参与核小体组装的人源CAF-1与组蛋白H3.1-H4复合物的结构研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31300614
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    22.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0501.结构生物学
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Chromatin assembly factor 1 (CAF-1) is one of the histone chaperones involved in nucleosome assembly during DNA replication and repair. Newly synthesized H3.1-H4 first binds to the antisilencing function 1(ASF1) as a dimer, and ASF1 transfers H3.1-H4 dimer to the downstream chaperone CAF-1. CAF-1 targets H3.1-H4 and deposits them to newly synthesized DNA, which finished the first step of nucleosome assembly. To date, how CAF-1 specific recognizing H3.1 and which oligomerization state of H3.1-H4 binding to CAF-1 are not known. In this project, we plan to determine the cyrstal structure of human CAF-1 in complex with histones H3.1-H4 by X-ray crystallography. The structure of the CAF-1-H3.1-H4 complex will uncover how CAF-1 binding with histones H3.1-H4. Based on the structure, we will design the mutagenesis of CAF-1. By a combination of biochemical methods such as pull down and Co-IP, and cell-based fluorescent co-localization technique, we are trying to investigate the molecular mechanisms of CAF-1 specific recognizing H3.1.This work will be useful for delineating the CAF-1 mediated H3.1 deposition pathway in nucleosome assembly and facilitating strcuture-based drug design for CAF-1 associated diseases.
染色质装配因子1(CAF-1)是一种在DNA复制及修复过程中参与核小体组装的组蛋白伴侣。反沉默功能蛋白1(ASF1)将新合成的组蛋白H3.1-H4二聚体传递给下游的CAF-1,再由CAF-1将组蛋白(H3.1-H4)2四聚体存储到新生DNA链上,以实现核小体组装的第一步反应。但是,CAF-1如何特异识别组蛋白H3.1及CAF-1结合何种聚合状态的组蛋白H3.1-H4,目前仍不清楚。本项目计划运用X射线晶体学测定人源CAF-1与组蛋白H3.1-H4复合物的晶体结构,揭示CAF-1与H3.1-H4的结合方式。以结构为基础设计突变实验,综合运用Pull down和Co-IP生化手段以及细胞荧光共定位技术,研究CAF-1特异识别H3.1的分子机理。该项工作将为我们了解CAF-1参与H3.1的核小体组装途径提供精确的结构基础,并为开展与CAF-1相关疾病的药物设计提供结构支持。

结项摘要

染色质装配因子1(CAF-1)是一种在DNA复制及修复过程中参与核小体组装的组蛋白伴侣。反沉默功能蛋白1(ASF1)将新合成的组蛋白H3.1-H4二聚体传递给下游的CAF-1,再由CAF-1 将组蛋白(H3.1-H4)2 四聚体存储到新生DNA链上,以实现核小体组装的第一步反应。本项目计划运用X射线晶体学测定CAF-1与组蛋白H3.1-H4复合物的晶体结构,并结合生化手段研究CAF-1结合组蛋白H3.1-H4的模式以及特异识别H3.1的分子机理。经过三年的研究,我们成功的获得了CAF-1复合物的高纯度蛋白,生长出可衍射的复合物晶体,并进行了初步X射线晶体学分析。为了揭示CAF-1结合组蛋白H3.1-H4的模式,我们成功的组装了CAF-1与组蛋白H3.1-H4五元复合物,并进行了大量的晶体筛选,并通过生化手段验证CAF-1对H3.1的识别特异性。更进一步地,我们成功的组装了ASF1和CAF-1-H3.1-H4六元复合物。这些数据将对进一步研究CAF-1的识别和装配机制提供详实的基础,并有助于了解整个核小体组装的第一步反应过程。

项目成果

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  • 项目类别:
    面上项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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