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真菌侵染线虫蛋白酶的结构与功能研究

批准号：
30860011
项目类别：
地区科学基金项目
资助金额：
30.0 万元
负责人：
柳树群
依托单位：
云南大学
学科分类：
微生物生理与生化
结题年份：
2011
批准年份：
2008
项目状态：
已结题
项目参与者：
陶燕、杨连铭、张志晓、杨锦锦、顾雯
关键词：
动力学模拟结构模建线虫侵染酶定点突变结构-功能关系

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中文摘要
以本实验室克隆的真菌侵染、降解线虫的各种蛋白酶为研究对象，采用同源模建方法构建它们的蛋白质三维结构坐标。利用生物信息学计算手段，预测该类蛋白质的物理化学性质、底物结合区域和催化活性位点。进一步，在构建酶与底物或底物类似物复合物结构模型的基础上，利用动力学模拟手段和本质动力学分析方法，分析底物结合区域的几何特征、构象柔性、分子表面电势、以及酶与底物的相互作用能量和动力学特征，以期建立关键结构区域和关键氨基酸与酶催化活性的关系。最后，结合定点突变和酶动力学参数测定等生物化学实验手段，阐明相关侵染酶的结构动力学与催化效率、底物特异性和侵染能力的关系。为构建高效杀线虫工程菌株奠定基础。
英文摘要
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Molecular motions of proteins play crucial role in their function
蛋白质的分子运动对其功能起着至关重要的作用
DOI： --
发表时间： --
期刊： Journal of Biomolecular Structure & Dynamics
影响因子： 4.4
作者： [Yun-Xin Fu, Shi-Xi Liu, Shu-Qun Liu, Zhao-Hui Meng, Yan Tao, Ke-Qin Zhang]
通讯作者： Ke-Qin Zhang
The crystal structures of two cuticle-degrading proteases from nematophagous fungi and their contribution to infection against nematodes
食线虫真菌的两种角质层降解蛋白酶的晶体结构及其对线虫感染的贡献
DOI： 10.1096/fj.09-136408
发表时间： 2010-05-01
期刊： FASEB JOURNAL
影响因子： 4.8
作者： [Liang, Lianming, Meng, Zhaohui, Zhang, Ke-Qin]
通讯作者： Zhang, Ke-Qin
Thinking into Mechanism of Protein Folding and Molecular Binding
蛋白质折叠和分子结合机制的思考
DOI： --
发表时间： --
期刊： Journal of Biomolecular Structure & Dynamics
影响因子： 4.4
作者： [Xing-Lai Ji, Shu-Qun Liu]
通讯作者： Shu-Qun Liu
Insight Derived from Molecular Dynamics Simulation into Substrate-Induced Changes in Protein Motions of Proteinase K
通过分子动力学模拟深入了解底物诱导的蛋白酶 K 蛋白质运动变化
DOI： 10.1080/073911010010524953
发表时间： 2010-10
期刊： Journal of Biomolecular Structure & Dynamics
影响因子： 4.4
作者： [Liu, Shu-Qun, Rao, Zi-He, Tao, Yan]
通讯作者： Tao, Yan
共 8 条
    HIV-1 gp120的构象控制机制
    • 批准号：
      31370715
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      70.0万元
    • 批准年份：
      2013
    • 负责人：
      柳树群
    • 依托单位：
      云南大学
    极端温度丝氨酸蛋白酶的适应机理
    • 批准号：
      31160181
    • 项目类别：
      地区科学基金项目
    • 资助金额：
      55.0万元
    • 批准年份：
      2011
    • 负责人：
      柳树群
    • 依托单位：
      云南大学
    国内基金
    海外基金