本项目以近亲缘关系的果蝇(Drosophila)为材料，通过对White ，SOD 、Dfak、4f-rnp、adh和 xdh 等有重要生物学功能的单拷贝基因剪接体内含子在不同地史年代果蝇中丢失及SOD基因对Y染色体的反转录转座的研究, 结合分子系统学、比较基因组学、生物信息学、地理学以及历史生物地理知识，探讨果蝇内含子丢失及Y连锁的反转录转座后的功能分析与物种形成及适应性辐射的关系; 检验并界定内含子作为分子钟的适用范围,构建以内含子为分子标记的"物种树"; 揭示物种形成和生物地理格局分布规律，进而为生物多样性、特别是稀有、频危物种资源的保护提供理论依据和操作指南;为新基因和Y染色体的起源提供重要线索。