基于蛋白质结构域插入事件的结构域架构进化研究

批准号：

30571037

项目类别：

面上项目

资助金额：

28.0 万元

负责人：

林魁

依托单位：

北京师范大学

学科分类：

基因组学

结题年份：

2008

批准年份：

2005

项目状态：

已结题

项目参与者：

庞尔丽、雒应琴、周红军、朱蕾、吴晓梅、林雯、付聪、郭洁

关键词：

结构域架构结构域插入生物信息学进化。蛋白质结构域

项目摘要

结项摘要

项目成果

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中文摘要

结构域（domain）是蛋白质的结构、功能和进化的单位。大多数蛋白质由一个或多个结构域组成，多结构域蛋白质的进化过程主要表现为不同结构域的插入、获得、缺失以及相同结构域的重复等。在蛋白质结构域架构（domain architecture）的水平上研究多结构域蛋白质的进化，分析不同结构域架构之间的进化关系，对于理解多结构域蛋白质之间以及结构域之间的功能关系是非常重要的。越来越多的蛋白质三维结构数据给结构域架构的进化研究提供了宝贵的材料，我们将用统计学方法研究蛋白质三维结构的结构域组合规律，从结构域插入这一进化过程入手深入到基因的水平上，在基因的重复、重组、融合和分裂等基本进化事件及其相互关系中，用生物信息学特别是系统发育分析、机器学习等工具，探究结构域架构的进化过程和分子机制以及相伴随的新基因的起源和进化问题。

英文摘要

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