沙门氏菌是重要的致病菌，可引起人或动物的伤寒病或胃肠炎。其中，伤寒沙门氏菌在全球范围内每年使1千600万人罹患伤寒病，并导致60多万人死亡。各种沙门氏菌之间亲缘关系非常接近，遗传上也极为相似，然而其致病性或宿主范围却有很大不同。本项目将通过代表性沙门氏菌的比较研究，找出其遗传上的异同，进而探讨其多样致病性进化的分子机制。由于各种沙门氏菌有大约90%基因同源，因此分析的重点将是基因组上10%左右各自不同的基因。我们将用生物信息学方法初步推测未知基因的功能，进一步用动物实验验证其功能，包括用基因置换法把可能的致病基因敲入到另外的沙门氏菌遗传背景中去然后感染动物，观察其后果，然后再用基因置换法将该基因敲除，以进一步验证其功能。我们还将建立宿主变换的动物模型，即把目的基因逐一敲入到某个单一宿主沙门菌中，令其感染原本不能感染的宿主。该模型将用于宿主-病原体相互作用机制的深入研究。