基于RNA降解机制研究长非编码RNA调控寡孢节丛孢捕食器官形成的分子机制
结题报告
批准号:
31970073
项目类别:
面上项目
资助金额:
58.0 万元
负责人:
李娟
依托单位:
学科分类:
微生物遗传与生物合成
结题年份:
2023
批准年份:
2019
项目状态:
已结题
项目参与者:
李娟
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中文摘要
捕食线虫真菌是一类具有重要理论研究和应用价值的真菌,了解其捕食器官形成的分子机制是阐明其致病机理的关键。申请人前期发现捕食线虫真菌寡孢节丛孢捕食器官的形成可能受到长非编码RNAs(lncRNAs)的调控。而lncRNAs的转录丰度及稳定性受生物的RNA降解机制所控制。使RNA降解途径中的关键蛋白失活将放慢lncRNA的降解速度,不仅有利于发现更多隐性存在的lncRNAs,还有助于对其开展功能研究。基于此,本研究拟在前期研究的基础上,对寡孢节丛孢RNA降解途径关键蛋白敲除菌株进行高通量测序,以期发现更多参与捕食器官形成的ncRNAs,并选取2-3条具有潜在功能的lncRNAs开展分子生物学研究,揭示其在捕食器官形成过程中的分子调控机制,为从RNA调控角度理解真菌通过形态学改变完成侵染的致病机理奠定理论基础,为开发高效的线虫生防制剂提供理论指导。
英文摘要
Nematode-trapping fungi are a kind of microorganisms with important theoretical research and application value. Understanding the molecular mechanisms of their trap formation is the key to elucidate their pathogenesis mechanism. Our previous studies suggested that the trap formation of Arthrobotrys oligospora may be regulated by the long noncoding RNAs (lncRNAs). The transcript abundance and stability of lncRNAs are controlled by the RNA degradation mechanisms of species. Knockout/down of the functional protease encoding genes in RNA degradation pathway would slow the degradation of lncRNAs in cell. This method will not only help us to identify more lncRNAs that cannot to be easily found in wild type cell, but also raise the expression levels of lncRNAs, providing chances to study molecular mechanisms of these functional lncRNAs. In this study, we would like to use high-throughput sequence methods to discovery more cryptic ncRNAs involving in the trap formation. Moreover, the biological functions of 2-3 lncRNAs will be characterized through molecular biotechnologies, revealing their molecular regulation mechanism during trap formation. All these studies will provide a basis for elucidating the pathogenicity mechanism of fungi based on RNA regulation aspect and provide theoretical foundation for utilizing these fungi as high effective bio-control agents in the future.
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DOI:https://doi.org/10.1007/s11427-022-2300-2
发表时间:2023
期刊:Science China life Sciences
影响因子:--
作者:Miao Qiao;Wang Zhengqi;Yin Ziyu;Liu Xiaoying;Li Ran;Zhang Ke-Qin;Li Juan
通讯作者:Li Juan
DOI:10.3389/fgene.2020.00150
发表时间:2020
期刊:Frontiers in Genetics
影响因子:3.7
作者:Tao Qin;Juan Li;Ke-Qin Zhang
通讯作者:Ke-Qin Zhang
DOI:https://doi.org/10.3390/pathogens11070717
发表时间:2022
期刊:Pathogens
影响因子:3.7
作者:Liu Xiaoying;Miao Qiao;Zhou Zong;Lu Siyi;Li Juan
通讯作者:Li Juan
DOI:https://doi.org/10.3390/jof8111159
发表时间:2022
期刊:Journal of Fungi
影响因子:4.7
作者:Ding Guoqing;Shang Liqiu;Zhou Wenliang;Lu Siy;Zhou Zong;Huang Xinyi;Li Juan
通讯作者:Li Juan
DOI:doi: 10.3389/fmicb.2021.638617
发表时间:2021
期刊:Frontiers in Microbiology
影响因子:5.2
作者:Li Juan;Liu Xiaoying;Yin Ziyu;Hu Zhihong;Zhang Ke-Qin
通讯作者:Zhang Ke-Qin
秀丽隐杆线虫利用let-7跨界调控抵御真菌侵染的防御新机制
  • 批准号:
    32370211
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    50万元
  • 批准年份:
    2023
  • 负责人:
    李娟
  • 依托单位:
寡孢节丛孢miRNAs在侵染线虫过程中的跨界调控机制
  • 批准号:
    32170198
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    58万元
  • 批准年份:
    2021
  • 负责人:
    李娟
  • 依托单位:
组蛋白甲基化修饰调控寡孢节丛孢捕食器官形成的分子机制
  • 批准号:
    31760538
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    38.0万元
  • 批准年份:
    2017
  • 负责人:
    李娟
  • 依托单位:
长非编码RNA调控捕食线虫真菌捕食器官形成的功能与机制
  • 批准号:
    31560025
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    42.0万元
  • 批准年份:
    2015
  • 负责人:
    李娟
  • 依托单位:
捕食线虫真菌捕食器官的进化及适应的分子遗传机制
  • 批准号:
    31100894
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    22.0万元
  • 批准年份:
    2011
  • 负责人:
    李娟
  • 依托单位:
国内基金
海外基金