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脑胶质瘤中lncRNA NEAT1功能网络的解析及其对Hedgehog信号通路调节机制的研究
结题报告
批准号:
81572701
项目类别:
面上项目
资助金额:
55.0 万元
负责人:
蒋传路
依托单位:
学科分类:
H1802.肿瘤发生
结题年份:
2019
批准年份:
2015
项目状态:
已结题
项目参与者:
张俊和、韩煊烨、崔玉琼、刘幸、蔡金全、张平、刘大明、韩博
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中文摘要
胶质瘤是最常见的颅内原发肿瘤,其恶性生物学行为与Hedgehog信号通路的异常激活有关。课题组前期对220例胶质瘤患者临床资料和组织样本基因表达谱研究发现,长链非编码RNA NEAT1是胶质瘤独立预后因子,其表达水平与胶质瘤增殖、侵袭等恶性生物学行为及与胶质瘤分子分型相关,与Hedgehog信号通路转录密切相关。.本项目以上述结果为依托,研究NEAT1对胶质瘤恶性细胞生物学行为及化疗药物敏感性的影响;研究NEAT1通过PRC2复合物/DBHS蛋白家族对Hedgehog信号通路的调控及GLIs通过直接与NEAT1启动子区结合对其转录的影响;并构建不同NEAT1表达状态下编码基因mRNA和非编码基因RNA层面的复杂功能网络,体内外实验验证此调控网络间互作关系。本研究可揭示NEAT1对胶质瘤恶性生物学行为和Hedgehog信号通路的调控意义,为胶质瘤靶向治疗和分子标记物的确定提供实验依据。
英文摘要
Glioma is the most common primary brain tumor in adults. Aberrant activation of Hedgehog signaling pathway are extensively involved in the pathobiology and malignant progression of glioma. We profiled the lncRNA expression signatures in 220 gliomas, and identified that expression of NEAT1 was positively correlated with glioma grade and poor prognosis. Multivariate Cox regression analysis revealed that NEAT1 was an independent prognostic factor in GBM patients. Moreover, NEAT1 was correlated with Hedgehog activity and GSEA analysis indicated that NEAT1 regulating-gene-sets were enriched in glioma malignancy, including proliferation, invasion (migration) and angiogenesis. .. Based on these studies, we aim to investigate the functional role of NEAT1 on glioma cells using NEAT1 RNAi and lentivirus system. Then, we investigate the latent mechanism of NEAT1 on Hedgehog activity via PRC2 complex or DBHS family and positive feedback regulation of GLIs on NEAT1. Whole transcriptom sequencing technology was used to establish the comprehensive regulatory network of NEAT1 on both mRNA/non-coding RNA and to identify the regulatory function of this network in vivo and in vitro. The present study may provide insides for understanding the comprehensive networks of NEAT1 in glioma and provide a new biomarker and treatment strategy for clinical glioma management.
本项目已按计划完成所有研究内容,取得创新型研究成果,其中研究内容主要集中在以下几个方面:课题组发现存在EGFRvIII突变的胶质瘤细胞中,lncRNA NEAT1存在过表达的情况,通过公共胶质瘤RNA表达数据集,发现NEAT1是潜在的癌基因,NEAT1水平受EGFR通路活性的调节,该通路由STAT3和EGFR通路下游的NFκB(p65)介导。我们首次验证了lncRNA NEAT1/EZH2/β-Catenin调控方式在肿瘤发生和发展中起到重要作。我们通过构建胶质母细胞瘤耐药细胞系,并通过生物信息学分析和生物分子实验,发现了与替莫唑胺耐药的lncRNA lnc-TALC,lnc-TALC在脑胶质瘤替莫唑胺耐药中起到重要作用,它能够通过结合miR-20b-3p上调c-Met表达,并通过Stat3信号通路组蛋白修饰调控MGMT的表达,介导胶质母细胞瘤替莫唑胺化疗耐药。另外,FOXO3能够结合HDAC,介导lnc-TALC启动子区H3组蛋白的乙酰化修饰,而激活的AKT通过磷酸化泛素化FOXO3使其降解,增加lnc-TALC的表达水平。