采用Cas9-Spinach2 RNA 荧光标记系统研究IRAIN 在AML干细胞中的功能和机制

批准号:
81600150
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
18.0 万元
负责人:
孙京男
依托单位:
学科分类:
H0816.血液系统疾病研究新技术与新方法
结题年份:
2019
批准年份:
2016
项目状态:
已结题
项目参与者:
孙云鹏、王旭、康丽花、刘晓亮、李昱瑛、王轶卓、韩薇、文雪、刘雪莲
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中文摘要
白血病干细胞(LSC)是导致急性髓系白血病(AML)发生、化疗抵抗最终难治复发的根源之一。胰岛素样生长因子1受体(IGF1R) 与白血病生长化疗耐药密切相关,但IGF1R在LSC中异常表达的调控机制不清楚。. 申请人在国际上首次发现IGF1R基因内一条长链非编码RNA-IRAIN,开创一种研究染色质空间结构的新方法-逆转录结合染色质构象捕获法(RAT),第一作者文章发表在《Nucleic Acids Research》IF=9.112),IRAIN被NCBI收录(Gene ID: 104472848);前期结果证实在LSC中IRAIN可能作为抑癌基因调控白血病的发生。. 本项目拟在前期工作基础上,结合CRISPR-Cas9基因编辑及Spinach2 RNA荧光定位分析,进一步阐明IRAIN 调控急性髓系白血病干细胞生长的功能和表观遗传学机制,为靶向治疗及新药开发提供理论依据。
英文摘要
Leukemia stem cells (LSC) induces the progresses and drug resistance of acute myeloid leukemia. Insulin-like growth factor 1 receptor(IGF1R) is often dysregulated in leukemia,particularly in LSC, but the underlying mechanism still remains to be defined. . Previously, we for the first time discovered a novel antisense long noncoding RNA, IRAIN, in the IGF1R gene locus. Using a reverse transcription-associated trap(RAT)method established in our lab, we found that IRAIN participated in the regulation of IGF1R by forming lncRNA/chromatin conformation looping. The data have been published on《Nucleic Acids Research》,and IRAIN has been recorded on NCBI(Gene ID: 104472848). Importantly, we found that IRAIN may function as a tumor suppressor in LSC.. In this project, we propose to study the function and mechanism of IRAIN in LSC by using CRISPR Cas9-Spinach2 fluorescence-labeling system and RAT methods. We hope that the data from this project will provide a mechanistic rationale for designing a new generation anti-leukemia drug that targets LSC by harnessing the IRAIN epigenetic machinery.
白血病干细胞(LSC)是导致急性髓系白血病(AML)发生、化疗抵抗最终难治复发的根源之一。胰岛素样生长因子1受体(IGF1R) 与白血病生长化疗耐药密切相关,但IGF1R在LSC中异常表达的调控机制不清楚。.申请人在首次现IGF1R基因内一条长链非编码RNA-IRAIN,开创一种研究染色质空间结构的新方法-逆转录结合染色质构象捕获法(RAT),证实IRAIN在LSC中IRAIN可能作为抑癌基因调控白血病的发生。在前期工作基础上,通过流式细胞分选白血病干细胞,定量分析不同危险分层白血病患者IRAIN表达情况及遗传印迹差异,发现IRAIN在高危组AML LSC中表达下调。结合CRISPR-Cas9基因编辑方法,研究IRAIN调控白血病干细胞的机制,发现IRAIN不仅能够调节启动子甲基化印迹转换,还通过染色质空间结构改变,调控白血病细胞增殖。最后课题组通过核内逆转录捕获法(NRAT),研究IRAIN下游可能靶向作用的其它相关lncRNA,为进一步研究IRAIN的下游调控网络及机制奠定基础。.
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI:10.1002/hon.2534
发表时间:2019
期刊:Hematological Oncology
影响因子:--
作者:Huang Hanying;Sun Jingnan;Sun Yunpeng;Wang Cong;Gao Sujun;Li Wei;Hu Ji Fan
通讯作者:Hu Ji Fan
Targeting the IGF1R Pathway in Breast Cancer Using Antisense lncRNA-Mediated Promoter cis Competition.
利用反义 lncRNA 介导的启动子顺式竞争靶向乳腺癌中的 IGF1R 通路
DOI:10.1016/j.omtn.2018.04.013
发表时间:2018-09-07
期刊:Molecular therapy. Nucleic acids
影响因子:--
作者:Pian L;Wen X;Kang L;Li Z;Nie Y;Du Z;Yu D;Zhou L;Jia L;Chen N;Li D;Zhang S;Li W;Hoffman AR;Sun J;Cui J;Hu JF
通讯作者:Hu JF
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