FACS辅助mRNA展示技术筛选fluorogenic多肽探针的新方法研究

批准号:
21708044
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
25.0 万元
负责人:
王伟
依托单位:
学科分类:
B0701.生物体系分子探针
结题年份:
2020
批准年份:
2017
项目状态:
已结题
项目参与者:
李希祥、刘学松、吴云、王黎、邓远欣
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中文摘要
Fluorogenic多肽探针是和靶标作用时能产生荧光或荧光增强现象的识别分子,具有特异性好、亲和力高、免洗等优点,在蛋白质检测领域应用广泛。多肽展示技术是筛选fluorogenic多肽的有效方法之一,可以克服理性设计依赖天然存在的多肽配体或底物的限制,但多数筛选出来的多肽和蛋白结合后荧光不增强。本项目拟将mRNA展示技术与流式分选技术相结合,以受体蛋白PDGFRA胞外段为模型,开展fluorogenic多肽探针筛选新方法研究。研究内容包括:1)构建一个环境敏感型荧光基团4-DMN修饰的mRNA展示多肽文库;2)分别以BaF3-PDGFRA细胞和磁珠固定的PDGFRA为模型靶标,利用流式分选出靶向PDGFRA的多肽探针。测量目标多肽和蛋白结合的亲和力以及结合后荧光变化情况。通过对比新方法和现有方法,得出各种方法的优缺点,为建立一种高效筛选fluorogenic多肽探针的新方法提供实验基础。
英文摘要
Fluorogenic peptides are molecules that can generate or enhance fluorescence when interacting with target and are widely used in protein detection field due to their specificity, high affinity and wash-free properties. Peptide display technologies are effective tools for screening fluorogenic peptides and could overcome limits of rational design that rely on natural existing peptide ligand or peptide substrate. However, in most case, selected peptides do not increase fluorescence intensity upon target recognition. Therefore, we propose to use PDGFRA as the model target to study new selection strategies that integrate mRNA display and fluorescence-activated cell sorting. This research will include: 1)Generate an environment sensitive fluorophore 4-DMN modified peptide library; 2)Select peptide probes that specifically bind to PGFDRA using cells and magnetic immobilized protein as target, respectively. Determine the dissociation constant of selected peptides against to PDGFRA, measure fluorescence intensity change of the selected peptides upon binding to PDGFRA. Compare the advantages and disadvantages of the new methods and existing method and hopefully this will pave the way for developing a novel selection method for screening fluorogenic peptides.
Fluorogenic多肽探针是和靶标作用时能产生荧光或荧光增强现象的识别分子,具有特异性好、亲和力高、免洗等优点,在蛋白质检测领域应用广泛。多肽展示技术是筛选fluorogenic多肽的有效方法之一,但多数筛选出来的多肽和蛋白结合后荧光不增强。本项目主要目的是建立一种高效的筛选fluorogenic多肽探针的方法,并筛选出能识别PDGFRA的多肽探针。本项完成了环境敏感型荧光基团的设计合成工作、优化了荧光探针与多肽Cys残基反应条件、建立了体外mRNA展示文库、构建了BaF3-PDGFRA细胞。我们分别以磁珠固定的PDGFRA和用基因工程构建的BaF3-PDGFRA细胞为靶点,将mRNA展示技术与流式分选技术相结合,进行了大量的fluorogenic多肽探针筛选工作。经过多轮筛选后,得到潜在的多肽探针,固相合成筛选得到的多肽,分别利用MST和流式验证化学合成的多肽识别靶标的能力。由于细胞表面生物大分子成分的高度复杂性以及细胞层次与磁珠固定蛋白筛选体系之间的差异,项目最终获得的多肽与表面过表达靶标蛋白分子的细胞或游离的蛋白相结合的亲和力和特异性仍不够理想,有待进一步探索。在该项目的研究过程中,所构建的多种激酶靶点细胞模型成功应用于课题组的激酶小分子药物筛选及机制研究并发表SCI论文3篇。这些细胞模型对于小分子靶向药物的发现以及靶点确证和作用机制的研究等具有重要的意义。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Discovery of 4-(((4-(5-chloro-2-(((1s,4s)-4-((2-methoxyethyl)amino) cyclohexyl)amino)pyridin-4-yl)thiazol-2-yl)amino)methyl) tetrahydro-2H-pyran-4-carbonitrile (JSH-150) as a novel highly selective and potent CDK9 kinase inhibitor
4-(((4-(5-氯-2-(((1s,4s)-4-((2-甲氧基乙基)氨基)环己基)氨基)吡啶-4-基)噻唑-2-基)的发现
DOI:10.1016/j.ejmech.2018.09.025
发表时间:2018-10-05
期刊:EUROPEAN JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY
影响因子:6.7
作者:Wang, Beilei;Wu, Jiaxin;Liu, Qingsong
通讯作者:Liu, Qingsong
Discovery of (E)-N-(4-((4-methylpiperazin-1-yl)methyl)-3-(trifluoromethyl)phenyl)-3-((3-(2-(pyridin-2-yl)vinyl)-1H-indazol-6-yl)thio)propanamide (CHMFL-ABL-121) as a highly potent ABL kinase inhibitor capable of overcoming a variety of ABL mutants including T315I for chronic myeloid leukemia
(E)-N-(4-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-3-(三氟甲基)苯基)-3-((3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)的发现
DOI:10.1016/j.ejmech.2018.10.007
发表时间:2018-12-05
期刊:EUROPEAN JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY
影响因子:6.7
作者:Liu, Xuesong;Wang, Beilei;Liu, Jing
通讯作者:Liu, Jing
Discovery of (E)-N1-(3-Fluorophenyl)-N3-(3-(2-(pyridin-2-yl)vinyl)-1H-indazol-6-yl)malonamide (CHMFL-KIT-033) as a Novel c-KIT T670I Mutant Selective Kinase Inhibitor for Gastrointestinal Stromal Tumors (GISTs)
(E)-N-1-(3-氟苯基)-N-3-(3-(2-(吡啶-2-基)乙烯基)-1H-吲唑-6-基)丙二酰胺(CHMFL-KIT-)的发现
DOI:10.1021/acs.jmedchem.9b00176
发表时间:2019-05-23
期刊:JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY
影响因子:7.3
作者:Liu, Xuesong;Wang, Beilei;Liu, Jing
通讯作者:Liu, Jing
石墨烯复合陶瓷阻氚涂层增韧机理研究
- 批准号:51802308
- 项目类别:青年科学基金项目
- 资助金额:27.0万元
- 批准年份:2018
- 负责人:王伟
- 依托单位:
国内基金
海外基金
