基于结构生物信息学指导的GH12家族糖苷水解酶的理性设计
批准号:
31170071
项目类别:
面上项目
资助金额:
62.0 万元
负责人:
王禄山
依托单位:
学科分类:
微生物生理与生化
结题年份:
2015
批准年份:
2011
项目状态:
已结题
项目参与者:
巩海涛、张正、张小梅、侯峰、郭翰林、段晓云、贾洋洋、张丽丽、潘龙强
中文摘要
随着我国经济的快速发展,资源与能源问题日益突出,纤维素酶效率仍然偏低,限制了生物质资源的综合利用,寻找并设计适合工业生物技术的高效纤维素酶制剂是推动生物炼制的必由之路。低分子量的GH12家族糖苷水解酶在纤维素酶系降解天然纤维素的过程中发挥重要作用,所以本课题拟以环境基因组学的方法调研GH12糖苷水解酶的序列多样性,利用结构生物信息学方法构建序列之间的演化关系,分析定位催化活性架构中功能区的残基及其组合;利用已克隆模板,对功能区残基及其组合进行有目的理性设计;制备天然均一底物,利用动态光谱技术、微量热技术等跟踪新酶分子的反应动力学过程;建立酶反应的理论计算体系,在原子水平上分析GH12家族纤维素酶分子催化过程的过渡态及其分子动态行为,阐明其催化机理,可为纤维素酶分子设计改造、提高催化效率提供依据,从而促进燃料乙醇新技术革新与工业转化进程。
英文摘要
随着我国经济的快速发展,资源与环境问题日益突出,纤维素酶效率仍然偏低,限制了生物质资源的综合利用与开发,寻找并设计适合工业生物技术的高效纤维素酶制剂是推动生物质高值化利用的必由之路。广泛分布于自然界中的低分子量GH12家族糖苷水解酶在纤维素酶系降解天然纤维素的过程中发挥重要作用。本课题以环境基因组学的方法调研GH12糖苷水解酶的序列多样性,分析了GH12家族酶组分在丝状真菌酶系表达调控中的重要作用。本课题建立了荧光辅助糖电泳技术,并利用其发现TrCel12A酶组具有专一性降解模式及特异性产物谱。利用结构生物信息学方法构建GH12的活性中心序列谱,分析定位活性架构中不同亚位点的残基及其组合;利用TrCel12A模板,对活性架构中-2及-4亚位点的关键残基及其组合进行有目的理性改造;发现-2位点芳香族氨基酸结合力的改变,可以改变内切纤维素酶的结合模式,而-4位亚点芳香族氨基酸结合力的增加,可以明显提高内切纤维素酶的催化效率。通过量化计算分析等,在原子水平上分析GH12家族纤维素酶分子催化过程的分子动态行为,阐明了相关催化机理,为其它糖苷水解酶分子的理性设计、催化效率提升、酶系的复配提供了理论基础,从而促进糖苷水解酶的工业推广应用。
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DOI:
10.1002/elps.201400563
发表时间:
2015-03
期刊:
ELECTROPHORESIS
影响因子:
2.9
作者:
[Qing Zhang;Xiaomei Zhang;Peipei Wang;Dandan Li;Guanjun Chen;P. Gao;Lushan Wang]
通讯作者:
Qing Zhang;Xiaomei Zhang;Peipei Wang;Dandan Li;Guanjun Chen;P. Gao;Lushan Wang
DOI:
--
发表时间:
2013
期刊:
Appl Biochem Biotechnol
影响因子:
--
作者:
[Su Ma, Guanjun Chen, Lushan Wang, Peiji Gao]
通讯作者:
Peiji Gao
Bi-factor analysis based on noise-reduction (BIFANR): a new algorithm for detecting coevolving amino acid sites in proteins.
基于降噪的双因子分析(BIFANR):一种检测蛋白质中共进化氨基酸位点的新算法
DOI:
10.1371/journal.pone.0079764
发表时间:
2013
期刊:
PloS one
影响因子:
3.7
作者:
[Liu J, Duan X, Sun J, Yin Y, Li G, Wang L, Liu B]
通讯作者:
Liu B
DOI:
--
发表时间:
2013
期刊:
生物工程学报
影响因子:
--
作者:
[李单单, 王禄山, 赵越, 陈冠军]
通讯作者:
陈冠军
Substrate-binding specificity of chitinase and chitosanase as revealed by active-site architecture analysis
活性位点结构分析揭示几丁质酶和壳聚糖酶的底物结合特异性
DOI:
10.1016/j.carres.2015.10.002
发表时间:
2015-12-11
期刊:
CARBOHYDRATE RESEARCH
影响因子:
3.1
作者:
[Liu, Shijia, Shao, Shangjin, Wang, Lushan]
通讯作者:
Wang, Lushan
共 10 条
整合组学技术分析嗜热微生物降解生物质的偏好性与酶系高效分泌机制
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批准号:31770054
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项目类别:面上项目
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资助金额:65.0万元
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批准年份:2017
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负责人:王禄山
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依托单位:
糖苷水解酶GH5亚家族活性中心架构及其功能快速演化的相关机理研究
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批准号:31370111
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项目类别:面上项目
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资助金额:80.0万元
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批准年份:2013
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负责人:王禄山
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依托单位:
外切纤维素酶I高效降解结晶纤维素动态学过程与充分条件
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批准号:31070063
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项目类别:面上项目
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资助金额:40.0万元
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批准年份:2010
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负责人:王禄山
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依托单位:
高通量分析天然生境中纤维素酶多样性蛋白组学方法的建立
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批准号:30970092
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项目类别:面上项目
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资助金额:30.0万元
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批准年份:2009
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负责人:王禄山
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依托单位:
酶解过程中纤维超分子结构变化与纤维素酶组分的构效分析
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批准号:30870044
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项目类别:面上项目
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资助金额:8.0万元
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批准年份:2008
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负责人:王禄山
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依托单位:
纤维素酶解过程中外切纤维素酶Ⅰ分子失活原因的分析
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批准号:30500007
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:28.0万元
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批准年份:2005
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负责人:王禄山
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依托单位:
国内基金
海外基金