乳腺癌是危害女性健康的最常见恶性肿瘤，其病因以环境暴露为主，DNA序列变异和基因表达调控起制约作用。Micro-RNA通过调控多种肿瘤相关基因参与乳腺癌发生发展。Micro-RNA靶序列SNP是一个重要的遗传标记体系，而现有靶序列SNP与肿瘤的关联研究规模较小，不足以代表此类SNP在肿瘤病因中的作用。本研究采用全基因组关联研究策略，共计纳入2744例病例和3125例对照，运用病例对照研究方法对全基因组192个micro-RNA种子区结合序列SNP基因分型，比较病例和对照的SNP基因型分布频率的差异。本研究包括关联研究和验证研究两个阶段，在在第一阶段我们选取1349例乳腺癌病例和1572例对照，用Illumina GoldenGate基因芯片法检测192个位点病例和对照的基因型，在第二个阶段我们另外选取1395例乳腺癌病例和1553例乳腺癌对照，采用TaqMan探针技术对于关联研究中获得的乳腺癌发病相关的15个micro-RNA种子区结合序列SNP和预后相关的8个micro-RNA种子区结合序列SNP进行验证。结果显示，HPGD基因（rs8752）与乳腺癌的发病风险相关，其中A基因型能够增加患乳腺癌的风险，特别是在ER+的人群中。GREM1基因（rs10318）与乳腺癌的预后相关，T基因型患者的乳腺癌特异性生存时间和无病生存时间较短。GREM1基因（rs10318）还与乳腺癌患者ER状态有关，T基因型患者ER阴性比例高。综上，本项目通过流行病学病例对照研究找到与乳腺癌发病和预后相关的microRNA靶序列SNP位点，确定了乳腺癌发病和预后的新的分子标志物，为乳腺癌病因提供了科学线索。