蓝洞海绵共生微生物中聚酮合酶基因的筛选及表达产物研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    41906092
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    D0604.生物海洋学与海洋生物资源
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Sponge-associated microorganism from the blue hole is a treasured resource to be excavated. However, most of them are difficult to cultivate in laboratory. In this project, we will use the metagenomic technology to screen the functional genes and expressed products from sponge-associated microorganism collected in Yongle blue hole. It may avoid the isolation and cultivation of uncultured microorganism. Herein we first built the metagenomic library of sponge-associated microorganism from blue hole. Followed by sequence-based metagenomic approach, the clones containing polyketide synthase genes will be obtained, which will express in E.coli as heterologous host. In addition, the special metabolized target strains will be screened out by principal component analysis. Finally, various analytical and isolation techniques will be utilized to obtain the special chemical components as secondary metabolites with novel structure. The implementation of this project is not only an important way to discover new leading compounds, but also an effective way to exploit the biological resources from marine blue hole.
蓝洞来源的海绵共生微生物是有待挖掘的资源宝库,然而实验室条件下大部分微生物难以纯培养。本项目利用宏基因组技术来筛选永乐龙洞海绵共生微生物中的功能基因和表达产物,避免了微生物分离与培养的难题。首先构建蓝洞海绵共生微生物的宏基因组文库,然后通过序列筛选获得含有聚酮合酶基因的克隆并以大肠杆菌为宿主异源表达,结合主成分分析法化学筛选出代谢产物明显差异的目标菌株,并运用各种分析与分离技术靶向纯化差异性的化学成分,由此得到结构新颖的次级代谢产物。本项目的实施不仅是寻找新型先导化合物的一条重要途径,也是深度挖掘海洋蓝洞生物资源的有效方式。

结项摘要

蓝洞来源的海绵共生微生物是有待挖掘的资源宝库,然而实验室条件下大部分微生物难以纯培养。本项目利用宏基因组技术来筛选永乐龙洞海绵共生微生物中的功能基因和表达产物,避免了微生物分离与培养的难题。首先构建蓝洞海绵共生微生物的宏基因组文库,然后通过序列筛选获得含有聚酮合酶基因的克隆并以大肠杆菌为宿主异源表达,结合主成分分析法化学筛选出代谢产物明显差异的目标菌株,并运用各种分析与分离技术靶向纯化差异性的化学成分,由此得到结构新颖的次级代谢产物。本项目的实施不仅是寻找新型先导化合物的一条重要途径,也是深度挖掘海洋蓝洞生物资源的有效方式。本项目取得了以下主要成果:1)对目标菌株进行系统的化学成分分离,共鉴定出80余个化合物结构,其中新化合物10个,结构类型包括环二肽类和聚酮类。2)对所获得的化合物进行细胞毒、抗菌等活性检测,部分化合物表现出相应的生物活性。3) 本项目的任务指标已完成,目前发表与本课题相关的研究论文 4 篇(标注本基金资助),授权发明专利2项,培养硕士研究生2名。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(2)
Chemical Diversity and Biological Activity of Secondary Metabolites from Soft Coral Genus Sinularia since 2013.
2013年以来软珊瑚属次生代谢物的化学多样性和生物活性
  • DOI:
    10.3390/md19060335
  • 发表时间:
    2021-06-11
  • 期刊:
    Marine drugs
  • 影响因子:
    5.4
  • 作者:
    Yan X;Liu J;Leng X;Ouyang H
  • 通讯作者:
    Ouyang H
Sinuscalide A: An Antiviral Norcembranoid with an 8/8-Fused Carbon Scaffold from the South China Sea Soft Coral Sinularia scabra
Sinuscalide A:一种抗病毒 Norcembranoid,带有来自南海软珊瑚 Sinularia scabra 的 8/8 熔融碳支架
  • DOI:
    10.1021/acs.joc.2c00784
  • 发表时间:
    2022-07-19
  • 期刊:
    JOURNAL OF ORGANIC CHEMISTRY
  • 影响因子:
    3.6
  • 作者:
    Liu,Jing;Tang,Qi;He,Shan
  • 通讯作者:
    He,Shan
Six New Diterpene Glycosides from the Soft Coral Lemnaliabournei.
来自软珊瑚 Lemnalia bournei 的六种新二萜糖苷
  • DOI:
    10.3390/md19060339
  • 发表时间:
    2021-06-14
  • 期刊:
    Marine drugs
  • 影响因子:
    5.4
  • 作者:
    Yan X;Ouyang H;Li T;Shi Y;Wu B;Yan X;He S
  • 通讯作者:
    He S

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其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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