黄瓜（Cucumis sativus L.）是世界范围内广泛种植的蔬菜，也是我国设施生产的重要作物。果实大小是黄瓜重要的外观品质指标，研究黄瓜果实形状、大小的调控机制，可以为黄瓜品质育种提供理论依据。黄瓜短果突变体（short fruit 1，sf1）是隐性单基因自然变异的突变体，除果实变短外，突变体果实表面无瘤、果刺变长、蜡粉变少，雌花柱头和种子腔变大，易裂瓜；短果突变体果皮中叶绿素和类胡萝卜素的含量显著降低，果肉中类胡萝卜素的含量升高，果实的硬度和脆度变大。说明 sf1具有一因多效性。突变体及野生型果实生长发育曲线均呈S形，在花后 9 d左右生长最快，花后 20 d左右达到平台期，但突变体的生长速度显著低于野生型。显微观察结果显示，短果突变体果实细胞在花后 0 d、 9 d、 23 d 均显著大于野生型，说明突变体果实变短是由于细胞数目的减少所致。利用短果突变体和‘chinese long 9930’构建了定位群体，进行sf1的精细定位，筛选了 6720 棵 F2植株，将 sf1 定位到Chr.6 174.3 kb 的区段内，已确定161.7 kb 在两者之间无差异，剩余12.6 kb在测序分析中。转录组测序结果表明，花前6天、2天和花后9天，短果突变体细胞分裂素转导途径中组氨酸磷酸转运蛋白（AHP）的编码基因表达量均显著下调。短果突变体生长素输入载体AUX1和早期响应基因Aux/IAA、GH3和SAUR的表达量上调或下调；花后9天，赤霉素合成途径 5 个基因的表达量上调或下调，赤霉素受体GID1的表达量下调。研究结果为sf1基因的克隆，以及了解黄瓜果实长度、果瘤及蜡粉发育机制打下了基础。