大豆蛋白质含量相关基因精细定位及其功能多态序列的发掘

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    30971818
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    26.0万
  • 负责人：
    文自翔
  • 依托单位：
    河南省农业科学院
  • 学科分类：
    C1307.作物基因组及遗传学
  • 结题年份：
    2012
  • 批准年份：
    2009
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

黄淮地区是我国高蛋白大豆优势生产区，利用黄淮地区的高蛋白亲本材料，精细定位蛋白含量相关基因，对该地区高蛋白分子育种有积极的作用。由于家系连锁作图和关联作图在QTL定位的精度和广度、提供的信息量等方面具有明显的互补性，本研究拟对大豆蛋白质含量进行基于家系的连锁作图，同时以栽培大豆微核心种质为自然群体代表性样本（附加部分高蛋白育成品种），采用关联作图的方法验证连锁作图的结果，在验证后的QTL区间内，依据Williams82物理图谱及转录图谱选用SNP等分子标记进行关联作图，对目标位点进行精细定位，利用生物信息学的方法，进行候选基因排查，将入选的候选基因与重复鉴定的表型性状（蛋白质含量）相结合进行关联作图，发掘自然群体中蛋白质含量相关的QTN（Quantitative trait nucleotide）或功能多态序列，为高蛋白大豆品种的分子设计育种提供技术支撑。

结项摘要

黄淮地区是我国高蛋白大豆优势生产区，利用黄淮地区的高蛋白亲本材料，精细定位蛋白含量相关基因，对该地区高蛋白分子育种有积极的作用。本项目首先利用ZDD09454×豫豆12号衍生的重组自交家系群体（RIL）对大豆水溶蛋白质含量进行了QTL初步定为，构建了包括301个SSR标记、3576.81cM的遗传连锁图谱，发掘到15个大豆水溶蛋白相关的QTL，可解释其4.5–18.2%的表型变异；进一步以栽培大豆微核心种质及1236份育成品种构成的自然群体为样本，对其进行基于134个SSR标记、52410个SNP标记的基因分型，采用全基因组关联分析方法对蛋白相关性状记进行关联作图，对目标位点进行精细定位，发掘到14个蛋白质含量相关的QTN（Quantitative trait nucleotide），可解释蛋白含量性状50.1%的变异。本研究实现了对蛋白相关性状精细定位，同时可为高蛋白大豆品种的分子设计育种提供技术支撑。

项目成果

期刊论文数量（4）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
大豆微核心种质蛋白亚基含量变异的分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    河南农业科学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    简爽;卢为国;文自翔;李海朝;袁道华;李金英;张辉;叶永忠
  • 通讯作者：
    叶永忠
运用关联分析定位栽培大豆蛋白11S、7S组分的相关基因位点
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    作物学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    简爽;文自翔;李海朝;袁道华;李金英;张辉;叶永忠;卢为国
  • 通讯作者：
    卢为国
Identification of the quantitative trait loci (QTL) underlying water soluble protein content in soybean
大豆水溶性蛋白含量的数量性状位点（QTL）鉴定
  • DOI：
    10.1007/s00122-012-1990-8
  • 发表时间：
    2013-02-01
  • 期刊：
    THEORETICAL AND APPLIED GENETICS
  • 影响因子：
    5.4
  • 作者：
    Lu, Weiguo;Wen, Zixiang;Du, Weiijun
  • 通讯作者：
    Du, Weiijun
大豆重组自交家系群体动态株高及其相对生长速率与产量的关系
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    作物学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    黄中文;王伟;徐新娟;文自翔;李海朝;李金英;卢为国
  • 通讯作者：
    卢为国

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其他文献

中国栽培及野生大豆的遗传多样性、地理分化和演化关系研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    科学通报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    文自翔;赵团结;丁艳来;盖钧镒
  • 通讯作者：
    盖钧镒
中国野生大豆群体农艺加工性状与SSR关联分析和特异材料的遗传构成
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    作物学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    范虎;文自翔;王春娥;王芳;邢光南;赵团结;盖钧镒
  • 通讯作者：
    盖钧镒

其他文献

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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