本项目拟采用形态学和分子生物学两种手段研究车轮虫的物种多样性及其进化：（1）形态学研究，即结合活体与染色标本观察对所收集的车轮虫进行物种鉴定，并依据量化法将其齿体特征数量化进而构建进化树；（2）分子生物学研究，即同步分离已鉴定出的车轮虫物种并提取其基因组DNA，一方面采用COI基因扩增、克隆及测序，进行车轮虫DNA Barcoding的工作，另一方面以核糖体18S rRNA基因和Tublin基因为分子标记进行扩增、克隆及测序，并采用最大简约法、最大似然法、邻接法和贝叶斯法构建系统发育树；（3）结合形态特征和分子信息分析车轮虫的物种多样性，并比较基于齿体特征和基因序列构建的系统树的异同，分析车轮虫在不同阶元的亲缘关系。本研究将同时空的形态特征与分子序列数据统一于车轮虫的物种多样性及其进化研究，不但可丰富车轮虫形态多样性和分子多样性数据，而且可为研究车轮虫乃至整个缘毛类的进化研究提供新的依据。