中国汉族人群IL-23R的罕见遗传变异介导强直性脊柱炎发病机制的研究

结题报告

项目介绍

AI项目解读

基本信息

批准号：
81373216
项目类别：
面上项目
资助金额：
16.0万
负责人：
吴歆
依托单位：
中国人民解放军第二军医大学
学科分类：
H1107.自身免疫性疾病
结题年份：
2014
批准年份：
2013
项目状态：
已结题
起止时间：
2014-01-01 至2014-12-31

项目参与者：
张立斌；姜磊；殷健；刘玮；吕颖；杨晓平；
关键词：
发病机制关联研究 IL-23R 强直性脊柱炎

项目摘要

Ankylosing spondylitis (AS) is a highly heritable, common form of inflammatory arthritis affecting predominantly the spine and pelvis, for which there is no current treatment which induces remission or prevents the disabling progressive joint fusion that characterises this disease. In a major breakthrough in research into the aetiopathogenesis of spondyloarthropathies such as AS, we have recently found preliminary that IL-23R is not associated with AS in Chinese, indicating that common variants of IL-23R either plays no role or novel low-frequency genetic variants contribute.We aim to identify the key genetic variation in novel low-frequency non-synoymous SNPs of IL-23R or function with AS, in a large of samples of Chinese Han population using ABI Openarray,thereby contributing to the development of AS. We futher wish to find out the difference in the mechanism of AS pathogenesis between Chinese and Caucasian populations.Meanwhile, our research platform of association study between low frequency variants and disease pathogenesis, can further widen immune genetic research fields,also provide new ideas, open up new prospect for other diseases susceptibility genes researches.

强直性脊柱炎（AS）是一种常见的具有高度遗传性的炎症性关节炎，目前仍无有效的方法来缓解或阻止该病特征性的进展性关节融合。最近，我们前期的研究发现，与欧洲白种高加索AS患者具有显著相关的IL-23R与中国汉族人群AS并没有相关性，但鉴于IL-23R在AS发病机制中的重要作用，可能存在IL-23R罕见或新型变异介导中国汉族人群AS发病。本研究拟采用ABI Openarray平台在中国汉族人群中鉴定与AS相关的IL-23R的罕见或新型变异体，并在该人群中进行大样本验证，以期探明IL-23R罕见或新型变异体与中国汉族人群AS发病机制的相关性，探讨IL-23R完整的遗传特性以及不同种族之间同一疾病发病机制的异同。同时，本研究项目建立低频率变异体与疾病相关性研究的平台，可进一步拓宽免疫遗传学研究领域，为其他疾病易感基因的研究提供新思路,开拓新前景。

结项摘要

基于我们前期的研究结果，我们在中国汉族大样本AS人群中进行了IL-23R罕见遗传变异体研究。我们首先在中国汉族50名AS患者和50名健康对照中，检测了包含IL-23R和其侧翼区域的170kb区域，同时对欧洲高加索白种人中IL-23R与AS呈强相关的30kb区域，在中国汉族650名AS患者以及1300名健康对照中进行检测。最后，在中国汉族846名AS患者和1308名健康对照中运用OpenArray平台对前期检测得到的罕见变异体进行验证。我们检测了1047个IL-23R的变异体，获得了729个dbSNP130基因库中不存在的新型罕见变异体。其中有些IL-23R的新型罕见变异体具有潜在的生物学功能，包括一个非同义SNP Gly149Arg（chr1：67421184 GA）、一个接合区域的变异体、1个5’ UTR和7个3’ UTR变异体。在大样本中国汉族人群中的验证实验中，我们发现Gly149Arg变异体与中国汉族人群AS具最强相关（P=0.0054, OR=0.61）。我们的研究发现了IL-23R罕见变异体与中国汉族人群的相关性，并验证了一个新型罕见变异体Gly149Arg对中国汉族AS发病机制具有重要意义。这些结果不仅提示不同种族同一疾病发病机制的差异，也进一步验证IL-23信号通路在AS发病机制中的重要作用，也为疾病的遗传学研究开辟了新的前景和方向。