另外,通过数据库分析、高通量测序的多组学联合分析,发现了LGALS1、IGFBP2、MDK在调节胶质瘤方面的重要功能。在SHH/GLI1通路的研究中,我们发现GANT61、阿司匹林及QKI对于胶质瘤的治疗具有重要意义。在分析胶质瘤样本和公共数据库信息中,发现IDH1-R132H和(或)ATRX状态可能是提供胶质瘤“综合诊断”基本分子信息所必需的,此外,ATRX通过调节ATM通路参与DNA损伤修复,可能成为预测TMZ化疗敏感性的预后因子。本项目研究过程中,参与会议交流多次,并作为大会汇报项目。在本项目资助下,发表SCI收录论著15篇,最高影响因子为12.353,申请国家发明专利2项。同时,本项目研究过程中,课题组对于脑胶质瘤数字化生物样本库的建设进一步完善。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Immunogenomic analysis reveals LGALS1 contributes to the immune heterogeneity and immunosuppression in glioma
免疫基因组分析揭示 LGALS1 有助于神经胶质瘤的免疫异质性和免疫抑制
DOI:10.1002/ijc.32102
发表时间:2019-07-15
期刊:INTERNATIONAL JOURNAL OF CANCER
影响因子:6.4
作者:Chen, Qun;Han, Bo;Cai, Jinquan
通讯作者:Cai, Jinquan
Lnc-TALC promotes O6-methylguanine-DNA methyltransferase expression via regulating the c-Met pathway by competitively binding with miR-20b-3p
Lnc-TALC 通过与 miR-20b-3p 竞争性结合调节 c-Met 途径促进 O6-甲基鸟嘌呤-DNA 甲基转移酶表达
DOI:10.1038/s41467-019-10025-2
发表时间:2019-05-03
期刊:NATURE COMMUNICATIONS
影响因子:16.6
作者:Wu, Pengfei;Cai, Jinquan;Jiang, Chuanlu
通讯作者:Jiang, Chuanlu
DOI:10.18632/oncotarget.7650
发表时间:2016-03-29
期刊:Oncotarget
影响因子:--
作者:Cai J;Zhu P;Zhang C;Li Q;Wang Z;Li G;Wang G;Yang P;Li J;Han B;Jiang C;Sun Y;Jiang T
通讯作者:Jiang T
Aspirin inhibits the SHH/GLI1 signaling pathway and sensitizes malignant glioma cells to temozolomide therapy.
阿司匹林抑制 SHH/GLI1 信号通路并使恶性胶质瘤细胞对替莫唑胺治疗敏感
DOI:10.18632/aging.101224
发表时间:2017-04
期刊:Aging
影响因子:--
作者:Ming J;Sun B;Li Z;Lin L;Meng X;Han B;Wang R;Wu P;Li J;Cai J;Jiang C
通讯作者:Jiang C
Combination epidermal growth factor receptor variant III peptide-pulsed dendritic cell vaccine with miR-326 results in enhanced killing on EGFRvIII-positive cells.
表皮生长因子受体变体 III 肽脉冲树突状细胞疫苗与 miR-326 的组合可增强对 EGFRvIII 阳性细胞的杀伤力
DOI:10.18632/oncotarget.15445
发表时间:2017-04-18
期刊:Oncotarget
影响因子:--
作者:Li J;Wang F;Wang G;Sun Y;Cai J;Liu X;Zhang J;Lu X;Li Y;Chen M;Chen L;Jiang C
通讯作者:Jiang C
线粒体MCUB调控糖代谢促进脑胶质瘤恶性进展的机制研究
  • 批准号:
    82230086
  • 项目类别:
    重点项目
  • 资助金额:
    261万元
  • 批准年份:
    2022
  • 负责人:
    蒋传路
  • 依托单位:
基于增强子驱动的lnc-TNT经顺式作用正反馈调控介导胶质瘤耐药的机制研究
  • 批准号:
    81972817
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    55.0万元
  • 批准年份:
    2019
  • 负责人:
    蒋传路
  • 依托单位:
EGFRvIII调控组蛋白H2B翻译后修饰促进脑胶质瘤间质转化的表观遗传学研究
  • 批准号:
    81772666
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    55.0万元
  • 批准年份:
    2017
  • 负责人:
    蒋传路
  • 依托单位:
miR-328/SMO/GLI1解析脑胶质瘤中Hedgehog信号通路异常激活的新机制
  • 批准号:
    81372700
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    70.0万元
  • 批准年份:
    2013
  • 负责人:
    蒋传路
  • 依托单位:
国内基金
海外基金