镜像5S rRNA与蛋白复合体的合成与自组装

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31901027
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    17.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C2102.合成生物学与生物改造技术
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2021-12-31

项目摘要

In a biological system, all nucleic acids’ chirality is D form and all proteins’ chirality is L form. Whether a mirror-image life composed of L-nucleic acids and D-proteins exists is a very interesting question. To explore this possibility, we try to synthesize a chirally inverted central dogma which is the first big step in creating a mirror-image life. After the successful demonstration of mirror-image genetic replication and transcription, the next step in establishing a mirror-image version of the central dogma of molecular biology is to build a mirror-image ribosome. Our project plans to synthesize and assemble 5S ribonucleoprotein complex consisting of 5S rRNA and three ribosomal proteins (L5, L18, and L25) in the large subunit of the Escherichia coli ribosome. To overcome the limit of chemical synthesis of RNA, we chemically synthesized D-Dpo4 (DNA Polymerase IV) and transcribed L- 5S rRNA in vitro,and we have synthesized the mirror-image form of L25. Based on this, we will refold and test their acitvity and further assemble with enzymatically transcribed mirror-image 5S ribosomal RNA into stable ribonucleoprotein complexes through chiral-specific binding. Our project is the first step towards building a functional mirror-image ribosome. Furthermore, using mirror-image ribonucleoprotein complexes as an orthogonal model system has the potential to enable convenient in vitro functional and structural studies without requiring RNase decontamination, further leading to the realization of many applications such D-peptide drugs screening.
生物体内核酸和蛋白分子的手性分别是D型和L型,那么是否存在完全由L型的核酸和D型的蛋白构成的镜像生命呢?为探索这一可能性,我们利用合成生物学的手段尝试构建镜像中心法则,继复制与转录成功之后,核糖体介导的翻译过程无疑是最为关键和复杂的一步。作为先期探索,本项目计划合成和组装Escherichia coli核糖体中关键的复合体即5S RNP (包括5S rRNA和核糖体大亚基蛋白L5,L18和L25) 的镜像构型。我们利用D型的Dpo4通过体外转录得到了L型5S rRNA,而且我们已经合成出L型和D型的L25。在此基础上,本项目预期可以组装出有活性的镜像5S RNP。本项目是构建镜像核糖体的第一步,同时也为生物复合体的功能和结构的研究提供了一个新型无RNase污染的系统,为镜像药物的筛选奠定基础。

结项摘要

组成生命的基本物质DNA/RNA和蛋白的手性分别是D型和L型,那么是否存在完全由L型的DNA/RNA和D型的蛋白构成的镜像生命呢?本项目尝试通过合成生物来探索镜像生命存在的可能性。构建镜像生命的第一步是完成镜像的中心法则。目前,镜像中心法则已经完成了复制和转录两个过程,但是还缺乏最为关键的一步就是核糖体介导的翻译过程。 .作为镜像核糖体合成的先期探索,本项目对Escherichia coli核糖体中关键的复合体即5S RNP (ribonucleoprotein complex)的镜像形式进行合成和组装,进而初步解决镜像核糖体人工合成和组装的技术难题。化学合成了带有翻译后修饰的天然和镜像版本的三种核糖体蛋白 L5、L18 和 L25,并通过镜像转录获得了镜像 5S rRNA。对上述三种蛋白进行复性,并将其与镜像 5S rRNA一同组装获得了镜像 5S RNP。由此,我们探索了核糖体 RNA 与核糖体蛋白之间的作用关系,并证明了 5S rRNA 与核糖体蛋白之间的相互作用具有手性特异性。 本项目为镜像核糖体人工合成和组装的奠定坚实基础,同时镜像5S RNP的成功组装也可以为其他生物复合体功能和结构的研究提供一个新型无RNase污染的系统。

项目成果

期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Mirror-Image 5S Ribonucleoprotein Complexes
镜像 5S 核糖核蛋白复合物
  • DOI:
    10.1002/anie.201914799
  • 发表时间:
    2020-01-21
  • 期刊:
    ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION
  • 影响因子:
    16.6
  • 作者:
    Ling, Jun-Jie;Fan, Chuyao;Zhu, Ting F.
  • 通讯作者:
    Zhu, Ting F.

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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