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长链非编码RNA-AC006159.3调控c-Met在结直肠癌cetuximab耐药中的机制研究
结题报告
批准号:
81572291
项目类别:
面上项目
资助金额:
57.0 万元
负责人:
叶乐驰
依托单位:
学科分类:
H1821.肿瘤治疗抵抗
结题年份:
2019
批准年份:
2015
项目状态:
已结题
项目参与者:
王瓯晨、吕世旭、楼哲丰、郑祥韬、张玮、瞿金妙、陈恩东、刘叶欢、杨帆
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中文摘要
表皮生长因子受体的单克隆抗体——cetuximab(西妥昔单抗,简称C)在KRAS基因野生型转移性结直肠癌的靶向治疗中有好的疗效,但临床研究发现仍有部分该类肠癌患者对C耐药,且机制未明。在前期工作中,本课题组利用C耐药的肠癌组织及肠癌细胞株进行lncRNA芯片筛查并结合大样本验证,原创性地鉴定了1个与C耐药相关的lncRNA,即lncRNA-AC006159.3(简称A)。信息学分析发现其邻近存在c-Met 编码基因,而后者已被证实与C耐药存在关联;我们后续工作进一步提示A可通过上调c-Met介导C在肠癌治疗中的耐药。在此基础上,本项目拟重点研究A调控c-Met的精细机制,从直接相互作用或通过中间蛋白调节来系统探讨其调控形式,以阐明A介导c-Met影响C耐药的分子途径。本研究将有助于从lncRNA 角度深入理解C在肠癌中耐药的分子机制,为预测抗EGFR靶向治疗效果及逆转耐药提供新思路。
英文摘要
Cetuximab is an epidermal growth factor receptor (EGFR) monoclonal antibody, and cetuximab combined therapy has been approved to bring a favorable effect on survival or tumor response in the patients with KRAS wild-type metastatic colorectal cancer (mCRC). However, still a subset of mCRC patients exhibit either de novo or acquired resistance to cetuximab-based therapy with unknown mechanisms. In our preliminary work, by using lncRNA array for screen and test in samples of mCRC with cetuximab resistance, we found one novel lncRNA, named with lncRNA-AC006159.3. This down-expressed lncRNA could promote CRC cell acquired resistance to cetuximab, which had been tested and verified in cell and nude mice. Moreover, we found a known coding gene-c-Met, associated with cetuximab-resistance, was adjacent to lncRNA-AC006159.3. Our preliminary work further showed that thus lncRNA might play a key role in cetuximab-resistance by promoting the expression of c-Met gene. On the above base, this project aimed to study the mechanism of how the lncRNA-AC006159.3 regulate the c-Met, where two way would be designed: one way is the lncRNA-AC006159.3 may directly link up with SPARC; the other w ay is the lncRNA-AC006159.3 may first recruit one median protein, then together combine with c-Met and adjust the expression. This study could help not only to rich the mechanism of cetuximab-resistance, but also to establish a theoretical basis of conquer the cetuximab resistance based on lncRNA.
