本研究结合了现场流行病学、分子流行病学和社会学研究方法，以农村县结防所服务人群中的结核病人为对象，分析农村社区人群中耐药结核病流行特征及影响耐药结核病发生和传播的生物、人口和社会经济危险因素，探讨结核分枝杆菌(M.TB)基因型"成簇性"、耐药结核病的耐药基因特点及其与结核病"成簇性"传播的关系、新近感染和内源性复燃对耐药结核病传播的意义以及耐药位点功能表达等热点问题。研究采用了经典的IS6110-RFLP法和先进的MIRU、Spoligotyping指纹技术来分析M.TB基因型，以测序方法分析M.TB耐药基因位点，并以成簇性分析、基因－基因/环境交互作用分析以及社会学定性研究方法来反映生物和社会经济因素对耐药结核病发生和传播的影响。研究结果将有助于为我国的结核病控制提供完整、科学的人群基础资料，为阻断耐药结核病传播提供策略依据，并能为研制耐药结核病快速诊断方法和抗结核疫苗提供重要信息。