云南省丙型肝炎病毒遗传多样性及其进化差异研究

在本课题的支持下，研究组通过广泛合作，分别从大理（527）和昆明（150）静脉吸毒人群中得到HCV感染者血浆样品共计677份，以HCV 5’NCR 和NS5b 区作为主要分型区段，确定了该人群的HCV基因型和亚型的分布。发现该人群呈现出以HCV3b为主1b、3a为辅，6型复杂多样的流行态势。利用NS5b区段为目的序列，进行HCV主要流行基因型3b、1b、3a和6n型内差异度，和进化分析（进化速率、起源时间、起源地），发现不同基因型的起源时间、起源地以及感染人群的爆发时间各不相同。.确定了云南省泸西县及昆明市的720名普通人群中近超过30%的HCV高感染率。经肝功生化指标与病毒载量等病毒学指标比较发现，肝损伤与AST、ALT和AKP等生化指标的升高直接相关，但与HCV病毒载量不相关。在云南省普通人群中HCV感染者中，HCV基因型分布主要包括1b、2a、3a、3b和6n五种基因亚型。该HCV基因型亚型的分布与云南地区静脉吸毒人群的相比有明显差异，但HCV 3b和1b基因型为主的流行趋势一致。.选择了不同基因型的HCV单感染患者，在其自然病程中连续采集血样，扩增高变的E2和NS5A区基因区段，多克隆测序并进行准种多样性分析。发现慢性感染者NS5A区准种核苷酸变化主要是由遗传漂变引起的，体内NS5A区变异模式相同，即E2区和NS5A区两个基因区段存在协同进化关系。.对云南省不同人群和不同地区中GBV-C的感染、基因型流行、进化起源以及高清除率的相关机制的研究发现，GBV-C在云南地区高度流行且发现了新的基因型并命名为GBV-C 7型，提出了以E2区序列为基础的基因型分型的新标准；通过对GBV-C进化和起源的研究，阐明了我国和云南地区的GBV-C基因型进化特点和传播路径。.对临床采集的75例HBV感染者血浆样本，进行核酸提取，S区段基因扩增，核酸序列测定与分析，发现云南地区HBV基因型的分布总体与中国大部分地域B、C为主要流行的趋势一致，但仍存在东南亚最新流行的C1、C5与I型，及在中国西北新疆、西藏、宁夏等地曾发现的C/D重组型。此HBV流行与传播态势，可能因贩毒、吸毒，受到东南亚地区主要HBV基因型的影响，并进一步影响中国HBV基因型分布态势。.以上结果初步阐明了HCV、GBV-C及HBV云南省传播、流行与进化情况，为血缘传播病毒性肝炎病原体的预防控制提供了科学依据。