利用转基因的方法，分别创制了稻瘟菌无毒基因AvrPiz-t的三个水稻互作蛋白基因的过量表达和RNAi沉默的转基因水稻，利用无毒和有毒菌株接种分析发现，APIP3，APIP12的过量表达或沉默不影响Piz-t介导的抗性机制，这些结果表明，APIP3和APIP12可能并不参与Piz-t介导的抗病反应。但是APIP12的RNAi沉默植株对稻瘟菌的非小种抗性明显降低，而且沉默植株开花期显著延后，这说明了，APIP12作为正调控基因，参与了水稻基础抗性，同时APIP12可能参与了对水稻开花的调控过程。酵母双杂分析发现，APIP12的C端的Nucleoporin2结构域并不参与和AvrPiz-t的互作，其蛋白的中间部分是与AvrPiz-t互作的区域。有意思的是，APIP12的N端与另外两个APIP蛋白，即APIP6和APIP8存在着相互作用。RT-PCR分析发现三个APIP基因在水稻与稻瘟菌互作过程中存在着表达的变化，进一步说明了它们参与了水稻抗病过程。AvrPiz-t的转基因水稻相对于非转基因水稻，对有毒菌株的抗性显著降低，这说明了AvrPiz-t作为毒基因降低了植株的基础抗性，进一步证实了AvrPiz-t作为毒蛋白的功能。利用烟草瞬时表达系统，初步发现APIP3可能是一个叶绿体蛋白，而APIP12的亚细胞定位并不清楚。另外，通过与其他课题组合作，完成了另一个APIP蛋白，即APIP6的功能分析，发现APIP6作为一个E3泛素连接酶，参与了水稻的基础抗性。利用核磁共振技术，分析了AvrPiz-t的高级结构，发现AvrPiz-t存在着两个ß折叠。AvrPiz-t的成熟蛋白中包含的四个半胱氨酸残基只存在一个双硫键，另外两个半胱氨酸残基处于还原状态。功能互补分析发现，4个半胱氨酸残基对于AvrPiz-t的功能都是必需的。