表皮生长因子受体的单克隆抗体——cetuximab(西妥昔单抗)在RAS/BRAF基因野生型转移性结直肠癌的靶向治疗中有好的疗效,但临床研究发现仍有部分该类肠癌患者对此药耐受,且机制未明。在前期工作中,本课题组利用Cetuximab耐药的肠癌组织及肠癌细胞株进行lncRNA芯片筛查并结合样本验证,鉴定了1个与Cetuximab耐药相关的lncRNA,即lncRNA-AC006159.3(专利申请号2018109235960)。信息学分析发现其邻近存在c-Met 编码基因,而后者已被证实与Cetuximab耐药存在关联;后续工作进一步提示lncRNA-AC006159.3可通过上调c-Met介导Cetuximab在肠癌治疗中的耐药。在此基础上,本项目首先通过荧光素酶报告系统检测了AC006159.3对c-Met基因启动子活性的影响,结果实验组萤光素酶活性未见明显的差异。通过MSP/BSP技术,结果显示,在高/低表达AC006159.3的细胞中,c-Met基因启动子区域的DNA甲基化水平无显著差异。在高/低AC006159.3的表达情况下,多种组蛋白抗体的ChIP-seq结果均显示c-Met基因启动子区域的组蛋白修饰水平没有明显区别。对AC006159.3是否通过产生干扰性小RNA分子,结合c-Met基因的mRNA沉默其表达进行初步探索,荧光定量PCR结果对高/低AC006159.3实验组检测也未见统计学差异。课题组继续探究lncRNA-AC006159.3是否通过间接方式调控c-Met基因的表达。通过RIP和ChIP技术反向验证该分子的特异性和结合Motif,初步发现和lncRNA-AC006159.3相互作用的中间分子蛋白Nup37。进一步查阅文献,肿瘤方面有报道NUP37沉默可抑制非小细胞肺癌细胞的增殖、G1期细胞周期阻滞和凋亡;NUP37是YAP/TEAD信号通路的阳性调节因子,可促进肝细胞癌的进展,但在肿瘤耐药方面未见报道。另外,课题组围绕结直肠癌cetuximab耐药的核心问题采用多途径探索,包括利用上海吉凯公司平台,开展基于CRISPR/Cas9文库技术鉴定cetuximab 耐药基因的研究,初步筛选获得MMP15、MRPL48、CALN1、NRCAM、GPR124、HADHB这6个基因,经过文献分析后确认了MMP15、MRPL48、GPR124、HADH
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Downregulation of paraoxonase 3 contributes to aggressive human hepatocellular carcinoma progression and associates with poor prognosis.
对氧磷酶 3 的下调有助于侵袭性人类肝细胞癌的进展,并与不良预后相关。
DOI:10.1007/s13277-016-5247-z
发表时间:2016
期刊:Tumour Biol
影响因子:--
作者:Jin Yuepeng;Li Qiang;Qiu Junjun;Zhao Xiufen;Zheng Chunxiao;Lv Shixu;Bai Yongyu;Shan Yunfeng;Ye Le-Chi
通讯作者:Ye Le-Chi
KMT2A histone methyltransferase contributes to colorectal cancer development by promoting cathepsin Z transcriptional activation
KMT2A 组蛋白甲基转移酶通过促进组织蛋白酶 Z 转录激活促进结直肠癌的发生
DOI:10.1002/cam4.2226
发表时间:2019-07-01
期刊:CANCER MEDICINE
影响因子:4
作者:Fang, Yang;Zhang, Dan;Ye, Le-chi
通讯作者:Ye, Le-chi
Downregulated long non-coding RNA CLMAT3 promotes the proliferation of colorectal cancer cells by targeting regulators of the cell cycle pathway.
下调长非编码 RNA CLMAT3 通过靶向细胞周期途径的调节因子促进结直肠癌细胞的增殖。
DOI:10.18632/oncotarget.10431
发表时间:2016-09-13
期刊:Oncotarget
影响因子:--
作者:Ye LC;Chen T;Zhu DX;Lv SX;Qiu JJ;Xu J;Yuan FL;Wei Y
通讯作者:Wei Y
BRD4介导的代谢重编程调控ALKBH5+亚群参与结直肠癌化疗耐受的机制研究
  • 批准号:
    --
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    55万元
  • 批准年份:
    2021
  • 负责人:
    叶乐驰
  • 依托单位:
Cetuximab 调控 Nrf2/HO-1 信号通路促进 KRAS突变型肠癌细胞铁死亡的分子机制及联合抗肿瘤作用
  • 批准号:
    LY22H160021
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    0.0万元
  • 批准年份:
    2021
  • 负责人:
    叶乐驰
  • 依托单位:
国内基金
海外基金