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rs1348270通过增强子调控LINC01705表达影响瘢痕疙瘩发生发展的机制研究
结题报告
批准号:
81903189
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
20.0 万元
负责人:
邓成成
依托单位:
学科分类:
H1201.皮肤形态、结构和功能异常
结题年份:
2022
批准年份:
2019
项目状态:
已结题
项目参与者:
--
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中文摘要
瘢痕疙瘩是皮肤损伤后成纤维细胞过度增生和胶原异常积聚所致的过度瘢痕化,遗传因素在其发病中发挥重要作用,但机制仍未明。我们前期研究发现,瘢痕疙瘩易感位点rs1348270位于增强子上,敲除该增强子显著下调LINC01705的表达,而LINC01705在瘢痕疙瘩中高表达并能调控胶原合成。据此我们提出假说:rs1348270通过增强子调控LINC01705的表达,增强细胞胶原合成促进瘢痕疙瘩发生发展。为验证假说,我们拟以CRISPR/Cas9、ChIP等技术,明确rs1348270调控LINC01705的机理;以细胞和分子生物学方法明确LINC01705在瘢痕疙瘩中的功能和发挥作用的机理;以基因测序、荧光原位杂交等方法明确rs1348270和LINC01705在瘢痕疙瘩中的临床意义。该研究将揭示rs1348270通过LINC01705影响瘢痕疙瘩发生发展的机理,对瘢痕疙瘩临床诊疗具有重要意义。
英文摘要
Keloid represents one extreme of aberrant dermal wound healing and is characterized by fibroblast abnormal proliferation and excessive deposition of collagen. Genetic factors play an important role in its pathogenesis, but its regulatory mechanism remains unclear. In preliminary study, we found that the keloid susceptibility site rs1348270 is located on the enhancer, Knock-out of the enhancer down regulated the expression of LINC01705, and LINC01705 was high expressed in keloid and could regulate the collagen synthesis. Based on these findings, we hypothesize that rs1348270 may regulate the expression of LINC01705 through enhancer, and up-regulate the expression of collagen to promote the formation and development of keloid. To verify the hypothesis, we will explore the mechanism that rs1348270 regulates LINC01705 by using experiments such as CRISPR/Cas9 and ChIP. Next we will use cell and molecular biology methods to clarify the function and mechanism of LINC01705 in keloid. At last we will use experiments such as gene sequencing and FISH to study the clinical significance of rs1348270 and LINC01705 in keloid. This study will reveal the mechanism of rs1348270 influencing the formation and development of keloid through LINC01705, which is of great significance for clinical diagnosis and treatment of keloid.
瘢痕疙瘩是皮肤损伤后成纤维细胞过度增生和胶原异常积聚所致的过度纤维化疾病,遗传因素在其发病中发挥重要作用。前期已发表全基因组关联分析研究发现,日本人群和汉族人群在染色体1q41区域的rs873549位点是瘢痕疙瘩发病的易感位点,该位点在日本人群和汉族人群中与瘢痕疙瘩发病都最显著相关(P 值最低),提示该位点可能在瘢痕疙瘩发病中发挥重要的作用,但其致病机制仍未明。本研究以生物信息学分析、CRISPR/Cas9技术、染色体构象捕获技术、siRNA基因敲低技术、荧光素酶报告基因技术、RNA-seq等方法,探索了rs873549及其紧密连锁的位点在瘢痕疙瘩发病中的功能和分子机制。我们的研究发现,与瘢痕疙瘩易感位点rs873549紧密连锁的rs1348270位于增强子上, 其风险型GG将破坏该增强子和一个lncRNA DEIK(正式名称为RP11-400N13.1)的启动子的结合,从而导致皮肤成纤维细胞中DEIK的表达显著下调。DEIK表达下调将增强BMP-2在成纤维细胞中的表达,从而促进胶原等细胞外基质的沉积导致瘢痕疙瘩发生发展。我们的研究揭示了瘢痕疙瘩易感位点rs1348270 通过增强子调控lncRNA DEIK 的表达影响瘢痕疙瘩发生发展的作用和分子机制,这些发现对我们深入理解瘢痕疙瘩的发病机理和研发新的瘢痕疙瘩易感人群筛查方法和诊疗手段都具有重大意义。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI:10.1093/bjd/ljac025
发表时间:2022-11
期刊:The British journal of dermatology
影响因子:--
作者:Cheng-Cheng Deng-Cheng;Li-Xue Zhang;Xueyan Xu;Ding-Heng Zhu;Qing Cheng;Shufeng Ma;Zhili Rong;Bin Yang
通讯作者:Cheng-Cheng Deng-Cheng;Li-Xue Zhang;Xueyan Xu;Ding-Heng Zhu;Qing Cheng;Shufeng Ma;Zhili Rong;Bin Yang
TSP1 promotes fibroblast proliferation and extracellular matrix deposition via the IL6/JAK2/STAT3 signalling pathway in keloids
TSP1通过IL6/JAK2/STAT3信号通路促进瘢痕疙瘩中成纤维细胞增殖和细胞外基质沉积
DOI:10.1111/exd.14623
发表时间:2022-06-19
期刊:EXPERIMENTAL DERMATOLOGY
影响因子:3.6
作者:Feng, Qing-Lan;Gu, Jing-Jing;Yang, Bin
通讯作者:Yang, Bin
Single-cell RNA-seq reveals fibroblast heterogeneity and increased mesenchymal fibroblasts in human fibrotic skin diseases.
单细胞 RNA 测序揭示人类纤维化皮肤病中成纤维细胞异质性和间充质成纤维细胞增加
DOI:10.1038/s41467-021-24110-y
发表时间:2021-06-17
期刊:Nature communications
影响因子:16.6
作者:Deng CC;Hu YF;Zhu DH;Cheng Q;Gu JJ;Feng QL;Zhang LX;Xu YP;Wang D;Rong Z;Yang B
通讯作者:Yang B
BMP2诱导血管周细胞转分化为ADAM12+成纤维细胞促进皮肤创伤后瘢痕形成的机制研究
  • 批准号:
    82373457
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    49万元
  • 批准年份:
    2023
  • 负责人:
    邓成成
  • 依托单位:
国内基金
海外基金