生物磁共振波谱分析中的原子标记和非标记方法研究

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基本信息

项目摘要

Determining the properties of chemical composition, molecular structure, interaction and dynamics of biological system, and then exploring the relationship between these properties and biological processes are one of core subjects for life analytical chemistry. Cell is major organ where most biological processes take place and protein is the key subject for functioning or to bearing the function. Among all analytical techniques, nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy can provide those properties at atomic resolution. Although application of NMR for in-cell protein study is in its infant, this area has attracted more and more attention. This proposal aims to develop in-cell NMR method in combination with selective atomic labeling and non-labeled strategy for protein interaction and dynamic studies.
探测生物体系的分子组成、结构、相互作用及其动态过程,认识这些性质与生命过程的内在联系,是生命分析化学的核心内容之一。细胞是生命过程的基本单元,蛋白质是生物功能的执行者和承载者。细胞环境中获取的生物分子特性信息更有助于认识生命过程的本质。在诸多分析方法中,核磁共振能够在原子水平上提供上述性质的定性和定量信息,独具特色,但活细胞的核磁共振分析尚处于孕育和发展之中。本项目拟以活细胞为主要体系,以蛋白质为主要检测对象,以核磁共振波谱为主要手段,开展基于原子标记和免标记的高灵敏、高选择性分析方法和应用研究。目标是建立普适性的生物波谱分析策略、方法和技术,为探索生物功能的本质提供技术手段和基础数据,同时推进核磁共振波谱在活细胞等复杂体系直接分析中的应用。

结项摘要

探测生物体系的分子组成、结构、相互作用及其动态过程,认识这些性质与生命过程的内在联系,是生命分析化学的核心内容之一。细胞是生命过程的基本单元,蛋白质是生物功能的执行者和承载者。细胞环境中获取的生物分子特性信息更有助于认识生命过程的本质。在诸多分析方法中,核磁共振能够在原子水平上提供上述性质的定性和定量信息,独具特色,但活细胞的核磁共振分析尚处于孕育和发展之中。本项目以活细胞为主要体系,以蛋白质为主要检测对象,以核磁共振波谱为主要手段,开展基于原子标记和免标记的高灵敏、高选择性分析方法和应用研究。项目发表SCI论文35篇,建立一系列生物波谱分析策略、方法和技术,如基于1H-14N NMR二维谱的蛋白质构象检测技术,基于19F-NMR细胞内蛋白质检测技术等,并将这些方法应用于溶液及细胞环境中蛋白质的研究中,研究了细胞环境对蛋白质相互作用的调控,以及磷酸化修饰对蛋白质功能的调控等,为探索生物功能的本质提供技术手段和基础数据,同时推进核磁共振波谱在活细胞等复杂体系直接分析中的应用。

项目成果

期刊论文数量(34)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Mutation of leucine 20 causes a change of local conformation indirectly impairing the DNA binding of SP_0782 from Streptococcus pneumoniae
亮氨酸 20 突变导致局部构象变化,间接损害肺炎链球菌 SP_0782 的 DNA 结合
  • DOI:
    10.1016/j.bbrc.2020.01.057
  • 发表时间:
    2020-03-26
  • 期刊:
    BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Gong, Yixuan;Li, Shuangli;Liu, Maili
  • 通讯作者:
    Liu, Maili
Enhancing the detection sensitivity of nanobody against aflatoxin B1 through structure-guided modification
通过结构引导修饰提高纳米抗体对黄曲霉毒素B(1)的检测灵敏度。
  • DOI:
    10.1016/j.ijbiomac.2021.11.182
  • 发表时间:
    2021-12-05
  • 期刊:
    INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES
  • 影响因子:
    8.2
  • 作者:
    He, Ting;Nie, Yao;Liu, Maili
  • 通讯作者:
    Liu, Maili
The Study of the Aggregated Pattern of TX100 Micelle by Using Solvent Paramagnetic Relaxation Enhancements
利用溶剂顺磁弛豫增强技术研究 TX100 胶束的聚集模式
  • DOI:
    10.3390/molecules24091649
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Molecules
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Zhang Liang;Chai Xin;Sun Peng;Yuan Bin;Jiang Bin;Zhang Xu;Liu Maili
  • 通讯作者:
    Liu Maili
Expression, purification and characterization of the RhoA-binding domain of human SHIP2 in E.coli
人 SHIP2 的 RhoA 结合域在大肠杆菌中的表达、纯化和表征。
  • DOI:
    10.1016/j.pep.2021.105821
  • 发表时间:
    2021-01-11
  • 期刊:
    PROTEIN EXPRESSION AND PURIFICATION
  • 影响因子:
    1.6
  • 作者:
    Zhou, Heng;Yue, Xiali;Liu, Maili
  • 通讯作者:
    Liu, Maili
Structural Insights into the Binding Propensity of Human SHIP2 SH2 to Oncogenic CagA Isoforms from Helicobacter pylori.
人类 SHIP2 SH2 与幽门螺杆菌致癌 CagA 亚型结合倾向的结构见解
  • DOI:
    10.3390/ijms231911299
  • 发表时间:
    2022-09-25
  • 期刊:
    INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Wang, Zi;Shan, Yubao;Wang, Ru;Zhou, Heng;Hu, Rui;Li, Ying;Zhu, Jiang;Yang, Yunhuang;Liu, Maili
  • 通讯作者:
    Liu, Maili

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其他文献

液体NMR实验中溶剂峰的抑制方法
  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 影响因子:
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  • 期刊:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
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低盐和高盐环境下 α-Synuclein 构象的 19 F NMR 研究
  • DOI:
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    2015
  • 期刊:
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  • 作者:
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    2017
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  • 作者:
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    刘买利

其他文献

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刘买利的其他基金

细胞中功能大分子三维结构的高效测定方法
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细胞中生物大分子结构与相互作用的谱学测量
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    重点项目
复合配体与蛋白质共结合和竞争结合的NMR研究
  • 批准号:
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    2001
  • 资助金额:
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  • 项目类别:
    面上项目
药物分子与蛋白质相互作用的NMR研究
  • 批准号:
    29875034
  • 批准年份:
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  • 资助金额:
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    面上项目

相似国自然基金

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  • 项目类别:
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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