in Patients with IgA Nephropathy.
体重不足是 IgA 肾病患者肾功能恶化的独立危险因素
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0162044
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    PloS one
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Ouyang Y;Xie J;Yang M;Zhang X;Ren H;Wang W;Chen N
  • 通讯作者:
    Chen N
ABO blood type is associated with renal outcomes in patients with IgA nephropathy.
ABO 血型与 IgA 肾病患者的肾脏结局相关
  • DOI:
    10.18632/oncotarget.20701
  • 发表时间:
    2017-09-26
  • 期刊:
    Oncotarget
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Yang M;Xie J;Ouyang Y;Zhang X;Shi M;Li X;Wang Z;Shen P;Ren H;Zhang W;Wang W;Chen N
  • 通讯作者:
    Chen N
COL4A3 mutations cause focal segmental glomerulosclerosis (vol 6, pg 498, 2014)
COL4A3 突变导致局灶节段性肾小球硬化(第 6 卷,第 498 页,2014 年)
  • DOI:
    10.1093/jmcb/mjv023
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    JOURNAL OF MOLECULAR CELL BIOLOGY
  • 影响因子:
    5.5
  • 作者:
    Xie Jingyuan;Wu Xiaoxi;Ren Hong;Wang Weiming;Wang Zhaohui;Pan Xiaoxia;Hao Xu;Tong Jun;Ma Jun;Ye Zhibin;Meng Guoyu;Zhu Yufei;Kiryluk Krzysztof;Kong Xiangyin;Hu L;ian;Chen Nan
  • 通讯作者:
    Chen Nan
Distinct metabolic profile of primary focal segmental glomerulosclerosis revealed by NMR-based metabolomics.
基于 NMR 的代谢组学揭示了原发性局灶节段性肾小球硬化的独特代谢特征
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0078531
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    PloS one
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Hao X;Liu X;Wang W;Ren H;Xie J;Shen P;Lin D;Chen N
  • 通讯作者:
    Chen N
Inflammatory Bowel Disease: MR-and SPECT/CT-based Macrophage Imaging for Monitoring and Evaluating Disease Activity in Experimental Mouse Model-Pilot Study
炎症性肠病:基于 MR 和 SPECT/CT 的巨噬细胞成像,用于监测和评估实验小鼠模型试点研究中的疾病活动
  • DOI:
    10.1148/radiol.13122254
  • 发表时间:
    2014-05-01
  • 期刊:
    RADIOLOGY
  • 影响因子:
    19.7
  • 作者:
    Wu, Yingwei;Briley-Saebo, Karen;Tao, Xiaofeng
  • 通讯作者:
    Tao, Xiaofeng

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其他文献

中国原发性肾小球肾炎概况
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    --
  • 发表时间:
    2013
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    2021
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李想;欧阳彦;谢静远
  • 通讯作者:
    谢静远
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  • DOI:
    10.3760/cma.j.cn441217-20211203-00075
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
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    --
  • 作者:
    谢静远;欧阳彦;陈靖;丁峰;顾乐怡;朱立峰;冯东雷;宋艳艳;俞章盛;任红;陈楠
  • 通讯作者:
    陈楠
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    徐天;谢静远;任红;陈楠
  • 通讯作者:
    陈楠
Ⅰ型原发性草酸尿症家系AGT 基因新突变鉴定
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    中国实用内科杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    谢静远;刘章锁;贾晓媛;陈楠
  • 通讯作者:
    陈楠

其他文献

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AI技术路线图

谢静远的其他基金

空气颗粒物通过调控白血病抑制因子参与影响IgA肾病进展的作用与机制研究
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定量性状位点连锁分析定位家族性IgA肾病糖基化异常IgA1基因
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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