课题基金基金详情
长非编码RNA调控捕食线虫真菌捕食器官形成的功能与机制
结题报告
批准号:
31560025
项目类别:
地区科学基金项目
资助金额:
42.0 万元
负责人:
李娟
依托单位:
学科分类:
C0104.微生物遗传与生物合成
结题年份:
2019
批准年份:
2015
项目状态:
已结题
项目参与者:
张颖、王晓萍、李恒、乔燕、刘越、朱宏艳
国基评审专家1V1指导 中标率高出同行96.8%
结合最新热点,提供专业选题建议
深度指导申报书撰写,确保创新可行
指导项目中标800+,快速提高中标率
客服二维码
微信扫码咨询
中文摘要
真菌从腐生到寄生的生活方式转换是实现其侵染的关键,是生命科学领域有待加强研究的重要科学问题。捕食器官的形成是捕食线虫真菌实现对线虫侵染,从腐生转向寄生的标志。前期研究提示在捕食线虫真菌寡孢节丛孢中可能存在某些长非编码RNA(lncRNA)参与调控捕食器官的形成。本项目拟以寡孢节丛孢为研究对象,通过高通量测序技术对捕食器官形成过程中的几个关键节点进行测序,利用生物信息学手段筛选可能在寡孢节丛孢捕食器官产生过程中发挥功能的lncRNA,进而利用分子生物学手段对lncRNA进行实验验证及生物学功能研究,探明在寡孢节丛孢等捕食线虫真菌通过产生捕食器官实现从腐生向寄生生活转换过程中lncRNA的功能和调控机制,为理解真菌通过转换生活方式实现侵染的致病机理奠定理论基础,为开发有效的线虫生防产品提供理论指导。
英文摘要
The key of one fungus infects against its hosts is to switch its lifestyles from saprophytic to parasitic. This is the most important scientific question needs more studies in the future. The formation of trapping devices by nematode-trapping fungi is an important indicator of their switch from the saprophytic to the predacious lifestyles. Previous studies suggested that the formation of trap structures of Arthrobotrys oligospora maybe regulated by some long noncoding RNAs. In this study, the samples collected from the four key time points during trap formation of A. oligospora will be high throughput sequenced based on RNA-seq. The lncRNAs that might have functions in trap formation will be predicated through bioinformatic methods. Moreover, the biological functions of lncRNA will be characterized by using molecular biotechnologies. All these studies will help us from the perspective of long noncoding RNAs to understand the molecular mechanism of nematode-trapping fungi switching its lifestyles from saprophytic to predacious, also provide a basis for elucidating the pathogenicity mechanism of fungi and provide theoretical foundation for utilizing these fungi as high effective bio-control agents in the future.
本研究通过RNA-seq技术对寡孢节孢野生型菌株捕食器官形成关键时间点进行测序和分析,成功筛选出1951条候选的lncRNAs,并从中选取了54条经生物信息学预测的有显著表达差异的lncRNAs进行RT-qPCR验证,得到30条具有差异表达的lncRNAs。鉴于lncRNAs可以通过cis作用对其邻近基因进行调控,本研究对具有表达差异的lncRNAs上下游2000 bp范围内的基因进行分析,最终选取了5条lncRNAs(TCONS_00193747,TCONS_00349760,TCONS_00182722,TCONS_00188549,TCONS_00316812)和其邻近的功能基因(AOL_s00080g63,AOL_s00215g323utp215,AOL_s00080g393,AOL_s000193g139)开展功能研究,发现敲除lncRNA及其邻近的编码基因后,寡孢节丛孢的捕食器官或分生孢子的形成受到一定程度的影响,而基于RT-qPCR和/或Northern blot方法发现,敲除了lncRNA后,其邻近功能基因的表达水平也受到影响,提示这些lncRNAs可能对其邻近功能基因具有调控功能。本研究为今后进一步探明lncRNAs调控捕食线虫真菌捕食器官形成的机制奠定了基础。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Phylogenomic evolutionary surveys of subtilase superfamily genes in fungi.
真菌枯草杆菌酶超家族基因的系统发育进化调查。
DOI:10.1038/srep45456
发表时间:2017-03-30
期刊:Scientific reports
影响因子:4.6
作者:Li J;Gu F;Wu R;Yang J;Zhang KQ
通讯作者:Zhang KQ
The pH sensing receptor AopalH plays important roles in the nematophagous fungus Arthrobotrys oligospora
pH 传感受体 AopalH 在食线虫少孢节孢菌中发挥重要作用
DOI:10.1016/j.funbio.2019.05.008
发表时间:2019-07-01
期刊:FUNGAL BIOLOGY
影响因子:2.5
作者:Li, Juan;Wu, Runian;Zhang, Ke-Qin
通讯作者:Zhang, Ke-Qin
Thioredoxin1 regulates conidia formation, hyphal growth, and trap formation in the nematode-trapping fungus Arthrobotrys oligospora
硫氧还蛋白1调节线虫捕获真菌少孢节孢菌中的分生孢子形成、菌丝生长和陷阱形成
DOI:10.1007/s13213-019-01511-5
发表时间:2019-08
期刊:Annals of Microbiology
影响因子:3
作者:Wang Ji ai;Huang Xiaowei;Niu Shanzhuang;Hu Zhihong;Li Heng;Ji Xinglai;Yu Hua;Zeng Weikun;Tao Jian;Chen Weiwei;Li Jun;Li Juan;Zhang Ke Qin
通讯作者:Zhang Ke Qin
Phylogenic analysis of adhesion related genes Mad1 revealed a positive selection for the evolution of trapping devices of nematode-trapping fungi.
粘附相关基因Mad1的系统发育分析揭示了线虫捕获真菌捕获装置进化的正选择
DOI:10.1038/srep22609
发表时间:2016-03-04
期刊:Scientific reports
影响因子:4.6
作者:Li J;Liu Y;Zhu H;Zhang KQ
通讯作者:Zhang KQ
秀丽隐杆线虫利用let-7跨界调控抵御真菌侵染的防御新机制
  • 批准号:
    32370211
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    50万元
  • 批准年份:
    2023
  • 负责人:
    李娟
  • 依托单位:
寡孢节丛孢miRNAs在侵染线虫过程中的跨界调控机制
  • 批准号:
    32170198
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    58万元
  • 批准年份:
    2021
  • 负责人:
    李娟
  • 依托单位:
基于RNA降解机制研究长非编码RNA调控寡孢节丛孢捕食器官形成的分子机制
  • 批准号:
    31970073
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    58.0万元
  • 批准年份:
    2019
  • 负责人:
    李娟
  • 依托单位:
组蛋白甲基化修饰调控寡孢节丛孢捕食器官形成的分子机制
  • 批准号:
    31760538
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    38.0万元
  • 批准年份:
    2017
  • 负责人:
    李娟
  • 依托单位:
捕食线虫真菌捕食器官的进化及适应的分子遗传机制
  • 批准号:
    31100894
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    22.0万元
  • 批准年份:
    2011
  • 负责人:
    李娟
  • 依托单位:
国内基金
海外基金