基于患者相似性分析的普适性临床决策支持方法研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81871456
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    57.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2806.医学信息系统与远程医疗
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

The accumulation of medical big data provides a new foundation for providing clinical decision support through discovering medical knowledge and establishing predictive models based on data mining. Patient similarity analysis which measure universal inter-patient distance has the potential to acquire knowledge of disease development, provide general clinical decision support based on huge volume clinical data, and has become an important direction for the translation of medical artificial intelligence. Although this approach has been initially validated in many clinical field such as cancer, endocrine diseases and heart disease, it is still a challenge to systematically and dynamically evaluate the similarity of patients to make it universally applicable in clinical decision support. Patients’ clinical data belong to diverse semantic spaces with different dimensions. Therefore, this study will firstly systematically study and evaluate the similarity assessment of clinical concepts and concept sets in different semantic spaces respectively. Then, this study will evaluate the similarity of a clinical data and process in a dynamic temporal sequence. Finally, a systematic and dynamic patient similarity analysis model will be studied and evaluated. A translational study will be supported by the National Medical BigData Engineering Lab.
医疗数据的广泛积累为通过数据挖掘来获得医学知识、建立预测模型开展临床决策支持提供了新的基础。患者相似性分析基于普适的患者间距离评估具有从大量临床实践数据中获取疾病发展规律、提供通用决策支持的可能,并成为了医学人工智能技术临床转化的一个重要方向。虽然该方法已在癌症、内分泌疾病、心脏疾病等多个领域获得初步的验证,但是如何系统性的动态评估患者相似性使得其具有普适的临床决策支持能力目前仍然是一个挑战。患者具有大量多维度不同语义空间的临床数据,因此本研究第一层面上将分别就不同语义空间的临床概念和概念集的相似性评估方法进行系统研究和评估,获得一系列特征空间内部相似性评估的理论和方法;进一步研究如何对一个动态过程中的临床数据和临床过程的相似性进行评估,掌握多种时间尺度下的动态患者相似性分析理论和方法;最终研究和构建综合动态模型下患者相似性分析计算体系和临床决策支持原型系统开展临床评估和验证。

结项摘要

医疗大数据的积累为通过数据挖掘和分析来建立预测方法和获得预测模型提供了基础。患者相似性分析基于普适的患者间距离评估从大量临床实践数据中获取患者相似组,通过对患者相似组数据的总结归纳来获取疾病发展的普遍规律来服务于计算机辅助临床决策支持,达到个性化诊疗的目的。这种人工智能模式本质上是传统临床思维类比推理的技术延伸,因此具有更好的临床可解释性和普适性,已成为了医学人工智能技术向临床转化最重要的一个方向。该项目针对如何利用患者相似性分析提供普适性临床决策支持开展了一系列的基础方法和应用研究,该课题进展顺利,已经发表相关论文25篇,其中SCI论文21篇,申请发明专利6项,其中已经授权发明专利2项,项目过程中建立了较为系统的患者相似性计算方法体系,对于临床层次语义空间中概念距离计算、临床药物的距离计算、诊断概念和诊断集距离的计算、表型和罕见病间的距离计算、动态特征下的距离计算等进行了系统研究并在国内外权威期刊发表相关成果,相关方法在罕见病诊断、先天性心脏病术后风险预测等多个临床应用场景中进行验证取得良好效果,同时展现了良好的应用推广前景,项目期间培养博士生3人,硕士生3人。

项目成果

期刊论文数量(25)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(2)
专利数量(6)
Using Z-score to optimize population-specific DDH screening: a retrospective study in Hangzhou, China.
使用 Z 分数优化人群特异性 DDH 筛查:中国杭州的一项回顾性研究
  • DOI:
    10.1186/s12891-021-04216-6
  • 发表时间:
    2021-04-12
  • 期刊:
    BMC musculoskeletal disorders
  • 影响因子:
    2.3
  • 作者:
    Li H;Shu L;Yu J;Xian Z;Duan H;Shu Q;Ye J
  • 通讯作者:
    Ye J
Deep Dynamic Patient Similarity Analysis: Model Development and Validation in ICU
深度动态患者相似性分析:ICU 中的模型开发和验证
  • DOI:
    10.1016/j.cmpb.2022.107033
  • 发表时间:
    2022-07
  • 期刊:
    Computer Methods and Programs in Biomedicine. 225(2022) 107033
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Zhaohong Sun;Xudong Lu;Huilong Duan;Haomin Li
  • 通讯作者:
    Haomin Li
Risk factors for central venous catheter-associated deep venous thrombosis in pediatric critical care settings identified by fusion model.
通过融合模型识别儿科重症监护环境中中心静脉导管相关深静脉血栓形成的危险因素
  • DOI:
    10.1186/s12959-022-00378-y
  • 发表时间:
    2022-04-12
  • 期刊:
    Thrombosis journal
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
  • 通讯作者:
PedMap: a pediatric diseases map generated from clinical big data from Hangzhou, China
PedMap:根据中国杭州临床大数据生成的儿科疾病地图
  • DOI:
    10.1038/s41598-019-54439-w
  • 发表时间:
    2019-11-28
  • 期刊:
    SCIENTIFIC REPORTS
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Li, Haomin;Yu, Gang;Shu, Qiang
  • 通讯作者:
    Shu, Qiang
A computational method to quantitatively measure pediatric drug safety using electronic medical records
  • DOI:
    10.1186/s12874-020-0902-x
  • 发表时间:
    2020-01
  • 期刊:
    BMC Medical Research Methodology
  • 影响因子:
    4
  • 作者:
    Gang Yu;Xian Zeng;Shaoqing Ni;Zheng Jia;Weihong Chen;Xudong Lu;Jiye An;Huilong Duan;Qiang Shu;Haomin Li
  • 通讯作者:
    Haomin Li

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  • 作者:
    李昊旻;李莹;段会龙;吕旭东
  • 通讯作者:
    吕旭东

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李昊旻的其他基金

中文医学文本中关联信息提取方法研究
  • 批准号:
    30900329
  • 批准年份:
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  • 项目类别:
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相似国自然基金

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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