基于CRISPRi技术对铜绿假单胞菌PAO1必需基因的研究

批准号:
81960353
项目类别:
地区科学基金项目
资助金额:
35.0 万元
负责人:
黄广涛
依托单位:
学科分类:
烧伤与冻伤
结题年份:
2023
批准年份:
2019
项目状态:
已结题
项目参与者:
黄广涛
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中文摘要
铜绿假单胞菌是烧、创伤感染的重要病原菌,多重耐药铜绿假单胞菌的广泛流行已严重威胁了烧伤患者的生命安全。对铜绿假单胞菌必需基因进行深入研究,不仅有助于了解细菌的生长、毒力等基本特性,也有助于筛选新的抗菌药物靶标。CRISPRi技术是一种高效地研究细菌必需基因的新策略,具有操作简便、通量高、效率高以及可诱导控制等优点。前期,已在铜绿假单胞菌中建立了CRISPRi系统,并用该系统研究两个必需基因。本研究计划首先运用已建立的CRISPRi系统构建一个靶向铜绿假单胞菌PAO1的所有必需基因的CRISPRi文库,建立一个高效PAO1必需基因研究平台。其次,通过高通量的方法,对PAO1的352个必需基因进行表型研究,重点对46个未知功能基因进行深入研究。最后,基于上述结果寻找一些潜在的抗生素作用靶点。本研究的实施可为铜绿假单胞菌必需基因研究和抗生素等靶点筛选提供一个有力工具。
英文摘要
Pesudomonas aeruginosa is one of the important pathogens in burns and trauma ward. With the widely distribution of multi-drug resistance, P. aeruginosa become a big threat to burn patients. Investigation of P. aeruginosa essential genes promote further understanding of bacteria growth, cytotoxicity and so on. It can also help to identify new potential antibiotic targets. With the advantages of easy-to-operation, high thoughput and high efficiency, CRISPRi technology is becoming a new efficient method to study essential genes in bacterium. In previous work, we built a CRISPRi system in P. aeruginosa and the expression of two essential genes ( PA0611 and PA0715) were repressed with this CRIPSRi system. In this study, we first tried to build a CRISPRi library which can target all 352 essential genes of PAO1. With the CRISPRi library, we further investigate the gene function of each essential gene by testing phenotype changes and gene expression changes, especially the 46 function-unknown essential genes. Last, search potential antibiotic targets based on the above results. With the project, we will build a CRISPRi library targeting all essential genes. The success of this study could serve as a powerful tool for essential gene investigation and antibiotic exploration in P. aeruginosa.
期刊论文列表
专著列表
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专利列表
DOI:10.1038/s41598-023-45766-0
发表时间:2023-11-06
期刊:SCIENTIFIC REPORTS
影响因子:4.6
作者:Huang, Siyi;Wang, Xianfeng;Chen, Xinchong;Liu, Xiaoyu;Xu, Qiuqing;Zhang, Lijun;Huang, Guangtao;Wu, Jun
通讯作者:Wu, Jun
DOI:10.1080/21645515.2023.2175519
发表时间:2023-12-31
期刊:Human vaccines & immunotherapeutics
影响因子:4.8
作者:
通讯作者:
DOI:10.3760/cma.j.cn501120-20210930-00343
发表时间:2022
期刊:中华烧伤与创面修复杂志
影响因子:--
作者:黄斯旖;龚雅利;周大鹏;蒋玲丽;向丽娟;陈泽慧;王达利;黄广涛
通讯作者:黄广涛
DOI:--
发表时间:2023
期刊:Scientifc Reports
影响因子:--
作者:Li Huang;Siyi Huang;Lingli Jiang;Jingjie Tan;Xueping Yan;Chunmei Gou;Xinchong Chen;Lijuan Xiang;Dali Wang;Guangtao Huang;Yixin Zhang;Chengliang Deng
通讯作者:Chengliang Deng
CRISPRi-Mediated Gene Suppression Reveals Putative Reverse Transcriptase Gene PA0715 to Be a Global Regulator of Pseudomonas aeruginosa.
CRISPRI介导的基因抑制揭示了假定的逆转录酶基因PA0715是铜绿假单胞菌的全球调节剂。
DOI:10.2147/idr.s384980
发表时间:2022
期刊:Infection and drug resistance
影响因子:3.9
作者:
通讯作者:
CRISPR相关技术在抗铜绿假单胞菌感染中的应用研究
- 批准号:82172238
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:54万元
- 批准年份:2021
- 负责人:黄广涛
- 依托单位:
建立鲍曼不动杆菌噬菌体Abp1小型化基因组的关键技术研究
- 批准号:81801916
- 项目类别:青年科学基金项目
- 资助金额:22.0万元
- 批准年份:2018
- 负责人:黄广涛
- 依托单位:
国内基金
海外基金
