课题基金基金详情
反义RNA介导的DHRS4基因簇表观遗传学调控机制
结题报告
批准号:
31100939
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
25.0 万元
负责人:
苏中静
依托单位:
学科分类:
C0602.基因表达及非编码序列调控
结题年份:
2014
批准年份:
2011
项目状态:
已结题
项目参与者:
陈海滨、李奇、谢健平、徐晓园、马天仲、董竞、牛艳茹、陈先才
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中文摘要
为证实"反义转录本通过RNA介导的方式在表观遗传学水平调控DHRS4基因簇转录活性"的假设,本课题通过RNA干扰和过表达改变DHRS4反义RNA在细胞内的含量,然后检测DHRS4、DHRS4L2和DHRS4L1基因的表达以及启动子DNA甲基化、组蛋白甲基化和乙酰化修饰的变化,证实反义RNA在表观遗传学水平调控DHRS4基因簇的转录活性。在此基础上,进一步采用RNA免疫沉淀和染色质寡核酸亲和沉淀鉴定反义RNA在细胞核内结合的蛋白和DNA分子,详细探讨反义RNA表观遗传学调控基因转录的作用方式。本课题的研究成果有助于明确反义RNA对正义链基因表达的调节作用和表观遗传学水平的调控机制,并揭示参与DHRS4基因簇转录调控的可能因素,为今后进一步研究反义RNA和DHRS4基因簇在人体的功能和意义提供参考资料。
英文摘要
本课题在生物信息学分析不同物种DHRS4基因结构、RNA剪接亚型的基础上,通过RNAi、qPCR、RNA IP等实验证实人DHRS4反义转录本通过募集调控因子在表观遗传学水平调控正义DHRS4基因簇转录的假设,并提出DHRS4基因簇启动子本身的序列以及反义RNA可能参与了生物进化过程中拷贝基因的转录活性调控。课题还通过RNA pull down鉴定了DHRS4反义RNA在细胞内结合的蛋白,结果提示提示除在表观遗传学调控靶基因表达外,反义RNA也有可能在转录后等多个水平发挥基因表达的调控作用。结和课题有关反义RNA和选择性剪接的研究成果,以及相关的数据库资料分析,我们也提出CD45反义RNA可能参与调控正义CD45 RNA不同剪接亚型的表达,并与临床自身免疫病发病相关的假说,为下一个课题的申请和今后反义RNA结合临床疾病的研究拓开了一个方向。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI:10.1016/j.gene.2011.12.033
发表时间:2012-02
期刊:Gene
影响因子:3.5
作者:Z. Su;Rui Li;Xuhong Song;Gefei Liu;Yifan Li;X. Chang;Cong-zhu Li;Dongyang Huang
通讯作者:Z. Su;Rui Li;Xuhong Song;Gefei Liu;Yifan Li;X. Chang;Cong-zhu Li;Dongyang Huang
DOI:--
发表时间:2014
期刊:Lupus
影响因子:2.6
作者:Rong J;Yin J;Su Z
通讯作者:Su Z
AS1DHRS4, a head-to-head natural antisense transcript, silences the DHRS4 gene cluster in cis and trans
AS1DHRS4,一种头对头的天然反义转录物,以顺式和反式沉默 DHRS4 基因簇
DOI:10.1073/pnas.1116597109
发表时间:2012-08-28
期刊:PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
影响因子:11.1
作者:Li, Qi;Su, Zhongjing;Huang, Dongyang
通讯作者:Huang, Dongyang
反义非编码RNA调控淋巴细胞CD45亚型表达的研究
  • 批准号:
    31870745
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    59.0万元
  • 批准年份:
    2018
  • 负责人:
    苏中静
  • 依托单位:
国内基金
海外基金